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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
1
- 英文名:
NanoRV Panel-Tech Access
- 保质期:
1年
- 供应商:
纳昂达(南京)
- 保存条件:
-20℃
NanoRV Panel v1.0-Tech Access 是一款针对人呼吸道病毒设计的靶向捕获 panel,可富集包括冠状病毒、流感病毒、 副流感病毒、呼吸道合胞病毒、偏肺病毒、肠道病毒、鼻病毒、腺病毒、博卡病毒在内的多种人呼吸道疾病相关病毒序 列。基于基因组序列(2020.03)的靶向设计可特别用于 SARS-CoV-2(2019-nCoV)的全基因组捕获。该 panel 包含超过 16,000 条生物素标记的 DNA 探针,适用于多个测序平台的病毒液相杂交捕获。
NanoRV Panel v1.0-Tech Access 靶向的病毒种属详细参考表1。此 panel 在覆盖病毒参考基因组序列(Refseq)全长的基础上,也参考 “nei g hbor”(同物种其他基因组序列)或相关数据库序列进行补充设计,可增强对各种已知和未知病毒亚型的富集效果。 全基因组覆盖的病毒序列参考表2。
订购信息
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产品 |
货号 |
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NanoRV Panel v1.0-Tech Access, 96 rxn |
1001121 |
表1. NanoRV Panel v1.0-Tech Access 靶向病毒种属信息
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科 |
属 |
种 (覆盖) |
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冠状病毒 |
Alpha、beta |
2 alpha、13 beta |
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正黏液病毒 |
A、B、C 型流感病毒 |
A、B、C 型流感病毒 |
|
副粘液病毒 |
Respirovirus、Rubulavirus |
副流感病毒 1、2、3、4 |
|
肺炎病毒 |
2 |
偏肺病毒、呼吸道合胞病毒 |
|
微小核糖核酸病毒 |
肠病毒 |
肠病毒 A、B、C、D鼻病毒 A、B、C |
|
腺病毒 |
哺乳动物腺病毒 |
人腺病毒 B、C、E |
|
细小病毒 |
博卡病毒 |
人博卡病毒 1、2、3、4 |
表2. NanoRV Panel v1.0-Tech Access 全基因组覆盖病毒设计参考基因组

注:所列 refseq 并非所有的参考序列,探针设计以 refseq 为基础,同时参考了更多的病毒基因组序列。
产品表现

图1.NanoRV Panel v1.0-Tech Access捕获效率。
COVID-19 RNA 质控品(菁良,GW-CRPM002)经NadPrep®️ DNA 通用型文库构建试剂盒(for Illumina®️)搭配NadPrep Total RNA-To-DNA Module制备总RNA文库;将靶向7个人类看家基因(HK7)的定制探针spike-in至NanoRV Panel v1.0-Tech Access并进行单次或两次靶向捕获;测序数据以salmon v1.2.0分析,统计各部分reads数占比。SARS-CoV-2与HK7 reads计为中靶部分,rRNA及其它转录本reads计为脱靶部分。

图2. SARS-CoV-2及7个看家基因(HK7)丰度比较。
样本为COVID-19 RNA质控品(菁良,GW-CRPM002);将靶向7个人类看家基因(HK7)的定制探针spike-in至NanoRV Panel v1.0-Tech Access并进行靶向捕获;以salmon v1.2.0软件计算TPM值。

图3. NanoRV Panel v1.0-Tech Access对COVID-19 RNA质控品(菁良,GW-CRPM002)中全长SARS-CoV-2基因组捕获的覆盖均一性。
订购信息
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产品 |
货号 |
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NanoRV Panel v1.0-Tech Access, 96 rxn |
1001121 |
本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。
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