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- cf-RRBS测序技术是一种创新的表观遗传学研究工具，专门针对循环游离DNA（cfDNA）的甲基化状态进行分析。
- 2026年03月04日
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XYbiotech
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cf-DNA甲基化测序
在生物医学研究的前沿，DNA甲基化作为最重要的表观遗传修饰方式之一，一直是科学家们关注的焦点。它不仅在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育中扮演着关键角色，还在肿瘤的发生和发展中发挥着重要作用。为了更深入地理解这些复杂的生物学过程，研究者们需要一种高效、精确且经济的甲基化测序技术——cfRRBS（Circulating free DNA Reduced Representation Bisulfite Sequencing）。
什么是cf-RRBS测序技术？
cf-RRBS测序（cfDNA-Reduced Representation Bisulfite Sequencing）是一种用于研究DNA甲基化的测序技术。该技术通过使用限制性内切酶MspⅠ对基因组进行酶切，富集CpG片段，并进行亚硫酸盐处理和测序，从而分析富集片段的甲基化状态。
cf-RRBS测序技术的优势：
- 适用于高度碎片化的 DNA，尤其适用于血浆中的 cfDNA；
- 高效且经济；
- 操作简单;
- 数据质量可靠。
cf-RRBS测序技术的应用：
- 癌症早期诊断与治疗监测：通过分析肿瘤特异性的甲基化模式，cf-RRBS技术能够辅助癌症的早期诊断，并监测治疗效果。
- 非侵入性产前检测：为孕妇提供一种安全、准确的胎儿遗传疾病筛查方法。
- 个性化医疗：根据个体的甲基化图谱，定制个性化的治疗方案，提高治疗效果。
- 疾病机理研究：揭示疾病发生的分子机制，为新药开发提供科学依据。
cf-RRBS测序的送样要求：
- 5ml以上血清/血浆
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文献和实验一种经典的甲基化研究方法，其优点是：相对简单,成本低廉，甲基化位点明确,实验结果易解释；缺点是：1.由于CG不仅仅限于CCGG序列中，因此非该序列中的CG将被忽略；2.只有检测与转录相关的关键性位点的甲基化状态时,该检测方法的结果才有意义；3.相对而言，Southern方法较复杂，且需要样本的量大；4.存在着酶不完全消化引起的假阳性的问题；5.不适用于混合样本。 2.2.2 直接测序法 直接测序是由Frommer等[25]提出的研究DNA甲基化方法。过程是：重亚硫酸盐使DNA中未发生甲基化的胞嘧啶
适用于绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。但是相应的费用也是相当高的。为了能用较低的成本得到全面的基因组甲基化状况，有两种性价比非常高的测序方法不得不提，那就是MeDIP-seq(甲基化DNA免疫共沉淀测序)和RRBS(简化的表观亚硫酸氢盐测序技术(Reduced Representation Bisulfite Sequencing))。 MeDIP-seq是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术，采用甲基化DNA免疫共沉淀技术，通过5'-甲基胞嘧啶抗体特异性富集
2.2.10 DNA微阵列法 Yan等2001年[40]将以分子杂交为基础的微阵列技术应用于DNA甲基化检测中，这种方法是基于杂交的寡核苷酸微阵列，是一种在基因组中寻找新位点的方法。包括用于整个基因组范围内扫描的差异甲基化（DMH）杂交（Huang等1999年[41]）和用于检测某个位点的甲基化特异性微阵列MSO（Gitan等2002年[42]）。前者类似于mRNA表达谱或cDNA微阵列，是CpG岛微阵列，后者类似于寡核苷酸微阵列，是针对CpG二核苷酸位点的甲基化特异性寡核苷酸微阵列[26
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