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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
-20度
- 保质期:
一年
- 英文名:
Hieff Clone Zero TOPO-Blunt Cloning Kit
- 库存:
大量
- 供应商:
翌圣生物科技(上海)股份有限公司
- 规格:
20T
本试剂盒是利用拓扑异构酶(Topoisomerase)高效快速连接DNA片段的原理进一步研发而成,与传统的T4连接酶相比,具有以下优势:1)快速,仅需1-5分钟即可完成连接反应。2)高效,无自连现象,阳性克隆率接近100%,无需设置蓝白斑筛选;3)操作简单,从连接到涂板仅需15-20 min。操作过程省去冰浴、热激和1 h复苏。4)可连接长达5 kb目的产物。
产品用途
平末端PCR产物的快速克隆。
克隆后PCR产物的快速测序(使用M13F/M13R引物)。
产品组分
| 组分编号 |
组分名称 |
产品货号(规格) |
| 10909ES20(20 T) |
||
| 10909-A |
pESI-Blunt vector (30 ng/μL) |
20 μL |
| 10909-B |
1 kb control insert (40 ng/μL) |
5 μL |
| 10909-C |
10×Enhancer |
20 μL |
运输和保存方法
冰袋运输。-20℃保存,避免反复冻融。有效期一年。
注意事项
1) 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
2) 本产品仅作科研用途!
使用方法
一、Control DNA 片段的克隆实验
1)在无菌微量离心管中配制下列DNA溶液,以10 μL为例。
| 组分 |
用量 |
| 10 ´ Enhancer |
1 μL |
| 1 kb control insert (40 ng/μL) |
1 μL |
| pESI-Blunt vector (30 ng/μL) |
1 μL |
| ddH2O |
7 μL |
2)混匀上述体系。于室温(20-30℃)反应5 min。
【注】:连接反应不可于冰上进行。室温下孵育时,不建议您超过5分钟;但是,如果您的PCR产物浓度较低或者您要克隆一个长片段,则可以适当延长孵育时间。
3)连接产物可直接转化或于-20℃保存。
4)全量10 μL加入100 μL感受态细胞,轻轻混匀,室温放置5 min。
【注】:a)也可取5 μL连接液,加入50 μL感受态细胞中(加入体积不超过感受态细胞体积的1/10)。
b)通常使用商品化的感受态细胞不需要冰浴和热休克、室温放置5 min便可获得足够多转化子,如果感受态细胞效率较低时,可以按照冰浴热激的标准程序进行。
5)加300-500 μL LB或者SOC培养基(不含抗生素),37℃ 180 rpm振荡培养10 min。
6)取200 μL菌液涂板(含氨苄抗性的LB或SOC固体培养基),培养过夜(如果预计转化子少,为得到较多克隆,4000 rpm 离心1 min,吸弃掉部分上清,保留100 μL,轻弹悬浮菌体,取全部菌液涂板)。
二、 一般DNA片段的克隆实验
所插入片段为平末端产物,利用高保真酶(如Canace高保真酶,Yeasen Cat#10135)扩增得到的产物如无非特异性条带、引物二聚体可直接进行连接反应。
否则建议胶回收后使用。
【注】:a、PCR产物不能磷酸化。
b、如扩增模板为质粒,模板质粒会在后续实验中引起假阳性,因此推荐PCR产物进行胶回收后连接。
1)按照下表配制连接体系(以10μL为例)
| 组分 |
用量 |
| 10 ´ Enhancer |
1 μL |
| pESI-Blunt vector (30 ng/μL) |
1 μL |
| 插入片段 |
0.5-8 μL |
| ddH2O |
To 10 μL |
【注】:a)可根据具体实验情况按照上述比例调整反应体系。
b)不同的插入片段所用量参考下表:
| 插入片段大小 |
推荐用量 |
| 0.1-1 kb |
20-50 ng |
| 1-2 kb |
50-100 ng |
| 2-5 kb |
100-200 ng |
2)混匀上述体系。于室温(20-30℃)反应5 min。
【注】:连接反应不可于冰上进行。室温下孵育时,不建议您超过5分钟;但是,如果您的PCR产物浓度较低或者您要克隆一个长片段,则可以适当延长孵育时间。
3)全量10 μL加入100 μL感受态细胞,轻轻混匀,室温放置5 min。
【注】:a)也可取5 μL连接液,加入50 μL感受态细胞中(加入体积不超过感受态细胞体积的1/10)。
b)通常使用商品化的感受态细胞不需要冰浴和热休克、室温放置5 min便可获得足够多转化子,如果感受态细胞效率较低时,可以按照冰浴热激的标准程序进行。
4)加300-500 μL LB或者SOC培养基(不含抗生素),37℃ 180 rpm振荡培养10 min。
【注】:通常商品化的感受态细胞不超过2 kb插入片段情况下,10 min复苏可以得到足够多转化子,如果感受态效率低或者插入片段长转化子少的情况下可以提高复苏时间到30-60 min以得到更多的转化子。
5) 取200 μL菌液涂板(含氨苄抗性的LB或SOC固体培养基),培养过夜(如果预计转化子少,为得到较多克隆,4000 rpm 离心1 min,吸弃掉部分上清,保留100 μL,轻弹悬浮菌体,取全部菌液涂板)。
6)转化子的筛选鉴定
a)菌落/菌液PCR鉴定;
b)质粒大小鉴定:挑取单克隆,抽提质粒后可根据质粒大小进行鉴定。
c)酶切鉴定:根据克隆实验设计,选择合适的限制性内切酶进行鉴定。
d) 测序分析:可选测序引物序列如下:
M13F:TGTAAAACGACGGCCAGT
M13R:CAGGAAACAGCTATGACC
【注】:本制品阳性率相当高,一般情况下,阳性克隆率接近100%,只要是长出来的菌落正常(不是污染的杂菌,转化子数量也不算太少),基本就是阳性克隆,因此插入片段不超过2-3 kb的情况下可以不用鉴定直接挑1-2个菌去测序。
pESI-blunt vector 图谱


pESI-blunt vector sequence
ORIGIN
1 cttgaagtgg tggcctaact acggctacac tagaagaaca gtatttggta tctgcgctct
61 gctgaagcca gttacctcgg aaaaagagtt ggtagctctt gatccggcaa acaaaccacc
121 gctggtagcg gtggtttttt tgtttgcaag cagcagatta cgcgcagaaa aaaaggatct
181 caagaagatc ctttgatttt ctaccgaaga aaggcccacc cgtgaaggtg agccagtgag
241 ttgattgtgt aaaacgacgg ccagtgtctg aggctcgctg cagtcctgaa gcttgatatc
301 gaattcgcgt gtcgccctta agggcgacac gcgaattcga tatcgcggcc gcctgcagtc
361 aatactgacg atggtcatag ctgtttcctg tccatagcag aaagtcaaaa gcctccgacc
421 ggaggctttt gacttgatcg gcacgtaaga ggttccaact ttcaccataa tgaaataaga
481 tcactaccgg gcgtattttt tgagttatcg agattttcag gagctaagga agctaaaatg
541 agtattcaac atttccgtgt cgcccttatt cccttttttg cggcattttg ccttcctgtt
601 tttgctcacc cagaaacgct ggtgaaagta aaagatgctg aagatcagtt gggtgcacga
661 gtgggttaca tcgaactgga tctcaacagc ggtaagatcc ttgagagttt tcgccccgaa
721 gaacgttttc caatgatgag cacttttaaa gttctgctat gtggcgcggt attatcccgt
781 attgacgccg ggcaagagca actcggtcgc cgcatacact attctcagaa tgacttggtt
841 gagtactcac cagtcacaga aaagcatctt acggatggca tgacagtaag agaattatgc
901 agtgctgcca taaccatgag tgataacact gcggccaact tacttctgac aacgatcgga
961 ggaccgaagg agctaaccgc ttttttgcac aacatggggg atcatgtaac tcgccttgat
1021 cgttgggaac cggagctgaa tgaagccata ccaaacgacg agcgtgacac cacgatgcct
1081 gtagcaatgg caacaacgtt gcgcaaacta ttaactggcg aactacttac tctagcttcc
1141 cggcaacaat taatagactg gatggaggcg gataaagttg caggaccact tctgcgctcg
1201 gcccttccgg ctggctggtt tattgctgat aaatctggag ccggtgagcg tgggtctcgc
1261 ggtatcattg cagcactggg gccagatggt aagccctccc gtatcgtagt tatctacacg
1321 acggggagtc aggcaactat ggatgaacga aatagacaga tcgctgagat aggtgcctca
1381 ctgattaagc attggtaatg agggcccaaa tgtaatcacc tggctcacct tcgggtgggc
1441 ctttctgcgt tgctggcgtt tttccatagg ctccgccccc ctgacgagca tcacaaaaat
1501 cgatgctcaa gtcagaggtg gcgaaacccg acaggactat aaagatacca ggcgtttccc
1561 cctggaagct ccctcgtgcg ctctcctgtt ccgaccctgc cgcttaccgg atacctgtcc
1621 gcctttctcc cttcgggaag cgtggcgctt tctcatagct cacgctgtag gtatctcagt
1681 tcggtgtagg tcgttcgctc caagctgggc tgtgtgcacg aaccccccgt tcagcccgac
1741 cgctgcgcct tatccggtaa ctatcgtctt gagtccaacc cggtaagaca cgacttatcg
1801 ccactggcag cagccactgg taacaggatt agcagagcga ggtatgtagg cggtgctaca
1861 gagtt
//
【注】:黄底为多克隆酶切位点序列
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文献和实验[2] Tao R, Wang Y, Hu Y, et al. WT-PE: Prime editing with nuclease wild-type Cas9 enables versatile large-scale genome editing. Signal Transduct Target Ther. 2022;7(1):108. Published 2022 Apr 20. doi:10.1038/s41392-022-00936-w(IF:18.187)
[3] Yang S, Wang N, Kimani S, et al. Characterization of Terpene synthase variation in flowers of wild aquilegia species from Northeastern Asia [published online ahead of print, 2022 Jan 18]. Hortic Res. 2022;9:uhab020. doi:10.1093/hr/uhab020(IF:6.793)
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Blunt PCR克隆乃利用传统T4连接酶方法,但载体和Topo平端的一样,含ccdB基因,所以同样可降低菌落背景,易于筛选。 表10 PCR克隆试剂盒的选择 Amplification Enzyme Application of Cloned PCR Product Ligation Method Product
,ccdB基因的表达蛋白,会破坏细菌的DNA gyrase,造成细菌染色体的降解导致细菌死亡。如果有插入片断,则ccdB基因表达受到阻碍,所以细胞可生长。这样可以把高背景的缺点改善,节省筛选的时间。Topo平端克隆 与Topo TA方法一样,操作简单快速。 平端PCR 克隆 方法(Zero Blunt PCR Cloning Kit) Zero Blunt PCR 克隆 乃利用传统T4连接酶方法,但载体
),需要用有特定甲基化背景(dam-/dcm-)菌株扩增得到的质粒才能切割,等等,(此处省略若干连载)。 酶界之“求同存异,合作共赢” 只要“切削补”得到平末端,都能凑一起 终于盘算好能让目标片段和载体牵手了,你还得要检查一下这一轮操作插入载体后,在目标基因 ATG 前面会不会意外引入终止密码、或者不同编码框的 ATG ——提前终止或者密码“三观不一致”都可能影响后续的表达。筛选时需要有可靠的方法来验证目标片段大小是否正确、“正向插入”还是“反向插入”。有时还需要考虑 ATG 距离启动子后 SD











