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    高通量测序服务—RNA免疫共沉淀测序(RIP seq)

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    高通量测序服务—RNA免疫共沉淀测序(RIP seq)

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    • 商家诚信度 
    • 入驻年限  11年
    • 中国广州· 广州科学城科学大道182号· 创新大厦C3栋13-14层

    站内推广

    • 提供商: 锐博生物

      技术简介

              RNA Immunoprecipitation (RIP) 是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。这种技术运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析。
       

              锐博生物推出RNA免疫共沉淀测序(RIP seq),将RIP技术结合新一代测序技术,应用于癌症以及其它疾病整体水平的RNA变化检测。

              RNA免疫共沉淀测序(RIP seq)实验原理见图1。

      图1 RIP seq原理

      技术特点

      全转录组覆盖:与RIP芯片相比,可在全转录组范围对蛋白结合位点进行筛选与鉴定

      高灵敏度:每个样本可获得数百万条的序列标签,可发现研究转录组上稀有的蛋白结合位点

      高精确率:可获得高水平的信噪比数据,准确区分真实事件与噪音,精确定位蛋白结合位点

      重复性好:深度测序保证了检测随机性,可不需技术重复

      服务流程


       

      生物信息学分析内容
       

      标准信息分析

      1. 去除接头序列及低质量reads的处理

      2. 测序质量评估

      3. 序列比对

      4. 测序reads全转录组分布图

      5. 结合峰鉴定

      6. 结合峰基因元件分布

      7. 差异结合峰检测

      8. 差异结合峰相关基因GO功能富集分析

      9. 差异结合峰相关基因KEGG生物通路富集分析

      定制化信息分析

      1. 结合峰的motif检测

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