CUT&Tag 试剂盒 CUT

&Tag-IT™ Assay Kit 53160/53165/53171/53172

CUT&Tag 试剂盒 CUT

&Tag-IT™ Assay Kit 53160/53165/53171/53172

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品牌 Active Motif
货号 53160/53165/53171/53172
产地美国
更新日期 2024年08月19日

上海艾跃（Active Motif）生物科技有限公司

品牌商

8 年钻石会员

库存：
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英文名：
CUT&Tag-IT™ Assay Kit
保质期：
6个月
供应商：
Active Motif
保存条件：
不同组分对应不同保存温度
规格：
16 rxns

CUT&Tag-IT™ Assay Kit 概述

CUT&Tag是一种新的实验方法，用于研究组蛋白修饰和一些转录因子的基因组定位，从而揭示蛋白与DNA之间的相互作用或者鉴定感兴趣蛋白的DNA结合位点。

MNase-Seq和ATAC-Seq是把开放染色质作为研究对象，因此相当依赖于染色质的开放性。但是不同于这两个方法，CUT&Tag利用基于抗体的酶靶向特定的组蛋白修饰或蛋白，以揭示特定于这些感兴趣位点或蛋白的染色质结合信息。

CUT&Tag基于与ChIP-Seq相同的原理，但是对实验方法进行了一些相应的修改。在CUT&Tag中，新鲜的(未冷冻的)未固定的细胞与刀豆蛋白A磁珠结合，在细胞的原生状态下（native state）进行抗体孵育，不需要ChIP-Seq实验中固定染色质，超声处理和免疫沉淀的步骤。抗体结合后，染色质被消化，NGS建库时通过使用预先接好adapter的proteinA - Tn5 (pA-Tn5)转座酶进行标记，一步完成。

与ChIP-Seq相比，CUT&Tag的起始材料更少，所需要的时间更短，产生结果更快，质量更高，而且能够以更低的测序深度进行稳健的分析，从而节省时间和金钱。

CUT&Tag-IT™实验原理

CUT&Tag-IT™检测试剂盒优势
1，单次实验最少可使用5,000个细胞；
2，我们提供完整的试剂盒与优化方案；
3，适用于组蛋白标记和一些转录因子；
4，建库步骤简单成本降低；
5，背景低因此可以降低测序深度；
6，没有甲醛交联造成的假阳性结果。

CUT&Tag vs. CUT&RUN vs. ChIP-Seq

	CUT&Tag-IT™ Assay Kit	CUT&RUN	ChIP-Seq
是否需要固定	不需要	不需要	需要
染色质片段化方法	基于Tn5的片段化	MNase消化	超声打断
所需细胞数量	0.5-50万	50万	10-100万
所需测序深度*	20万 reads**	80万 reads	200-500万 reads
是否包含建库	是，通过片段化加adapter	否，需要另外的建库步骤	否，需要另外的建库步骤
适用的靶点	主要适用于组蛋白修饰，少许转录因子与辅因子	广泛适用于组蛋白修饰，转录因子与辅因子	广泛适用于组蛋白修饰，转录因子与辅因子
所需时间	1-2天	1-2天	2-3天

*Kaya-Okur et al. Nature Communications (2019) 10:1930
**对于丰度较低的感兴趣靶点，建议800-1000万 reads

CUT&Tag-IT™ Assay Kit内容
CUT&Tag-IT™ Assay Kit在两种温度条件下进行运输，由干冰运输的盒子请存放于-20°C，室温运输的盒子请存放于4°C并且保证不要冷冻。请在第一次使用时将试剂盒各组分存放妥当。所有试剂在存放得当的条件下可以存放6个月。

试剂包含：

5% Digitonin, store at -20°C
Concanavalin A Beads, store at 4°C
CUT&Tag-IT™ Assembled pA-Tn5 Transposomes, store at -20°C
Tagmentation Buffer, store at -20°C
1X Binding Buffer, store at 4°C
1X Wash buffer, store at 4°C
Dig-Wash Buffer, store at 4°C
Antibody Buffer, store at 4°C
Dig-300 Buffer, store at 4°C
Guinea Pig Anti-Rabbit/Anti-Mouse Antibody, store at -20°C（兔抗鼠抗对应不同货号）
Protease Inhibitor Cocktail, store at -20°C
0.5M EDTA, store at RT
10% SDS, store at RT
10 µg/µL Proteinase K, store at -20°C
DNA Purification Columns, store at RT
DNA Purification Binding Buffer, store at RT
DNA Purification Wash Buffer, store at RT
DNA Purification Elution Buffer, store at RT
3M Sodium Acetate, store at RT
10 mM DNTPs, store at -20°C
5X Q5 Buffer, store at -20°C
Q5 High Fidelity DNA Polymerase (2U/µL), store at -20°C
i5 Indexed Primer 1, store at -20°C
i5 Indexed Primer 2, store at -20°C
i5 Indexed Primer 3, store at -20°C
i5 Indexed Primer 4, store at -20°C
i7 Indexed Primer 1, store at -20°C
i7 Indexed Primer 2, store at -20°C
i7 Indexed Primer 3, store at -20°C
i7 Indexed Primer 4, store at -20°C
SPRI Beads, store at 4°C

搭配CUT&Tag验证抗体一起使用！

经过我们验证的CUT&Tag抗体列表：

货号	抗体名称
91285	AbFlex® CTCF antibody (rAb)
91193	AbFlex® Histone H3K27ac antibody (rAb)
61311	CTCF antibody (pAb)
39133	Histone H3K27ac antibody (pAb)
39155	Histone H3K27me3 antibody (pAb)
61101	Histone H3K36me3 antibody (pAb)
39917	Histone H3K9ac antibody (pAb)
39765	Histone H3K9me3 antibody (pAb)

CUT&Tag-IT™ Assay Kit 数据展示

图1: CUT&Tag-IT™检测试剂盒测试数据与ENCODE数据关联对比

我们采用K562细胞进行实验，使用了几种不同的抗体：H3K27me3(深蓝色)，phospho-Pol2Ser2(红色), CTCF(橙色), H3K4me3(绿色), H3K9ac(浅蓝色)， H3K9me3(紫色)，H3K27ac(黑色)来进行检测。与ENCODE的数据进行比对，CUT&Tag-IT™检测试剂盒仅仅使用10,000个细胞却能与ENCODE至少1,000,000细胞的数据有高度一致性。CUT&Tag实验中所用到的抗体： H3K27me3: cat. no 39155, CTCF: cat. no. 61311, H3K4me3: cat. no. 39159, H3K9ac: cat. no. 39917, H3K9me3: cat. no. 39161, H3K27ac: cat. no. 39133.

订购信息

品名	规格	货号
CUT&Tag-IT™ Assay Kit, Anti-Rabbit	16 rxns	53160
CUT&Tag-IT™ Assay Kit, Anti-Mouse	16 rxns	53165

Active Motif 简介：

Active Motif公司是一家致力于研发和生产核细分子生物学和表观遗传学研究用试剂的专业公司，也是世界著名的转录因子试剂生产商和CHIP-seq外包服务供应商。
Active Motif的产品涉及：表观遗传学相关抗体、Chip级别抗体、重组识别子和催化酶、预甲基化修饰的重组组蛋白、多聚核小体和生物素标记核小体；以及各类染色质分析、转录因子表达调控分析和DNA甲基化分析的试剂盒等。