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糖基化修饰蛋白质组学
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北京青莲百奥生物科技有限公司
糖基化是多样性最高的蛋白质翻译后修饰形式,也是血液中丰度最高的修饰类型。糖基化蛋白质组学通过对糖基化修饰肽段进行富集和质谱检测,对糖蛋白的丰度、序列、修饰位点、糖链类型进行鉴定,并通过差异分析及功能分析揭示糖基化修饰的影响及调控机制。糖链的组成及连接方式变化导致糖蛋白的高度结构异质性。根据连接糖链与蛋白质的糖苷键的不同,蛋白质的糖基化可分N-糖基化和O-糖基化。
技术原理
亲水相互作用色谱(Hydrophilic interaction liquid chromatography,HILIC)是基于富含多羟基的糖链结构的强亲水特性,采用极性固定相和非极性流动相的色谱技术,利用了糖肽由于糖链的加入而增强的亲水性,糖肽会有较长的保留时间,而使糖肽与非糖基化肽段得以分离的糖肽富集技术。HILIC对不同类型的糖肽没有偏性,且能保持糖链结构的完整性,适合作为完整糖肽结构研究中的富集技术。单一的N-糖蛋白的位点鉴定,蛋白Trypsin酶解成肽段后,HILIC方法富集糖肽,N-糖酰胺酶(PNGase)切除连接在天冬酰胺残基上的糖链(重水),再利用蛋白酶去除PNGase F,质谱分析。复杂样本糖基化蛋白及修饰位点的确定, 是运用的Byonic法, Byonic搜索引擎能够灵敏而全面的对肽和蛋白质进行鉴定, 其配套的PreviewTM软件,可快速评估肽段质量误差、消化特异性以及Byonic后续全面搜索的修改。
糖基化蛋白质组学数据分析流程图
技术特点
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糖基化类型全覆盖
覆盖所有类型的N/O-糖基化修饰,O-糖基化分析技术业内领先
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糖肽信息不遗漏
不进行切糖处理,糖肽同时分析,全面获取糖型、序列、丰度、特异性修饰位点信息
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使用先进的仪器设备
使用具有高分辨率和高灵敏度的质谱仪等设备,通过匹配参考库降低一半以上缺失值,获得更全面、更准确的糖蛋白组动态范围
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依托强大的糖型数据库
自建国内最全可释放糖型数据库,涵盖300种O-糖糖型、796种N-糖糖型,结果全面且准确
技术优势
1.相关领域专业技术支持;
2.经验丰富的实验操作人员;
3.独立研发改进的具有技术领先地位的操作方法;
4.动物植物多种案例经验累积;
5.强大的生物信息分析团队。
应用领域
癌症研究:癌症诊疗标志物、癌症发生发展机制
感染免疫:揭示病原体感染机制,探究机体免疫应答,助力疫苗研发设计
农牧食品:动植物生长发育抗逆、食品组分及品质鉴定、食品安全检测
分析流程
翻译后修饰蛋白质组生信分析流程

结果展示
翻译后修饰蛋白质组结果展示
经典案例
合作文章:靶向N-糖基化和铁死亡可能是PDAC的创新治疗策略
发表期刊:Cell Death and Differentiation
影响因子:13.7
发表单位:北京协和医院
发表时间:2023.07.27
研究揭示了4F2hc的N-糖基化在铁死亡中以前未被认可的功能,并表明双重靶向N-糖基化和铁死亡可能是PDAC的创新治疗策略。

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- 作者
- 内容
- 询问日期
文献和实验[1] Ma H, Chen X, Mo S, et al. Targeting N-glycosylation of 4F2hc mediated by glycosyltransferase B3GNT3 sensitizes ferroptosis of pancreatic ductal adenocarcinoma[J]. Cell Death & Differentiation, 2023, 30(8): 1988-2004.
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