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天根生化科技(北京)有限公司
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定量蛋白质组学服务
定量蛋白质组学(Quantitative Proteomics)是对一种细胞、生物体或复杂混合体系内表达的全部蛋白质进行精确鉴定和定量的技术。定量蛋白质组的原理是采用多种同位素标签与多组样本的肽段 N 末端基团结合,然后进行串联质谱分析,通过报告离子的峰面积计算同一肽段在不同样本间的比值,从而实现不同样本间蛋白质组的定量比较。


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文献和实验共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白组学分析、SILAC/Dimethyl标记定量蛋白组分析、SWATH定量蛋白组学、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白组学分析。下面介绍两种比较常见的定量蛋白质组学技术。 iTRAQ定量蛋白质组学分析 iTRAQ (isobaric tags for relative and absolute quantitation) 技术是由美国应用生物系统公司ABI研发的一种多肽体外标记技术。该技术采用4种或8种同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,而后进
色谱保留时间等信息进行定量分析的方法。 蛋白质非标记定量技术(Label Free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。 Label Free定量优势 就在于蛋白质不需要进行标记,所需样品总量少,耗费低。 相比较iTRAQ/TMT等标记方法,Label Free非标记方法具有特定的技术优势: a.检测起始样本量少; b.前处理少
本节课程介绍了label-free定量蛋白质组学技术的原理及应用。主要包括:(1)以MS数据为例,系统介绍label-free技术进行蛋白质定量的技术流程和原理。(2)介绍免费的label-free分析套件—Maxquant和Perseus。(3)以免疫沉淀(IP)数据为例,展示label-free进行蛋白质互作定量的应用。(4)以数据为例,展示label-free在外泌体蛋白定量分析中的应用。
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