4D-label free定量蛋白质组学

· 产品定义

4D-label free蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的非标记定量蛋白组学技术，通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂（ddaPASEF）扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。该技术是对传统label free蛋白质组学的升级，其核心是将数据依赖采集（DDA）与同步累积连续碎裂（PASEF）相结合，外加第四维度的离子淌度分离（基于肽段的碰撞截面积CCS），提高离子利用率和准确度，以更少上样量、更快扫描速度，实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

 

· 技术路线

 

· 技术优势

1. 4D技术加持，更加适合微量样本

2. 可用于不同物种间的“有无差异蛋白”比较

3. 无标记定量蛋白质组学中的倍数压缩

4. 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制，灵活方便

5. 采用布鲁克的timsTOF Pro/Pro2质谱平台，检测速度提升近一倍

 

· 数据分析

 

· 推荐组合产品

组学“黄金”联合：4D-label free + 4D-label free磷酸化蛋白质组

 

· 推荐应用领域

1. 药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析

2. 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究

3. 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析

4. 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选

5. 各种物种的蛋白质组草图构建

6. 适合临床微量样本检测，如：外泌体、FFPE石蜡切片、活检穿刺组织等

 

· 送样建议

 

· 参考文献

1. A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of disease severity and specificity.Cell.2022

利用4D蛋白组学技术、单细胞测序等多种组学技术，系统分析不同严重程度的 COVID-19患者的多组学血液图谱，并与流感和败血症患者与健康志愿者进行综合比较分析

2. Synergistically Bifunctional Paramagnetic Separation Enables Efficient Isolation of Urine Extracellular Vesicles and Downstream Phosphoproteomic Analysis. ACS Appl Mater Interfaces. 2021.

4D-Labelfree蛋白组联合4D磷酸化蛋白组学分析前列腺癌患者和健康个体尿液外囊泡，找到一系列疾病相关的磷酸化蛋白，表明其在临床研究中的巨大应用潜力