CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)
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CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)

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  • ¥30000
  • 艾迪基因CRISPR文库筛选一站式服务
  • 广州
  • 2025年10月16日
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      广州艾迪基因

    • 服务名称

      文库筛选

    • 规格

    CRISPR文库筛选
    CRISPR文库筛选是基于CRISPR/Cas9技术建立的高通量基因筛选手段。通过对细胞池实现单一的基因扰动,再进行如药物胁迫或病毒感染等功能性筛选,从而筛选出与感兴趣表型相关的基因。目前,扰动的类型是多样的,如基因敲除、基因激活、基因沉默、基因点突变等。另外,筛选的范围可以是全基因组或某些特定的信号通路等。CRISPR文库筛选在遗传疾病、癌症、免疫调节和微生物学等领域有着广泛的应用,它可以用来发现与癌症相关的基因,研究肿瘤特有的生物学过程,以及发现新的免疫调节基因等。
     
    服务内容与交付标准
    服务项目 服务详情 交付标准

    sgRNA文库设计定制、扩增、质控

    sgRNA设计、sgRNA-oligo pool合成、文库质粒构建、文库质粒扩增、NGS质控

    文库质粒:100ug

    NGS质控报告(覆盖度>99%,均一性<10)

    Cas9稳转细胞株定制 Cas9慢病毒包装、Cas9稳转株构建、编辑活性检测 Cas9稳转株(1×106/株)

    文库慢病毒包装

    文库病毒包装与滴度测定(细胞滴定法),确保活病毒滴度>1×106 TU/ml

    小规格:1×108 TU总量;

    中规格:5×108 TU总量;

    大规格:1×109 TU总量;

    病毒滴度检测报告

    文库细胞构建 MOI<0.3的转染条件摸索、文库细胞pool构建

    小规格:1×107 细胞总量;

    中规格:5×10细胞总量;

    大规格:1×10细胞总量;

    功能筛选实验 个性化的功能筛选服务:药物筛选、病毒感染、细菌感染、流式分选等 实验报告
    NGS分析 sgRNA测序建库和NGS测序、生信分析 实验报告、NGS测序原始数据
     
    咨询店家获得更多服务信息
     
    服务详情描述 
    艾迪基因专研基因编辑十余载,细胞基因编辑经验丰富,可提供CRISPR文库定制、CRISPR文库扩增和质控、CRISPR文库慢病毒包装、CRISPR文库细胞pool构建、正向或负筛选、高通量测序和生信分析等一系列服务,形成一站式CRISPR文库筛选解决方案。 
     
    CRISPR-KO文库
    该类文库针对编码基因的5’外显子设计sgRNA,通过引导Cas9蛋白定位到基因组特定位置并进行切割,导致DNA双链断裂。再通过细胞非同源末端修复机制,连接断裂的双链DNA,产生碱基非3倍数的indel,实现基因功能的丧失。
     

    ● CRISPR KO 文库质粒产品

    艾迪基因专注于提供优质的CRISPR文库筛选服务,目前拥有超过35种人源或鼠源的CRISPR-KO现货质粒文库供应。除了全基因组敲除文库外,还涵盖肿瘤与细胞凋亡、膜蛋白、药物靶点、激酶、代谢、表观遗传等类型的敲除亚文库。这些质粒文库经过艾迪基因严格的质控,确保Coverage ≥ 99%,Gini index < 0.1。使用这些优质的CRISPR-KO现货质粒文库,有助于您的实验顺利开展,加速研究进度。

    CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)

     

    CRISPR KO文库病毒产品

    艾迪基因可提供优质的现货慢病毒文库。获得覆盖度和均一性良好的质粒文库后(Gini Index<0.1,coverage rate>99%),以成熟的实验体系进行慢病毒包装,收集和浓缩病毒上清液,并通过细胞滴定法测定滴度,获得高感染活性的CRISPR慢病毒文库。艾迪基因提供的CRISPR慢病毒文库,可以直接用于敲除,激活或者抑制细胞文库的构建,节省质粒文库扩增与质控、病毒文库包装等步骤,加速研究进程。

    CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)

     
     CRISPRa文库
    该文库通过融合dCas9和转录阻遏元件,在sgRNA的引导下,靶向目标基因的活性调控区,降低基因的转录活性。

     

    ● CRISPRa文库质粒产品

    艾迪基因专注于提供优质的CRISPR文库筛选服务,目前拥有超过20种人源或鼠源的CRISPRa现货质粒文库供应。除了全基因组激活文库外,还涵盖代谢、物靶点、激酶、磷酸酶、膜蛋白、癌症与细胞凋亡等类型的激活亚文库。这些质粒文库经过艾迪基因严格的质控,确保Coverage ≥ 99%,Gini index < 0.1。使用这些优质的CRISPRa现货质粒文库,有助于您的实验顺利开展,加速研究进度。
    CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)

     

    CRISPRa文库病毒产品

    艾迪基因可提供优质的现货慢病毒文库。获得覆盖度和均一性良好的质粒文库后(Gini Index<0.1,coverage rate>99%),以成熟的实验体系进行慢病毒包装,收集和浓缩病毒上清液,并通过细胞滴定法测定滴度,获得高感染活性的CRISPR慢病毒文库。艾迪基因提供的CRISPR慢病毒文库,可以直接用于敲除,激活或者抑制细胞文库的构建,节省质粒文库扩增与质控、病毒文库包装等步骤,加速研究进程。
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     CRISPRi文库
    该文库通过融合dCas9和转录阻遏元件,在sgRNA的引导下,靶向目标基因的活性调控区,降低基因的转录活性。
     

    CRISPRi文库质粒产品

    艾迪基因专注于提供优质的CRISPR文库筛选服务,目前拥有超过10种人源或鼠源的CRISPRi现货质粒文库供应。除了全基因组抑制文库外,还涵癌症与细胞凋亡、膜蛋白、药物靶点、激酶、磷酸酶等类型的抑制亚文库。这些质粒文库经过艾迪基因严格的质控,确保Coverage ≥ 99%,Gini index < 0.1。使用这些优质的CRISPRi现货质粒文库,有助于您的实验顺利开展,加速研究进度。

    CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)

     

    CRISPRi文库病毒产品

    艾迪基因可提供优质的现货慢病毒文库。获得覆盖度和均一性良好的质粒文库后(Gini Index<0.1,coverage rate>99%),以成熟的实验体系进行慢病毒包装,收集和浓缩病毒上清液,并通过细胞滴定法测定滴度,获得高感染活性的CRISPR慢病毒文库。艾迪基因提供的CRISPR慢病毒文库,可以直接用于敲除,激活或者抑制细胞文库的构建,节省质粒文库扩增与质控、病毒文库包装等步骤,加速研究进程。CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)

     

     
    服务优势
    CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)
     
     
    服务流程
    CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)
     
    服务案例
    艾迪基因根据客户需求,针对性地设计CRISPR敲除文库筛选方案,并完成实验。
      CRISPR敲除文库筛选全套服务(节选部分实验结果)
    1. 构建Cas9稳转株
    通过Cas9慢病毒转染构建目的细胞,得到目的细胞的Cas9稳转株,并使用验证过的sgRNA进行编辑效率测试。
     CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)
    2. sgRNA质粒文库的NGS质控结果
    使用MAGeCK分析测序数据,质控分析结果中,测序数据>85% reads可以比对到目标文库,说明文库PCR和测序质量较好;文库GiniIndex <0.1,覆盖度99.8%,体现了文库sgRNAs分布均一性较好,所得数据综合证明了制备的sgRNA质粒文库质量良好。
     CRISPR sgRNA文库筛选服务 (敲除/干扰/激活)
     
    3. 功能筛选后的文库测序及生信分析
    对筛选到的细胞进行基因组提取,经过扩增和测序后采用MAGeCK-RPA算法对sgRNA文库测序结果进行质量检测,比对筛选组间差异基因,随后使用MAGeCKFlute工具箱进行下游功能富集分析。
     
    ① MAGeCK 质控分析
    使用 mageck count 算法将正向测序reads 比对至 sgRNA 文库并计算 QC 数据,使用MAGeCKFlute 工具将统计数据可视化
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    ② 基因差异分析
    使用 MAGeCK RPA 算法,基于P值(negative binomial model)对 sgRNA 排序,并使用 α-RRA 模型鉴定正向/负向筛选基因,使用 MAGeCKFlute 工具将分析数据可视化。以 D 文库为对照,进行差异分析,成功筛选出显著基因。
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    ③ 功能富集分析
    使用MAGeCKFlute工具箱比对基因功能数据库,使用hypergeometric test(HGT)统计方法对正向/反向筛选基因分别进行KEGG/REACTOME/GOBP/Complex 富集分析。
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    参考文献

    1.Genetic screens in human cells using the CRISPR-Cas9 system

    2.Genome-Scale CRISPR-Mediated Control of Gene Repression and Activation

    3.Genome-scale CRISPR-Cas9 knockout screening in human cells

    4.High-Resolution CRISPR Screens Reveal Fitness Genes and Genotype-Specific Cancer Liabilities

    5.Genome-scale transcriptional activation by an engineered CRISPR-Cas9 complex

    6.Identification and characterization of essential genes in the human genome

    7.Genome-wide CRISPR-Cas9 Screens Reveal Loss of Redundancy between PKMYT1 and WEE1 in Glioblastoma Stem-like Cells

    8.A CRISPR-Based Screen Identifies Genes Essential for West-Nile-Virus-Induced Cell Death

    9.Systematic comparison of CRISPR/Cas9 and RNAi screens for essential genes

    10.A CRISPR Dropout Screen Identifies Genetic Vulnerabilities and Therapeutic Targets in Acute Myeloid Leukemia

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