- ￥15000 - 25000
- Plastech-seq是昕瑞再生自主知识产权的新型转录组测序技术，该技术非常适合微量细胞和高通量筛选，采用携带Barcode标签和UMI序列的oligo dT，高效结合mRNA上Poly(A)尾端，进行反转录和标记。Barcoded标签可实现多样本混合构建文库，而每个序列的UMI可以对捕获的mRNA序列进行精确定量，以降低PCR扩增所带来的数据偏差。Plastech-seq技术极大降低了样本要求和测序成本，可广泛应用于细胞诱导与分化、细胞培养方法开发、化学药物筛选、肿瘤标记物发现等领域。
- 江苏-南京
- 2025年07月16日
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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商：
南京昕瑞再生医药科技有限公司
- 服务名称：
plastech-seq新型转录组表型筛选技术
- 规格：
每一96孔板
服务流程：
1. 方案设计
2. 样品处理
加入化合物或者设置不同条件；处理完成后，明场初步确认细胞整体状态，收集5000~30000个左右的细胞送检，细胞活性大于80%。
3. 样品收集
悬浮细胞：收集5000个左右的活细胞，建议用PBS（无钙镁离子）清洗3次后，加入不低于35ul裂解液重悬；
类器官：使用胰酶或recovery solution等方式消化基质胶，后采用悬浮细胞的方式收集样本。
4. 文库构建及上机测序
裂解后的细胞进行批量的反转录、合成并扩增全长cDNA，经打断、修复及添加接头后进行文库富集，并在二代测序平台进行测序，推荐每孔样品的测序数量不低于1M Reads。
5. 数据分析
下机的数据经质量评估后进行基因组比对分析及基因定量分析。
基础分析
SCENIC
1. 输出转录因子活性打分
2. regulon开放矩阵
WGCNA
1. 输出基因模块
2. 模块与样本的相关性
3. 模块内基因富集分析
产品优势：
通量高：一次可完成数千样本的筛选；
成本低：可同时获得所有样本每个近万基因的表达数据；
专业的项目参考：硕博士级项目管理和实验室科学家提供技术咨询和客户支持！
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文献和实验挑战，某些干预措施甚至意外加速了癌症进展。单细胞 RNA 测序（scRNA-seq）对 CAFs 研究越来越深入，但仍缺乏其空间背景信息，而这对于揭示塑造 CAFs 表型和功能的空间组织与互作机制至关重要。该研究旨在利用多种空间组学技术解决这一问题。 研究路线： 研究结论： 图 4. 利用 CosMx 和 MERSCOPE 技术对八种癌症类型的 24 个组织切片的癌相关成纤维细胞（CAFs）的全面空间转录组分析图 本研究发现队列采用 CosMx 和 MERSCOPE 技术
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tsRNAs 和 rsRNAs，可以对环境暴露做出敏感反应，并在介导后代代谢表型方面充当致病因子。然而，这些 sncRNAs 中有许多具有各种 RNA 修饰，这些 RNA 修饰 (包括 RNA 甲基化和末端 RNA 修饰) 会干扰 cDNA 文库的构建过程，这阻碍了高度修饰的 rsRNAs 和 tsRNAs 的发现。 为了解决这一问题，研究人员成功开发了一种创新的转录组测序文库构建流程，并称之为 PANDORA-seq (Panoramic RNA Display by Overcoming RNA
机制。 研究路线 研究结论 图 1. 单细胞空间转录组技术和单细胞转录组测序结果图 利用 Xenium In Situ、TF-seqFISH 等单细胞空间转录组技术和单细胞转录组测序（scRNA-seq），研究者鉴定出 4 个主要的上皮细胞亚群（基底细胞、增殖细胞、分化细胞、侵袭细胞），其比例随疾病进展呈动态变化。ESCC 的演进过程是由增殖性上皮细胞亚群驱动，该亚群通过获得去分化及侵袭性特征推动肿瘤进展：正常阶段（NOR）：基底细胞与增殖细胞定位于上皮-基质界面附近；癌前病变阶段
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