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FastDigest® AleI (OliI)

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  • Thermo scientific -fermentas
  • FD1634
  • 2025年11月07日
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      大量

    • - 推荐的缓冲液 : FastDigest®缓冲液
    • - 孵育温度37°C
    • - 连接效率80%
    • - CpG甲基化重叠可能影响DNA切割
    • - 热失活65°C, 5 min
    • - 蓝/白鉴定
    • - LO合格
    Catalog# Size, concentration Supplied with: Certificate of Analysis MSDS
    10X FastDigest® Buffer 10X FastDigest® Green Buffer
    FD1634 20 µl (20 react.) 1.00 ml 1.00 ml FD1634
    Reaction conditions
    Reaction temperature Digestion time with 1µl of FastDigest® enzyme, min bp from end of DNA required for complete digestion Thermal inactivation Incubation time without star activity, hours
    Lambda, 1µg/20µl Plasmid DNA, 1µg/20µl PCR product, ~0.2µg/30µl Genomic DNA, 1µg/10µl
    37°C 5
    (phiX174 DNA)
    5 10 5 3 65°C, 5 min 6

    phiX174 DNA
    1.0%琼脂糖
    1 切割位点

    配方
    1 µl (1 FDU)是指在37°C,1X FastDigest® 缓冲液中5分钟内酶切1 µg ΦX174 DNA所需的酶量。

    推荐反应条件
    1X FastDigest®缓冲液或 1X FastDigest® Green 缓冲液,37°C。
    1 µl FastDigest® AleI (OliI)可在
    – 5分钟内酶切1 µg phiX174 DNA;
    – 5分钟内酶切1 µg质粒DNA;
    – 10分钟内酶切0.2 µg PCR扩增产物;
    – 5分钟内酶切1 µg基因组DNA或30分钟内酶切5 µg基因组DNA。

    商业化同裂酶
    采用REsearch™软件寻找同功酶。

    甲基化影响
    Dam: 无重叠 – 不影响。
    Dcm: 无重叠 – 不影响。
    CpG: 可能重叠 – 部分影响。
    EcoKI: 可能重叠 – 阻止酶切。
    EcoBI: 可能重叠 – 阻止酶切。

    Methylation type Sequence Cleavage effect
    CpG

    5'...CAm5C G NNm5C G TG...3'
    3'...GT Gm5C NN Gm5C AC...5'

    部分影响
    CpG

    5'...CAm5C G NNNGTG...3'
    3'...GT Gm5C NNNCAC...5'

    不阻止酶切
    EcoBI (TGA(N)8 TGCT)

    5'...TGm6A(N)4 CACG TGCT...3'
    3'...AC T(N)4 GTGCm6ACGA...5'

    阻止酶切
    EcoKI (AAC(N)6 GTGC)

    5'...Am6ACAC(N)4 G TGC...3'
    3'...T TGTG(N)4 Cm6ACG...5'

    阻止酶切
    Number of recognition sites in DNA molecules
    Lambda ΦX174 M13mp18/19 pBR322 puc18/19 pUC57
    20 1 0 0 0 0
    pTZ19R/U pTZ57R pBluescriptIIKS(-/+) pBluescriptIISK(-/+) pACYC177 pACYC184
    0 0 1 1 0 0

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