- 询价
- 2025年07月15日
万千商家帮你免费找货
0 人在求购买到急需产品
- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
技术简介
R-loop是一种特殊的染色体结构，由一条RNA:DNA杂合链和一条单链DNA所组成。目前越来越多的证据发现这种独特的染色质结构在原核和真核生物中普遍存在，在很多关键的生物学过程中发挥重要功能，包括染色质修饰、转录调控、DNA损伤修复以及基因组稳定性等。
基于单链DNA建库的DNA:RNA杂合链免疫共沉淀及高通量测序技术（简称ssDRIP-seq, single-strand DNA ligation-based library construction of DNA:RNA hybrid immunoprecipitation and sequencing）表现出易操作、精准、高效、高度灵敏、可重复性好等优点，并且可获得DNA链特异性信息。
实验原理
首先经过温和的DNA提取和限制性内切酶酶切片段化，然后用S9.6抗体对R环结构进行免疫沉淀实验（该抗体对RNA-DNA杂交物显示出亚纳摩尔亲和力，对双链DNA几乎没有亲和力）。随后将Adp1连接到ssDNA的3 '端，后续生物信息学分析可以根据该接头区分DNA链，且文库构建步骤较少。随后，将Adp2连接到ssDNA的5 '端，进行扩增及测序。这种方法避免了基于随机引物的方法固有的偏差，因为它以序列独立的方式连接接头。
产品优势
灵敏度高：能够得到全基因组范围内的R-loop图谱
特异性好：背景噪音低，所需测序深度少
链特异性：采用链特异性建库，保留链的信息
实验重复性好：实验重复结果一致性好
样品要求
样品类型
组织、细胞、总DNA或IP后DNA。其它类型样品请详询。
样品量
a) 细胞：2×107
b) 组织：100 mg
c) 总DNA：> 30 μg
样品运输及保存
样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。
样品保存：细胞样品或新鲜组织块，液氮冻存后-80℃保存；DNA样品-80℃保存，避免反复冻融。
案例分析
主题：The R-loop is a common chromatin feature of the Arabidopsis genome
期刊：Nature Plants 发表日期：2017.8.28 影响因子：18
该研究以模式植物拟南芥为材料，在传统R-loop全基因组检测技术基础上开发出一种全新的检测方法：基于单链DNA建库的DNA:RNA杂合链免疫共沉淀及高通量测序技术（简称ssDRIP-seq, single-strand DNA ligation-based library construction of DNA:RNA hybrid immunoprecipitation and sequencing）。与已报道的全基因组R-loop检测方法相比，ssDRIP-seq表现出易操作、精准、高效、高度灵敏、可重复性好等优点，并且可获得DNA链特异性信息。基于ssDRIP-seq，该研究获得了拟南芥全基因组水平R-loop的精准分布特征，如R-loop在拟南芥基因组中分布广泛且相对稳定，与基因表达、DNA甲基化、染色质修饰、GC/AT skew等存在着紧密关系。不同于哺乳动物基因组，拟南芥中广泛存在一类反义长非编码RNA在正义链转录起始位点形成的R-loop，推测这类特别的R-loop在调节基因转录起始或控制基因转录过程中发挥重要作用。
风险提示：丁香通仅作为第三方平台，为商家信息发布提供平台空间。用户咨询产品时请注意保护个人信息及财产安全，合理判断，谨慎选购商品，商家和用户对交易行为负责。对于医疗器械类产品，请先查证核实企业经营资质和医疗器械产品注册证情况。
文献和实验SLAM-seq—RNA合成及降解代谢动力学分析，基因动态表达研究的首选 基因表达是一个动态的过程，取决于细胞内环境的稳态以及对环境的适应性，基因信息调控的转变可能会导致人类疾病的发生。这些基本生物学进程的背后是一个非常精密的分子调控事件，它们控制着RNA转录，加工和降解相关的动力学（图1）。了解基因调控的分子基础需要以转录特异性和系统的方式深入了解RNA合成和降解相关动力学。但是，对于常规的RNAseq，我们只能获得终点水平的RNAs丰度信息，无法区分及定量新合成的新生RNAs水平
干货 | CUT and Tag 让 ChIP-Seq更简单高效！
CUT&Tag 技术原理及应用 CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是替换传统的 ChIP-Seq 用以研究蛋白质-基因组互作的新技术，与后者相比，它具有信噪比高、可重复性好、实验周期短（1 天实现从细胞到文库构建）、细胞投入量低等显著优势，尤其适用于早期胚胎发育、干细胞、肿瘤以及表观遗传学等研究领域。 图 1. CUT&Tag 实验原理 CUT
免疫组库是哪位？ 能够称为“组库”，首先是功能相似的N多细胞的集合。而“免疫”是指免疫细胞，特指 T/B 淋巴细胞。“So~免疫组库”（Immune Repertoire，IR），指某个体，特定时间点下，所有功能多样性T/B淋巴细胞的总和。T/B细胞利用细胞表面受体（TCR/BCR）识别和结合抗原，介导机体产生针对性的免疫应答，发挥免疫功能并做好记录备案，如果该抗原再次入侵可迅速作出反应，作为健康卫士守护肌体城池。 “组库”从哪来？ 除了 n 多 T/B 细胞的集合，TCR/BCR
技术资料暂无技术资料 索取技术资料
