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Label-free 蛋白质组学非标记定量技术
- 提供商:
上海中科新生命生物科技有限公司
· 产品定义
Label free是一种不依赖于同位素标记的非标记蛋白组定量技术,通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内标,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
· 技术路线
· 技术优势
1. 无需昂贵的同位素标记试剂,实验周期短
2. 可用于不同物种间的“有无差异蛋白”比较
3. 无标记定量蛋白质组学中的倍数压缩
4. 克服标记定量技术在样本数量的上限制,灵活方便
· 数据分析
· 推荐应用领域
生物领域各个研究方面,如:
1. 农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等
2. 畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等
3. 基础医学、临床诊断:生物标志物,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等
4. 生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等
5. 微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等
6. 海洋水产:渔业资源,海水养殖,渔业环境与水产品安全等
7. 生物能源、环境科学领域:发酵过程优化,生物燃料生产,环境危定风险评估研究等
8. 食品营养:食品储藏及加工条件优化,食品组分及品质鉴定,功能性食品开发,食品安全监检测等
· 送样建议(特殊样本可)
· 参考文献
1. NUPR1 promotes the proliferation and metastasis of oral squamous cell carcinoma cells by activating TFE3-dependent autophagy.2022. Signal Transduction and Targeted Therapy.(IF 18.187)【客户文献】
Labelfree蛋白组学助力揭示自噬在口腔鳞状细胞癌转移中的具体作用机制
2. Fibrillin-1–enriched microenvironment drives endothelial injury and vascular rarefaction in chronic kidney disease. 2021. Science Advances. (IF 14.136) 【客户文献】
Labelfree蛋白质组协助研究FBN1在慢性肾病中引起上皮细胞损伤和血管稀疏的关键作用机制
3.Pyridoxine induces glutathione synthesis via PKM2-mediated Nrf2 transactivation and confers neuroprotection. 2020. Nature Communications. (IF 14.919)【客户文献】
Labelfree蛋白质组揭示星形胶质细胞多巴胺D2受体激活后促进GSH合成具体分子机制
4.Epithelial exosomal contactin-1 promotes monocyte-derived dendritic cells-dominant T cell responses in asthma. 2021. Journal of Allergy and Clinical Immunology. (IF 10.793)【客户文献】
Labelfree蛋白质组助力研究呼吸道上皮细胞来源的外泌体参与哮喘进程的过程机制
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文献和实验1. NUPR1 promotes the proliferation and metastasis of oral squamous cell carcinoma cells by activating TFE3-dependent autophagy.2022. Signal Transduction and Targeted Therapy.(IF 18.187)【客户文献】
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3.Pyridoxine induces glutathione synthesis via PKM2-mediated Nrf2 transactivation and confers neuroprotection. 2020. Nature Communications. (IF 14.919)【客户文献】
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4.Epithelial exosomal contactin-1 promotes monocyte-derived dendritic cells-dominant T cell responses in asthma. 2021. Journal of Allergy and Clinical Immunology. (IF 10.793)【客户文献】
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本节课程介绍了label-free定量蛋白质组学技术的原理及应用。主要包括:(1)以MS数据为例,系统介绍label-free技术进行蛋白质定量的技术流程和原理。(2)介绍免费的label-free分析套件—Maxquant和Perseus。(3)以免疫沉淀(IP)数据为例,展示label-free进行蛋白质互作定量的应用。(4)以数据为例,展示label-free在外泌体蛋白定量分析中的应用。
定量蛋白质组学分析 定量蛋白质组学分析(Quantitative Proteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白,结合生物信息学揭示细胞生理病理等功能,同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。目前定量蛋白质组学技术常见标记(Label)和非标记的(Label Free)定量策略。 定量蛋白质组学技术常见的几类主要包括:Label Free定量蛋白组分析、SILAC与免疫
Label-Free Proteomics of Serum
In this chapter we describe a method to analyze human serum with the goal of discovering disease-related changes in the serum proteome. The methodology is based on the removal of the six most abundant serum proteins by immunoaffinity
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