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- #1001652 (16 rxn) #1001651 (96 rxn)
- 中国南京
- 2026年01月24日
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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存：
1
- 英文名：
Ext-RNA Control Panel
- 供应商：
纳昂达（南京）
- 保存条件：
-20℃
ERCC（External RNA Controls Consortium）是由美国国家标准与技术研究院（National Institute of Standards and Technology，NIST）发起开发的序列和浓度己知的外源标准 RNA 转录本。这些转录本序列主要从随机特异序列中生成，在包括人类在内的多个模式生物数据库中未找到同源序列。
Ext-RNA Control Panel v1.0 靶向 92 条ERCC转录本中的 24 条，长度范围为：273-2,022 bp；其在 ERCC RNA Spike-In Mix 1（Life Technologies，Part no. 4456740）中的浓度范围为：0.014305-937.5 attomol/μl。此 24 条 ERCC 可为 RNA 表达定量提供参考。
产品列表
|
ERCC ID |
浓度 (attomol/μL） |
长度 (bp) |
ERCC ID |
浓度 (attomol/μL) |
长度 (bp) |
ERCC ID |
浓度 (attomol/μL) |
长度 (bp) |
|
ERCC-00057 |
0.014305 |
1,021 |
ERCC-00058 |
1.831055 |
1,136 |
ERCC-00170 |
14.64844 |
525 |
|
ERCC-00017 |
0.114441 |
1,136 |
ERCC-00077 |
3.662109 |
743 |
ERCC-00084 |
29.29688 |
994 |
|
ERCC-00016 |
0.228882 |
844 |
ERCC-00150 |
3.662109 |
273 |
ERCC-00025 |
58.59375 |
1,994 |
|
ERCC-00156 |
0.457764 |
494 |
ERCC-00034 |
7.324219 |
844 |
ERCC-00071 |
58.59375 |
642 |
|
ERCC-00158 |
0.457764 |
1,027 |
ERCC-00085 |
7.324219 |
1,019 |
ERCC-00112 |
117.1875 |
1,136 |
|
ERCC-00109 |
0.915527 |
536 |
ERCC-00157 |
7.324219 |
1,019 |
ERCC-00092 |
234.375 |
1,124 |
|
ERCC-00137 |
0.915527 |
537 |
ERCC-00059 |
14.64844 |
1,023 |
ERCC-00042 |
468.75 |
1,023 |
|
ERCC-00033 |
1.831055 |
2,022 |
ERCC-00126 |
14.64844 |
1,118 |
ERCC-00108 |
937.5 |
1,022 |
实验流程
图1. RNA 靶向捕获流程。
产品表现
ERCC 标准曲线
图2. ERCC 标准曲线。建库时添加 ERCC 标准品，在 RNA-Seq 或 RNACap 中，ERCC RPKM（Reads Per Kilobase per Million mapped reads）与样本浓度间呈现良好的线性关系；RNACap 与 RNA-seq 相比表现出明显的靶基因富集。
对 ERCC 基因的覆盖分析
图3. ERCC 基因覆盖分析，不同建库方式对 ERCC 基因的覆盖无显著差异，RNACap 未表现出明显偏好性。 RNACap（蓝色）：将总 RNA 反转成双链 DNA 后进行靶向建库测序；rRNA-depleted（橙色）：对总 RNA 进行去除 rRNA 处理，反转成双链 DNA 后进行建库测序；Total RNA（深蓝）：直接将总 RNA 反转成双链 DNA 并进行建库测序。
Spike-in 至不同 panel 中的重复性表现
图4. Ext-RNA Control Panel v1.0 Spike-in 至不同 panel 后的重复性表现。将 Ext-RNA Control Panel v1.0 Spike-in 至 NanOnco Plus Panel v2.0（大 panel）或 NanOnCT Panel v1.0（小 panel），捕获测序后对二者的 ERCC RPKM 的 log 值进行相关性分析。
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
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产品 |
货号 |
|
Ext-RNA Control Panel v1.0, 16 rxn |
1001652 |
|
Ext-RNA Control Panel v1.0, 96 rxn |
1001651 |
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
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文献和实验Fresh Frozen Tissue: RNA Extraction and Quality Control
, in the range of millimeters or milligrams, it is important to implement quality control procedures adapted to minute the amounts of tissue. To this end, we here describe RNA extraction from one or a few frozen tissue sections and subsequent analysis
of a triplex RT-qPCR for the simultaneous detection of bluetongue viral RNA, an internal control and an external control. The primer and probe sequences of the BTV RT-qPCR were taken from Toussaint et al. (J Virol Methods 140:115–123, 2007
localization of mRNA and protein at the tissue and cellular levels. This is especially convenient for gene expression analysis in hard tissues, such as seeds that are often difficult to section. Seed RNA or protein can be transferred onto a suitable membrane
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