拼团低价 | 3'转录组测序DRUG-seq团购价仅需¥19

 

项目简介

Epi^TM DRUG-seq（Digital mRNA with pertUrbation of Genes）是表观生物全新开发的快速转录组测序技术，该技术针对微量细胞和组织样本，采用携带Barcode标签和UMI序列的oligo dT磁珠，高效结合mRNA上Poly(A)尾端，进行反转录和文库构建。磁珠的Barcoded标签可实现多样本混合构建文库，而每个序列的UMI可以对捕获的mRNA序列进行精确定量，以降低PCR扩增所带来的数据偏差。Epi^TM DRUG-seq 极大降低了样本要求和测序成本，可广泛应用于生命科学基础研究、转化医学及新药开发等相关领域。

技术原理

（点击放大看原图）

技术优势

技术应用

1. 流式分选细胞图谱绘制

2. 高通量基因功能研究 

3. 化合物作用靶点分析 

4. 肿瘤靶向治疗药物筛选研究

5. 创新药物开发

 

送样要求

样本类型：

1. 活细胞，100~10000个细胞/样本，细胞活率≥85%

2. 细胞沉淀，100~10000个细胞/样本，细胞活率≥85%

3. 加裂解液充分裂解细胞，100~10000个细胞/样本

样本物种： 

仅限人、大小鼠，其他物种需评估

 

分析内容

1. 数据质控

2. 基因比对与统计

3. 基因表达量定量

4. 差异表达分析
   4.1 差异基因热图
   4.2 火山图

5. 基因功能GO分析

6. 代谢通路KEGG分析

7. 基因集富集GSEA分析

 

分析数据展示

图1. 差异基因热图

 

图2. 差异基因火山图

图3. GO富集分析条形图和气泡图

 

图4. KEGG通路网络图

 

图5. KEGG通路树状图
 

图6. GSEA堆叠富集曲线图
 

客户文章

 

Aging Dis：NeuroD1通过内皮基因重编程增强AAV-PHP.eB转导并促进缺血性中风的多靶点修复（DOI: 10.14336/AD.2023.1213）

这项研究揭示了NeuroD1通过调控内皮细胞基因表达增强AAV-PHP.eB转导效率并促进缺血性中风后神经修复的机制。研究利用DRUG-seq技术分析了Tie2-cre小鼠静脉注射AAV-PHP.eB病毒（携带NeuroD1或对照GFP）后内皮细胞的转录组变化。DRUG-seq分析表明，NeuroD1显著降低Ly6A等内皮标志物表达，重塑病毒转导模式。治疗后BBB完整性恢复，神经炎症减轻，神经元凋亡减少，同时促进星形胶质细胞向神经元转化，最终改善中风后运动功能。

图7. 实验设计示意图（Tie2-cre小鼠静脉注射病毒后，通过DRUG-seq分析内皮细胞基因表达）


图8. （D）NeuroD1治疗组与对照组的差异表达火山图；（E）NeuroD1调控的DEGs富集于吞噬作用等生物学过程