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上海中科新生命生物科技有限公司
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10Xgenomics单细胞免疫组库
· 产品定义
10Xgenomics 单细胞免疫组库利用5'端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行T细胞和B细胞的V(D)J富集,从而实现高通量的单细胞转录组测序和成对的重链和轻链(B细胞)或α和β链(T细胞)的全长测序。为免疫组库全面、系统的研究提供了高效的技术平台,对疾病发生、发展的分子机制研究有重要的意义。
· 技术路线

· 平台优势
1. 完备的细胞捕获平台(Chromium Controller仪器和Chromium X Series仪器);
2. 丰富的样本处理经验(如人/鼠等多个物种的脑/心脏/肝/肺/脾/肾/肠/胃等多种器官组织样本);
3. 高标准实验环境,进口试剂耗材,最大限度消除各种不良因素影响,保障建库质量;
4. 强大的生信团队,可根据客户需求提供标准化、个性化的数据分析解决方案。
· 数据分析

· 部分数据分析结果展示

· 推荐应用领域
1. 肿瘤免疫
2. 感染性疾病
3. 抗体研究
4. 疫苗研发
5. 自身免疫性疾病
6. 器官移植
7. 免疫系统发育
· 样本要求(特殊样本可直接咨询我们)
1. 样品总量:制备成细胞悬浮液,一个样本的细胞起始量需大于1×10 5个;
2. 样品浓度:最终上样捕获前细胞浓度在700 - 1,200 cells / μL;
3. 细胞活性:活细胞数目在85 %以上;
4. 细胞大小:直径小于40 μm;
5. 细胞培养基及缓冲液不能含有Ca 2+和Mg 2+等影响酶活性的物质;
6. 血液样本需要用EDTA抗凝管收集,不能采用含有肝素的抗凝管。
· 参考文献
1.Su Y,et al. Multi-Omics Resolves a Sharp Disease-State Shift between Mild and Moderate COVID-19. Cell.2020. DOI: 10.1016/j.cell.2020.10.037.
2.Jing L,et al.KIR + CD8 + T cells suppress pathogenic T cells and are active in autoimmune diseases and COVID-19.Science. 2022. doi: 10.1126/science.abi9591.
3.Yedan Liu,et al.Immune phenotypic linkage between colorectal cancer and liver metastasis.Cancer Cell. 2022. doi: 10.1016/j.ccell.2022.02.013.
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文献和实验的能力越强,越不容易感染疾病,但超过一定限度,也容易引发自身免疫性疾病。且机体的免疫组库也不是一成不变的,会随着年龄,环境,药物,患病等等因素,免疫组库多样性也时刻处于动态变化当中。由此,将免疫组库测序用于临床诊断和治疗上,有助于对群体或个体间进行免疫监测,探究相关疾病(疾病感染,治疗,自身免疫疾病等)和免疫应答的关系,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。简单来说,单细胞免疫组库解决如下问题: 识别免疫组库序列组成和多样性 探究基因表达情况,发现新的生物标志物 分析样本内/样本间
不变的,会随着年龄,环境,药物,患病等等因素,免疫组库多样性也时刻处于动态变化当中。由此,将免疫组库测序用于临床诊断和治疗上,有助于对群体或个体间进行免疫监测,探究相关疾病(疾病感染,治疗,自身免疫疾病等)和免疫应答的关系,监测免疫疗法的效果,研究疾病发生、发展的分子机制。 简单来说,单细胞免疫组库解决如下问题: 识别免疫组库序列组成和多样性 探究基因表达情况,发现新的生物标志物 . 分析样本内/样本间Clonotype组成(如增殖性克隆,细胞类型间clonotype overlap情况
-Sequencing (scRNA-seq) Analysis Outline (Trends Immunol. 2017 Feb;38(2):140-149.)但随着科研要求的不断增高,以及技术手段的不断发展,免疫组库的研究也正逐渐向更精细的方向发展,单细胞免疫组库测序,使得科学家从另一个角度认识这个复杂的系统。单细胞 RNA 测序是分析个体免疫细胞的有力工具,特别是在免疫系统发育和反应过程中。专门用于处理和分析单细胞数据的计算方法可以观察在群体水平无法解决的罕见和中间细胞状态。而 B 细胞和 T 细胞的单细胞
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