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- 4D-label free定量蛋白质组学
- 2026年01月07日
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- 服务名称：
4D-label free定量蛋白质组学
- 提供商：
上海中科新生命生物科技有限公司
· 产品定义
4D-label free蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的非标记定量蛋白组学技术，通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂（ddaPASEF）扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。该技术是对传统label free蛋白质组学的升级，其核心是将数据依赖采集（DDA）与同步累积连续碎裂（PASEF）相结合，外加第四维度的离子淌度分离（基于肽段的碰撞截面积CCS），提高离子利用率和准确度，以更少上样量、更快扫描速度，实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
· 技术路线
· 技术优势
1. 4D技术加持，更加适合微量样本
2. 可用于不同物种间的“有无差异蛋白”比较
3. 无标记定量蛋白质组学中的倍数压缩
4. 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制，灵活方便
5. 采用布鲁克的timsTOF Pro/Pro2质谱平台，检测速度提升近一倍
· 数据分析
· 推荐组合产品
组学“黄金”联合：4D-label free + 4D-label free磷酸化蛋白质组
· 推荐应用领域
1. 药物应答、基因敲除/过表达的蛋白表达谱分析
2. 植物、微生物生长发育与胁迫逆境生理研究
3. 疾病生物标志物与药物作用靶点高通量分析
4. 蛋白作用机制与特殊功能蛋白质筛选
5. 各种物种的蛋白质组草图构建
6. 适合临床微量样本检测，如：外泌体、FFPE石蜡切片、活检穿刺组织等
· 送样建议
· 参考文献
1. A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of disease severity and specificity.Cell.2022
利用4D蛋白组学技术、单细胞测序等多种组学技术，系统分析不同严重程度的 COVID-19患者的多组学血液图谱，并与流感和败血症患者与健康志愿者进行综合比较分析
2. Synergistically Bifunctional Paramagnetic Separation Enables Efficient Isolation of Urine Extracellular Vesicles and Downstream Phosphoproteomic Analysis. ACS Appl Mater Interfaces. 2021.
4D-Labelfree蛋白组联合4D磷酸化蛋白组学分析前列腺癌患者和健康个体尿液外囊泡，找到一系列疾病相关的磷酸化蛋白，表明其在临床研究中的巨大应用潜力
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文献和实验本节课程介绍了label-free定量蛋白质组学技术的原理及应用。主要包括：（1）以MS数据为例，系统介绍label-free技术进行蛋白质定量的技术流程和原理。（2）介绍免费的label-free分析套件—Maxquant和Perseus。（3）以免疫沉淀（IP）数据为例，展示label-free进行蛋白质互作定量的应用。（4）以数据为例，展示label-free在外泌体蛋白定量分析中的应用。
行串联质谱分析，可同时比较4种或8种不同样品中蛋白质的相对含量或绝对含量。 iTRAQ技术特点： 不同样本标记之后混样，统一处理上机，减少了分别上机造成的实验误差，并利用同位素标签的丰度来检测，定量更准确，重复性更好； 由于需要标记试剂标记，因此成本相对较高； 通量高，在一次实验中最多可同时比较8个样品； 利用基于同一个参考样品的办法，可以进行多于8个样品的定量比较； iTRAQ的覆盖度高、灵敏度高。 Label-Free定量蛋白质组学分析 Label-Free定量，即非标记的定量蛋白质组学
备注： （1）普通 label free 要求量参考 DIA 2.0/ 4D-DIA/PRM； （2）细胞、组织、FFPE 石蜡样本低于最低送样量，可选择超微量提取方法。根据样本数，可选择在 Labonline 录制超微量 4D/480 Label free 或超微量 DIA 2.0 方案。
技术资料暂无技术资料 索取技术资料
