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- #1001652 (16 rxn) #1001651 (96 rxn)
- 中国南京
- 2025年12月31日
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- 详细信息
- 技术资料
- 库存：
1
- 英文名：
Ext-RNA Control Panel
- 供应商：
纳昂达（南京）
- 保存条件：
-20℃
ERCC（External RNA Controls Consortium）是由美国国家标准与技术研究院（National Institute of Standards and Technology，NIST）发起开发的序列和浓度己知的外源标准 RNA 转录本。这些转录本序列主要从随机特异序列中生成，在包括人类在内的多个模式生物数据库中未找到同源序列。
Ext-RNA Control Panel v1.0 靶向 92 条ERCC转录本中的 24 条，长度范围为：273-2,022 bp；其在 ERCC RNA Spike-In Mix 1（Life Technologies，Part no. 4456740）中的浓度范围为：0.014305-937.5 attomol/μl。此 24 条 ERCC 可为 RNA 表达定量提供参考。
产品列表
|
ERCC ID |
浓度 (attomol/μL） |
长度 (bp) |
ERCC ID |
浓度 (attomol/μL) |
长度 (bp) |
ERCC ID |
浓度 (attomol/μL) |
长度 (bp) |
|
ERCC-00057 |
0.014305 |
1,021 |
ERCC-00058 |
1.831055 |
1,136 |
ERCC-00170 |
14.64844 |
525 |
|
ERCC-00017 |
0.114441 |
1,136 |
ERCC-00077 |
3.662109 |
743 |
ERCC-00084 |
29.29688 |
994 |
|
ERCC-00016 |
0.228882 |
844 |
ERCC-00150 |
3.662109 |
273 |
ERCC-00025 |
58.59375 |
1,994 |
|
ERCC-00156 |
0.457764 |
494 |
ERCC-00034 |
7.324219 |
844 |
ERCC-00071 |
58.59375 |
642 |
|
ERCC-00158 |
0.457764 |
1,027 |
ERCC-00085 |
7.324219 |
1,019 |
ERCC-00112 |
117.1875 |
1,136 |
|
ERCC-00109 |
0.915527 |
536 |
ERCC-00157 |
7.324219 |
1,019 |
ERCC-00092 |
234.375 |
1,124 |
|
ERCC-00137 |
0.915527 |
537 |
ERCC-00059 |
14.64844 |
1,023 |
ERCC-00042 |
468.75 |
1,023 |
|
ERCC-00033 |
1.831055 |
2,022 |
ERCC-00126 |
14.64844 |
1,118 |
ERCC-00108 |
937.5 |
1,022 |
实验流程
图1. RNA 靶向捕获流程。
产品表现
ERCC 标准曲线
图2. ERCC 标准曲线。建库时添加 ERCC 标准品，在 RNA-Seq 或 RNACap 中，ERCC RPKM（Reads Per Kilobase per Million mapped reads）与样本浓度间呈现良好的线性关系；RNACap 与 RNA-seq 相比表现出明显的靶基因富集。
对 ERCC 基因的覆盖分析
图3. ERCC 基因覆盖分析，不同建库方式对 ERCC 基因的覆盖无显著差异，RNACap 未表现出明显偏好性。 RNACap（蓝色）：将总 RNA 反转成双链 DNA 后进行靶向建库测序；rRNA-depleted（橙色）：对总 RNA 进行去除 rRNA 处理，反转成双链 DNA 后进行建库测序；Total RNA（深蓝）：直接将总 RNA 反转成双链 DNA 并进行建库测序。
Spike-in 至不同 panel 中的重复性表现
图4. Ext-RNA Control Panel v1.0 Spike-in 至不同 panel 后的重复性表现。将 Ext-RNA Control Panel v1.0 Spike-in 至 NanOnco Plus Panel v2.0（大 panel）或 NanOnCT Panel v1.0（小 panel），捕获测序后对二者的 ERCC RPKM 的 log 值进行相关性分析。
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
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产品 |
货号 |
|
Ext-RNA Control Panel v1.0, 16 rxn |
1001652 |
|
Ext-RNA Control Panel v1.0, 96 rxn |
1001651 |
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
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