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- 2025年12月30日
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天根生化科技（北京）有限公司
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非标记定量蛋白质组服务
非标记（Label-free）定量蛋白质组是一种相对定量技术，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准。通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析后，根据一级质谱相关的肽段峰强度、峰面积、液相色谱保留时间等信息，基于肽段母离子强度，以 MS1 为定量基础，进行相对定量分析。该技术对样本的操作少，实验耗费低，从而使样本最接近原始状态、检测起始量低、单个样品单独分析，不受样品来源和数目的限制。
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文献和实验非标记定量蛋白质组学 (Label Free)近年来成为重要的质谱定量方法，按照其原理进行分类，可以分为两类。Spectrum counts类的非标记定量方法，发展比较早，也形成了多种算法进行定量，但是主要的原理都是根据MS2的鉴定结果作为定量的基础，各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。第二种非标记定量方法的原理是以MS1为基础，计算每个肽段信号在LCMS质谱上的积分，目前Label Free主要的数据分析方法是利用Maxquant软件，根据一级质谱相关的肽段峰强度、峰面积、液相
定量蛋白质组学分析 定量蛋白质组学分析（Quantitative Proteomics）是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白，结合生物信息学揭示细胞生理病理等功能，同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。目前定量蛋白质组学技术常见标记（Label）和非标记的（Label Free）定量策略。 定量蛋白质组学技术常见的几类主要包括：Label Free定量蛋白组分析、SILAC与免疫
本节课程介绍了label-free定量蛋白质组学技术的原理及应用。主要包括：（1）以MS数据为例，系统介绍label-free技术进行蛋白质定量的技术流程和原理。（2）介绍免费的label-free分析套件—Maxquant和Perseus。（3）以免疫沉淀（IP）数据为例，展示label-free进行蛋白质互作定量的应用。（4）以数据为例，展示label-free在外泌体蛋白定量分析中的应用。
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