10Xgenomics单细胞转录组测序

· 产品定义

10Xgenomics单细胞转录组测序通过微流控分选单个细胞，然后通过带有barcode和引物的磁珠与细胞结合，被油滴包裹形成油包水结构，实现了对大量细胞的快速高效标记、测序和分析，获得单细胞水平转录表达信息，并依据特征基因的表达对不同细胞群进行鉴定和注释，实现样本、细胞群之间的差异分析、细胞演化过程以及细胞与细胞间的相互作用等分析内容，从而获得高分辨率的细胞图谱。

 

· 技术路线

 

· 平台优势

· 完备的细胞捕获平台（Chromium Controller仪器和Chromium X Series仪器）；
· 丰富的样本处理经验（如人/鼠等多个物种的脑/心脏/肝/肺/脾/肾/肠/胃等多种器官组织样本）；
· 高标准实验环境，进口试剂耗材，最大限度消除各种不良因素影响，保障建库质量；
· 强大的生信团队，可根据客户需求提供标准化、个性化的数据分析解决方案。

 

· 数据分析

 

· 部分数据分析结果展示

 

· 推荐应用领域

1. 细胞图谱的构建

2. 细胞异质性及组织微环境研究

3. 免疫调控研究

4. 神经分化发育研究

5. 疾病机制研究

6. 药物动力学研究

 

· 样本要求（特殊样本可）

1. 样品总量：制备成细胞悬浮液，一个样本的细胞起始量需大于1×10 5个；

2. 样品浓度：最终上样捕获前细胞浓度在700 - 1,200 cells / μL；

3. 细胞活性：活细胞数目在85 %以上；

4. 细胞大小：直径小于40 μm；

5. 细胞培养基及缓冲液不能含有Ca 2+和Mg 2+等影响酶活性的物质；

6. 血液样本需要用EDTA抗凝管收集，不能采用含有肝素的抗凝管；

7. 植物样本需制备成原生质体。

 

· 推荐组合产品

1. 单细胞转录组+bulk RNA-seq/蛋白组学；

2. 单细胞转录组+空间组学（空间转录组/空间代谢组）；

3. 单细胞转录组+16s/宏基因组+代谢组；

4. 单细胞转录组+基因组（WES/WGS）。

 

· 参考文献

1.Shengqian Dou,et al,Molecular identity of human limbal heterogeneity involved in corneal homeostasis and privilege.Ocular Surface.2021.DOI:10.1016/j.jtos.2021.04.010.

2.Li SB,et al.Hyperexcitable arousal circuits drive sleep instability during aging.Science.2022.doi: 10.1126/science.abh3021.

3.Andrew C. Yang,et al.A human brain vascular atlas reveals diverse mediators of Alzheimer’s risk.Nature.2022.DOI: 10.1038/s41586-021-04369-3.