全转录组

· 产品定义

全转录组（Whole transcriptome），是指特定组织或细胞在特定状态下转录出的所有转录本信息的总和，基于二代测序平台，采用去核糖体链特异性和小片段富集筛选的建库方法，实现编码RNA和非编码RNA（miRNA, lncRNA, circRNA）的建库、测序、生物信息学分析及联合分析、ceRNA调控网络等，研究基因表达变化的同时分析非编码RNA对其调控作用，深入挖掘解读生命现象背后的转录与调控问题。

· 技术路线

· 技术优势

1. 数据丰富：一份样本可同时获得4种RNA（miRNA，lncRNA，mRNA，circRNA）的信息

2. 全面的关联分析：可以进行两两间关联分析和两者以上ceRNA网络调控分析，不仅可以解释生物学现象背后的网络调控机制，而且有助于缩小筛选范围，挖掘关键基因

· 数据分析

· 部分数据分析结果展示

· 推荐应用领域

生物领域各个研究方面，如：

1. 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；

2. 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；

3. 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；

4. 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；

· 送样建议 (特殊样本可)

· 参考文献

文献名称：Comprehensive diagnostics of acute myeloid leukemia by whole transcriptome RNA sequencing

发表期刊：《Leukemia》（IF=11.528）

文章摘要：急性髓系白血病（AML）是由遗传变异引起的，遗传变异也影响患者的预后，并指导风险适应和靶向治疗。目前通过不同的诊断分析检测到AML的基因畸变在结构上是多样的。本研建立了AML诊断的单一、全面和灵活的HAMLET（人类AML快速转录组学）全转录组测序平台，可用于同时检测融合基因、小型突变、串联重复和基因表达。对100例AML患者进行全转录组测序，并通过参考分析和靶向重测序验证HAMLET平台的可靠性。数据显示，HAMLET准确检测到所有融合基因和EVI1的过度表达，与3q26畸变无关。此外，AML中经常发生突变的13个基因中的小型突变检测结果具有为99.2%的敏感性和100%的特异性，同时基于新算法检测FLT3和KMT2A中的串联重复结果具有100%的敏感性和97.1%的特异性。总之，HAMLET有潜力在单一技术平台上提供与AML分类、风险评估和靶向治疗相关的准确综合诊断信息。