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修饰蛋白质组学
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上海中科新生命生物科技有限公司
中科新生命 · 修饰蛋白质组学平台
生物体中许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质的相关丰度控制,还会被各种时空特意分布、可逆的翻译后修饰调控,因此揭示翻译后修饰的发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。
基于质谱的修饰蛋白质组学<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
蛋白质发生翻译后修饰时其分子质量会发生相应的改变,通过质谱能够精确测定蛋白质或多肽的分子质量。同时,发生翻译后修饰的蛋白质在样本中含量低且动态范围广,所以在质谱检测前需要对发生修饰的蛋白质或肽段进行富集。

修饰蛋白质组学技术方法及应用<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<
| 翻译后修饰 | 修饰位点 | 富集方法 | 生物学功能 |
| 磷酸化 | Ser, Thr, Tyr | 二氧化钛;酪氨酸磷酸化基序抗体 | 信号转导、细胞周期、生长发育及癌症机理等 |
| N-糖基化 | Asn | 凝集素 | 蛋白质折叠、更新以及免疫应答等 |
| 乙酰化 | Lys | 赖氨酸乙酰化基序抗体 | 基因表达调控、细胞凋亡、细胞代谢、蛋白质稳定性以及神经退行性病变等 |
| 泛素化 | Lys | 赖氨酸泛素化基序抗体(K-ε-GG) | 细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA修复以及信号转导等 |
| 甲基化 | Lys, Arg | 赖氨酸/精氨酸 mono/di/tri-甲基化基序抗体 |
染色质结构及转录调控等 |
| 丙酰化 | Lys | 赖氨酸丙酰化基序抗体 | 主要存在于线粒体中,与细胞代谢、表观遗传调控等相关 |
| 丙二酰化 | Lys | 赖氨酸丙二酰化基序抗体 | 主要存在于线粒体中,与细胞代谢、表观遗传调控等相关 |
| 戊二酰化 | Lys | 赖氨酸戊二酰化基序抗体 | 主要存在于线粒体中,与细胞代谢密切相关 |
| 琥珀酰化 | Lys | 赖氨酸琥珀酰化基序抗体 | 主要存在于线粒体和细菌中,与代谢过程密切相 |
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文献和实验蛋白质组作为重要的科研技术,广泛应用于科研中,在每年数万篇论文中发挥重要作用。如何利用组学工具快速切入临床科学问题形成科研思路,为我们的研究提速?可参考以下三种研究思路: 6.1、IF 1-3 分文章:蛋白质组学+差异蛋白 蛋白质组学检测 筛选差异蛋白进行表达量验证 分析差异蛋白,对差异蛋白进行 GO 和 KEGG 分析 6.1.1、案例一,影响因子 IF=2.2 iTRAQ-based quantitative proteomics analysis of immune
University, Research Dr., C118 LSRC, Durham, NC 27710. Phone: (919) 613-8606. Fax: (919) 668-0977. E-mail: hayst001@mc.duke.edu . REFERENCES 蛋白质组相关设备及试剂: 液相HPLC系统 | 毛细管LC系统 | 气相色谱系统 | 自动固相萃取系统 | 联用色谱系统 | 更多... (a) Triple quadrupole. Triple
备注: (1)普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM; (2)细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量,可选择超微量提取方法。根据样本数,可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。
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