定量蛋白质组

差异蛋白火山图

横坐标表示差异蛋白的差异倍数(log2值),纵坐标表示P-value(-log10值), 黑色代表差异不显著的蛋白,红色代表上调蛋白,绿色代表下调蛋白。

差异蛋白聚类热图

纵向是样品的聚类,横向是蛋白的聚类,聚类枝越短代表相似性越高。从纵向聚类可 以看出样品间蛋白含量的表达模式聚类。

GO富集柱状图

横坐标表示GO三个大类(细胞组分、分子功能、生物过程)的富集结果,纵坐标 为与该GO相关的差异蛋白数目占GO注释的所有差异蛋白数目的百分比。

差异蛋白KEGG富集气泡图

横坐标为相应通路中差异蛋白的数目与鉴定出的总蛋白数目的比值,值越大,说明 在该通路中差异蛋白富集程度较高。点的颜色代表超几何检验的P-value值,值越 小,说明检验的可靠性越大、越具统计学意义。点的大小代表相应通路中差异蛋白 的数目,越大,该通路中差异蛋白就越多。

KEGG富集通路图

上图绿色框标记的为鉴定出的总蛋白,蓝色框标记的是下调差异蛋白,红色 框标记的是上调差异蛋白,黄色框标记的是通路中该功能对应的多个蛋白既 有上调差异蛋白,也有下调差异蛋白。

蛋白互作网络图

互作网络中每个节点表示一个蛋白,节点大小表示与之互作蛋白的个数,节点越大 说明与之互作的蛋白越多。节点的颜色表示此节点的聚集系数,颜色越红代表聚集 系数越高,即在该网络中处于更中心的位置。节点之间的连线表示蛋白互作的强 弱,连线越粗代表蛋白互作越强。