验证乳酸产生对EIMP的必要性
确定胞葬作用诱导的乳酸产生是否对EIMP至关重要。
使用LDHA抑制剂FX11或Ldha基因敲除的BMDMs和HMDMs,检测AC诱导的细胞增殖和Myc蛋白表达,并添加外源性乳酸进行恢复实验。
Efferocytosis-induced lactate enables the proliferation of pro-resolving macrophages to mediate tissue repair
包含体外细胞实验(BMDMs、HMDMs)、体内小鼠模型(地塞米松胸腺凋亡模型)、多种功能验证(LDHA敲除/抑制、SIRT1抑制、GPR132敲低等)和机制验证(Myc乙酰化、NAD+/NADH比例、SIRT1活性)。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 人单核细胞来源巨噬细胞(HMDMs) 地塞米松诱导胸腺细胞凋亡小鼠模型
LDHA活性抑制(FX11)或基因敲除(Ldhafl/fl;LysMCre+/−)对Myc蛋白和EIMP的影响 乳酸补充(10 mM)对Myc蛋白和EIMP的恢复作用 SIRT1活性(EX527抑制)对Myc蛋白和EIMP的影响 AMPK活性(Compound C抑制)对Myc蛋白和EIMP的影响 GPR132信号(telmisartan抑制、ONC212激活)对Myc蛋白和EIMP的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定胞葬作用诱导的乳酸产生是否对EIMP至关重要。
使用LDHA抑制剂FX11或Ldha基因敲除的BMDMs和HMDMs,检测AC诱导的细胞增殖和Myc蛋白表达,并添加外源性乳酸进行恢复实验。
确定乳酸是否通过抑制蛋白酶体降解来稳定Myc蛋白。
用蛋白酶体抑制剂MG132处理LDHA敲除或FX11处理的巨噬细胞,检测Myc蛋白水平;另外检测Myc乙酰化水平。
确定SIRT1是否作为乳酸下游效应器介导Myc去乙酰化和稳定。
检测SIRT1活性、表达,使用SIRT1抑制剂EX527或siRNA沉默SIRT1,评估对Myc蛋白和EIMP的影响。
确定乳酸是否通过激活AMPK升高NAD+/NADH比例,进而激活SIRT1。
检测AMPK磷酸化、NAD+/NADH比例,使用AMPK抑制剂Compound C或NMN补充,评估对Myc蛋白和EIMP的影响。
确定乳酸是否通过GPR132受体和PKA信号激活AMPK。
使用GPR132抑制剂telmisartan或siRNA沉默GPR132,以及PKA抑制剂H89,检测Myc蛋白和EIMP。
确定在生理情况下,LDHA依赖性乳酸产生是否对EIMP和凋亡细胞清除至关重要。
利用地塞米松诱导的胸腺细胞凋亡模型,对LDHA敲低小鼠的胸腺巨噬细胞进行免疫染色分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| L-929细胞条件培养基 | -- | -- | |
| 蛋白检测 | Laemmli样品缓冲液 | Bio-Rad | -- |
| β-巯基乙醇 | Sigma | -- | |
| SDS-PAGE梯度凝胶 | Invitrogen | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | -- | -- | |
| 抗SIRT1抗体 | CST | 9475 | |
| 抗LDHA抗体 | ProteinTech | 19987-1-AP | |
| 抗pAMPK抗体 | CST | 2535 | |
| 抗AMPK抗体 | CST | 5831 | |
| 抗pCREB抗体 | CST | 9198 | |
| 抗CREB抗体 | CST | 4820 | |
| 抗乙酰化cMyc抗体 | Sigma | ABE26 | |
| 抗cMyc抗体 | CST | 18583 | |
| 抗乙酰化赖氨酸抗体 | CST | 9681 | |
| 抗β-肌动蛋白HRP偶联物 | CST | 5125 | |
| HRP标记的抗小鼠IgG | CST | 7076 | |
| HRP标记的抗兔IgG | CST | 7074 | |
| 免疫沉淀 | Pierce IP裂解液 | ThermoFisher | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | ThermoFisher | -- | |
| Pierce蛋白A/G磁珠 | ThermoFisher | -- | |
| 对照兔IgG | CST | 3900 | |
| RapiGest SF表面活性剂 | Waters | 186001861 | |
| 免疫荧光 | Hoechst-33342 | CST | 4082 |
| 鸡抗兔AF647二抗 | Invitrogen | A-21443 | |
| 抗Ki67抗体 | abcam | ab16667 | |
| 抗Mac2抗体 | Cedarlane | CL8942LE | |
| 山羊抗兔AF488 | Invitrogen | A11034 | |
| 山羊抗大鼠AF647 | Invitrogen | A21247 | |
| 细胞处理 | FX11 | Sigma | -- |
| EX527 | Sigma | -- | |
| Compound C | Sigma | -- | |
| H89 | Sigma | -- | |
| MG132 | Sigma | -- | |
| 乳酸 | Sigma | -- | |
| 烟酰胺单核苷酸 | Sigma | -- | |
| 替米沙坦 | MedChemExpress | -- | |
| ONC212 | MedChemExpress | -- | |
| TAT-Cre重组酶 | Millipore | -- | |
| 分子生物学 | Lipofectamine RNAiMAX | Life Technologies | -- |
| Opti-MEM培养基 | Gibco | -- | |
| PureLink RNA小提试剂盒 | Life Technologies | -- | |
| NanoDrop分光光度计 | ThermoFisher | -- | |
| Superscript II反转录酶 | Applied Biosystems | -- | |
| 7500实时PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Power SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | -- | |
| 代谢检测 | 乳酸检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK064 |
| NAD/NADH比色检测试剂盒 | Abcam | -- | |
| SIRT1活性检测试剂盒 | Abcam | -- | |
| 细胞计数 | Countess II自动细胞计数仪 | Invitrogen | -- |
| 组织学 | 原位细胞死亡检测试剂盒 | Sigma | -- |
| 柠檬酸盐抗原修复液 | Vector | -- | |
| Leica荧光显微镜 | Leica | DM16000B |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞凋亡诱导 | Jurkat细胞凋亡诱导方法:紫外线照射15分钟;AC与巨噬细胞比例5:1;孵育时间45分钟 阅读提示:Methods: Generation of ACs and incubation with macrophages |
| 药物处理 | FX11浓度50 μM;EX527浓度10 μM;Compound C浓度10 μM;H89浓度10 μM;MG132浓度10 μM;乳酸浓度10 mM;NMN浓度500 μM;telmisartan浓度10 μM;ONC212浓度20 μM 阅读提示:Methods: Generation of ACs and incubation with macrophages |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种密度:BMDMs 100,000/孔(12孔板);AC处理后追踪24小时;HMDMs用0.25%胰蛋白酶消化 阅读提示:Methods: Cell counting |
| 蛋白表达检测 | 抗体稀释比例:anti-cMyc 1:1000;anti-SIRT1 1:1000;anti-pAMPK 1:1000等 阅读提示:Methods: Immunoblotting |
| 体内模型 | 小鼠:雄性C57BL/6J,8-10周龄;照射剂量10 Gy;骨髓移植细胞数2.5×10^6;地塞米松剂量250 μg;取材时间18小时 阅读提示:Methods: Experimental animals, BMT, Dexamethasone-thymus assay |