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1
- 英文名:
NanOnco Plus Panel v3.0
- 供应商:
纳昂达(南京)
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-20℃
- 规格:
#1001111F (96 rxn)
NanOnco Plus Panel v3.0 靶向实体瘤研究中被广泛关注的 620 个基因 (含 HLA 基因) 的全部编码区、一系列与常见融合相关的内含子区域、经典的微卫星序列以及化疗相关多态位点,共涉及 637 个基因,覆盖基因组约 2.4 Mb 区域。支持包括碱基替换、插入/缺失、基因重排、基因扩增、微卫星不稳定在内的多种变异信息的富集。
产品表现
捕获表现
图 1. NanOnco Plus Panel v3.0 对不同 gDNA 文库的捕获表现。利用 NadPrep®快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep® UDI Adapter (for Illumina®) 构建文库,测序模式为 Illumina Novaseq 6000,PE150,利用 BWA 比对到参考基因组 hg38,按照 reads 数计算。A. 捕获数据比对率和捕获效率;B. 靶区域覆盖度;C. 覆盖均一性和一致性。
注:样本 gDNA_1-4 分别为:人类男性基因组 DNA (Promega-male, G1471);肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品 (菁良,GW-OGTM001);肿瘤 SNV 1-25% gDNA 标准品(菁良,GW-OGTM004);肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (菁良,GW-OGTM005)。
多种变异分析

图2. NanOnco Plus Panel v3.0 捕获数据中变异频率与标准品标称频率的一致性展示。利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) 构建文库,测序模式为 Illumina Novaseq 6000,PE150, Vardict 进行变异分析。
注:样本为 Onco Multiplex gDNA (LDTBIO,定制标准品),平均测序深度 3518x。
表 1. NanOnco Plus Panel v3.0 对其他变异类型检测。

利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep® UDI Adapter (for Illumina®) 构建文库,测序模式为 Illumina Novaseq 6000,PE150, Vardict、Delly、CNVkit 分别进行变异分析。GW-OGTM001 的平均测序深度 966.71x,GW-OGTM005 的平均测序深度 1126.04x。
注:样本为肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品 (菁良,GW-OGTM001) ,对照为肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (菁良,GW-OGTM005)。
仅限研究使用,不用于临床诊断。
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文献和实验线性表现的平台。 基于这一目的,丹麦Aarhus University Hospital-Skejby的研究人员评估了三个常用的miRNA定量平台的性能。这三个平台分别为:Affymetrix的GeneChip miRNA 2.0 Array,Exiqon的miRCURY Ready-to-Use PCR, Human panel I+II V1.M以及ABI的TaqMan Human MicroRNA Array v3.0。利用加标有不同比例的174个合成miRNA的血浆样品,研究小组评估
Array,Exiqon的miRCURY Ready-to-Use PCR, Human panel I+II V1.M以及ABI的TaqMan Human MicroRNA Array v3.0。利用加标有不同比例的174个合成miRNA的血浆样品,研究小组评估了三个平台的特异性、准确性、灵敏度和线性。 他们发现,基于qRT-PCR的平台足够灵敏,能重复检测以人类血浆中丰度水平存在的miRNA,而芯片平台则不行。于是他们继续评估了这两个qRT-PCR平台的性能。结果表明,对于高水平的miRNA,两个











