
MassArray SNP 基因分型技术服务
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- Acebiox 为Agena公司中国区MassArray SNP基因分型技术服务授权服务商
- 2026年01月19日
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- 文献和实验
- 技术资料
- 服务名称:
MassArray SNP 基因分型技术服务
- 提供商:
Acebiox
- 规格:
根据检测基因和位点数量的不同,价格有所不同
服务简介
MassARRAYSNP基因分型技术,是由美国Agena Bioscience, Inc.(原Sequenom Bioscience Division)公司开发的基于飞行质谱的分型技术,Acebiox为该公司(Agena Certified Service Provider Certificate)。
该技术通过PCR扩增跨越SNP位点的DNA序列,然后应用单一延伸引物(extension primer)扩增PCR产物,确保延伸引物只延长一个碱基。延伸产物用飞行质谱(TOF, time of flight)进行分析,根据一个碱基的分子量差别对SNP进行分型,也可做SNP位点等位基因频率计算。MassARRAY SNP基因型分析可以进行多重SNP分型,即一个反应可同时分型多个SNP位点。该技术分析准确,在分析数十上百个SNP时具有价格优势。
技术原理
MassARRAY飞行质谱检测系统基本原理为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 技术。将制备好的样品与芯片基质共结晶,将该晶体放入质谱仪的真空管,而后用瞬时纳秒 (10-9s) 强激光激发,由于基质分子经辐射所吸收的能量,导致能量蓄积并迅速产热,从而使基质晶体升华,核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子,产生的离子多为单电荷离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能,进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率加以分离,在真空小管中飞行到达检测器,飞行时间与离子质量成正比。MALDI产生的离子用飞行时间(Time-of-Flight,TOF)检测器来检测,离子质量越小,飞行时间越短。理论上讲,只要飞行管长度足够,TOF 检测器可检测分子的质量数是没有上限的。
图1 飞行时间质谱检测物质分子量的原理
应用领域
MassARRAY SNP基因型分析在生物科学、医学、农业研究和应用等多个领域具有非常好的应用前景,为全世界的科学家们提供优质的解决方案,获得了瞩目的进展。以下是一些代表文献:
- 肿瘤发病及其相关SNP研究和肿瘤的诊断
- 糖尿病、心脏病、帕金森、银屑病等各种重要疾病
- 流行病学和病源微生物检测
- 重要经济和品质性状筛选
技术特点
高准确性:采用尖端的飞行质谱的分型技术,能准确检测出单个碱基的差异,分析精准。
高灵敏度:检测窗口内,能被检测任何pmol级的物质。
高通量:一张芯片可对384个样本进行多重检测,每个体系最多实现36重反应。
灵活性:几秒钟就能检测一个反应孔,每天可完成几个乃至上万个反应。
无污染:在实验过程中,反应体系始终在同一个试管内进行,无多次转移,减少污染的概率。
高效性:最快2周即可提供完整的实验报告。
广泛性:超过2000篇SCI文章,包括Nature, Science等顶尖杂志。
江苏楚天生物为您提供以下技术服务,也可根据客户需求定制技术服务:
| 产品名称 | 用途 | 检测位点数 |
| iPLEX® ADME PGx Pro Panel | 药物个性化治疗 | 36个药物代谢关键基因的184个SNP及部分CNV |
| LungCarta™ Panel | 肺癌检测 | 检测26个肺癌相关致癌基因和抑癌基因的214个突变位点 |
| OncoCarta™ Panel 系列V1.0 | 肿瘤检测 | 检测19个致癌基因,238个突变位点 |
| OncoFOCUS™ Panel | 结直肠癌 | BRAF 19个、EGFR 127个、KRAS 38个、NRAS20个突变 |
| MelaCarta Panel | 黑色素瘤检测 | 检测黑色素瘤相关的20个基因的70多种突变 |
| Hemo ID™ Blood Group 系列 | 稀有血型鉴定 | 上百种稀有血型系统多态性检测 |
| ALK/RET/ROS1 Panel | ALK/RET/ROS1 | 检测肿瘤中的ALK/RET/ROS1的已知或未知易位 |
设备仪器
| 分型方法 | 设备仪器 |
| MassARRAY | MassARRAY Genetic Analysis System |
图2 MassARRAY Genetic Analysis System平台示意图
样品类型
所有类型样品必须用冰袋寄至公司。冰块应足量,以确保样品寄至公司时,冰块未完全融化。
- a)组织样品(需提供≥100mg组织。)
- b)体外培养细胞(需提供≥106个细胞。)
- c)基因组DNA (需提供≥5μg 基因组DNA)
- d)全血(需提供≥2mL全血)
价格
SNP分型(或基因突变检测)的费用根据需要分型的SNP位点,数目以及样品数量的不同而制定。
提交数据
分型结果示例。以下是MassARRAYSNP基因分型飞行质谱分析图:
图3 MassARRAYSNP基因分型飞行质谱部分分析图
如需要,可提供所使用方法的原始数据。
实验周期
10-30个工作日
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文献和实验确定 SNP 位点。近年来随着复杂性疾病研究的深入,以及可利用的基因组数据的增加,基于各种原理的 SNP 芯片反应被开发出来,以适应不同目的、规模和条件的基因分型,那么市面上现在常见的基因芯片 Illumina SNP 芯片分型平台(包括 Infinium®技术和 GoldenGate®技术)和 Affymetrix 基因分型平台(Affymetrix GeneTitan®技术),这两大公司的基因分型平台是目前应用最为广泛的基因分型平台,适用于大样本不同标记密度的快速基因分型。这里由于商品化芯片
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