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- 2025年07月14日
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RNA-seq数据生物信息学分析
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药明康德基因组学中心
基于药明康德基因组学中心测得的数据进行分析.
测序完成后30天内完成分析工作。
生物信息学分析内容：
测序完成后30天内完成分析工作。
生物信息学分析内容：
1.生物信息分析的概要。SUMMARY OF BIOINFORMATICS ANALYSIS
2.转录本汇总和丰度估算。TRANSCRIPT ASSEMBLY AND ABUNDANCE ESTIMATION
3.检测基因表达的差异度。DIFFERENTIALLY EXPRESSED GENES (DEGS) DETECTION
4.差异表达基因的功能和通路富集分析。GENE ONTOLOGY AND PATHWAY ENRICHMENT ANALYSIS OF DEGS
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文献和实验相关实验
1.1 定量分析的一般方法 1.2 绝对定量分析 · 绝对定量的原理 · 标准品的制作和稀释 · 绝对定量的数据计算 1.3 相对定量分析 · 双标准曲线法的原理和数据计算 · Ct值比较法的原理和数据计算 1.4 定量分析的应用 2.1 定性分析的一般方法 2.2 定性分析的概念和原理 2.3 探针法和染料法定性分析举例 2.4 定性分析的应用
Taq Talk 荧光定量 PCR 系列课程之【如何分析实时 PCR 数据？】选择用何种方法来分析实时 PCR 数据，取决于您想要了解的问题。在本期视频中，让我们一起来聊一聊针对常见研究的几种分析方法
下面我将通过一个实例分析 JC- 1 染色数据：1. 细胞模型是胶质瘤，给予阳性药 CCCP（线粒体脱偶联剂）处理后消化下来上机（FACScan）检测。2. 把 listmode 格式的原始数据文件拿回来，用 winMDI 2.9 或者 FlowJo 分析作图。3. 下面两个图是 density plot (密度图)，不是 dot plot (散点图)，一个点不代表一个细胞，而是代表染色强度相同的若干个细胞。我个人更喜欢 density plot，干净清爽，还是彩色的。4. 横轴示 FL
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