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MssI (PmeI)

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  • Thermo scientific -fermentas
  • ER1341
  • 2025年09月30日
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      大量

    • - FastDigest®限制酶
    • - 推荐的缓冲液 : B
    • - 孵育温度37°C
    • - 连接效率90%
    • - 热失活65°C, 20 min
    • - 基因组级别
    • - 蓝/白鉴定
    • - LO合格
    Catalog# Size, concentration Supplied with: Certificate of Analysis MSDS
    10X Buffer B 10X Buffer Tango™
    ER1341 250 u (5 u/µl) 1.00 ml 1.00 ml ER1341
    ER1342 1250 u (5 u/µl) 1.00 ml 1.00 ml ER1342
    Reaction conditions
    Recommended buffer for 100% activity Optimal temperature Enzyme activity in Fermentas buffers, % Tango™ buffer for double digestion
    B (blue)
    1X
    G (green)
    1X
    O (orange)
    1X
    R (red)
    1X
    Tango™ (yellow)
    1X / 2X
    B 37°C 100 0-20 0-20 0-20 20-50 0-20 1X

    Lambda DNA
    0.7%琼脂糖
    2 切割位点

    100%酶活性的反应条件
    1X 缓冲液B:
    10 mM Tris-HCl (pH 7.5, 37°C), 10 mM MgCl2 , 0.1 mg/ml BSA。
    37°C酶切。

    保存缓冲液
    MssI保存在:
    10 mM Tris-HCl (pH 7.5, 25°C), 50 mM KCl, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 0.2 mg/ml BSA和50% (v/v)甘油。

    连接和重新酶切
    10倍MssI过量酶切后,超过90%的酶切产物可连接(连接体系:20-40 u T4 DNA连接酶/1 μg DNA,10% PEG),超过90%的连接产物能重新酶切。

    琼脂糖包埋DNA酶切
    至少需要5 unit限制酶才能在16小时内完全切割1 µg琼脂糖包埋的λ DNA。

    商业化同裂酶
    采用REsearch™软件寻找同功酶。

    双酶切
    采用DoubleDigest™软件确定双酶切的最佳条件。

    甲基化影响
    Dam: 无重叠 – 不影响。
    Dcm: 无重叠 – 不影响。
    CpG: 可能重叠 – 不影响。
    EcoKI: 可能重叠 – 阻止酶切。
    EcoBI: 无重叠 – 不影响。

    Methylation type Sequence Cleavage effect
    CpG

    5'...GTTTAAAm5C G ...3'
    3'...CAAATTT Gm5C ...5'

    不阻止酶切
    CpG

    5'...m5C G TTTAAAm5C G ...3'
    3'... Gm5C AAATTT Gm5C ...5'

    不阻止酶切
    EcoKI (AAC(N)6 GTGC)

    5'...GTTTAAm6AC(N)6 G TGC...3'
    3'...CAAATT TG(N)6 Cm6ACG...5'

    阻止酶切
    Cleavage efficiency close to the termini of PCR fragments
    bp from the recognition site to fragment end
    1 2 3 4 5
    20-50 50-100
    Number of recognition sites in DNA molecules
    Lambda ΦX174 M13mp18/19 pBR322 puc18/19 pUC57
    2 0 0 0 0 0
    pTZ19R/U pTZ57R pBluescriptIIKS(-/+) pBluescriptIISK(-/+) pACYC177 pACYC184
    0 0 0 0 0 0

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    相关实验
    • Construction and Characterization of Adenovirus Vectors

      using standard cloning procedures. Once obtained, the shuttle vector is linearized by digestion with PmeI and cotransformed into BJ5183 cells with the AdEasy backbone vector. After small-scale purification of DNA from BJ5183 cells

    • 寡核苷酸微阵列法

      寡核苷酸微阵列法       该方法以已知CpG岛的序列分别设计能够与甲基 化和非甲基化CpG岛片段杂交的寡核苷酸探针微阵列,用于同时分析众多已知CpG位点的甲基化状态。样品基本处理步骤如下:DNA经MssI(酶切位点是GTTT)消化后用亚硫酸氢钠处理,再在酶切位点的粘性末端加上接头,用通用引物进行PCR扩增、荧光素标记、微阵列杂交及扫描。该方法的优点是能直接得到目标CpG岛的甲基化信息。缺点是有这种合成的芯片容量不是很大,目前只能检测约80个CpG岛的甲基化状态

    • 寻找原核表达载体

      ,7 PmeI GTTT/AAAC BbeI GGCGC/C PmlI CAC/GTG BbvCI CCTCAGC,-5,-2 PpiI GAA***NNNCTC,13,8 BclI T/GATCA Ppu10I A/TGCAT BfrBI ATG/CAT PpuMI RG/GWCCY BglI GC***NN/NGGC PshAI GA***/NNGTC Bpu10I CCTNAGC,-5,-2 PsiI TTA/TAA BsaAI YAC/GTR PspOMI G/GGCCC BsaHI

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