TRAF3在脂肪变性肝脏中的表达验证
确认TRAF3在NAFLD患者和小鼠脂肪变性肝脏中是否上调及定位。
检测NAFLD患者肝活检样本、HFD喂养小鼠肝脏及棕榈酸处理的原代肝细胞中TRAF3 mRNA和蛋白表达,并用免疫荧光共定位HNF4。
Hepatocyte TRAF3 promotes liver steatosis and systemic insulin resistance through targeting TAK1-dependent signalling.
包含肝特异性敲除/转基因小鼠、ob/ob小鼠、原代肝细胞和细胞系多层级验证,并有TAK1抑制剂及突变体机制验证。
肝特异性TRAF3敲除(TRAF3-LKO)小鼠 肝特异性TRAF3转基因(TRAF3-LTG)小鼠 ob/ob小鼠 原代小鼠肝细胞及L-02细胞系
HFD喂养24周诱导肝脏脂肪变性模型 TRAF3-LKO与TRAF3-flox、TRAF3-LTG与NTG分组对比 原代肝细胞棕榈酸(0.25 mM)处理24小时 TAK1抑制剂5Z-7-ox腹腔注射5 mg/kg每周连续24周 Adca-TAK1/Addn-TAK1或AdTRAF3-M腺病毒干预
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认TRAF3在NAFLD患者和小鼠脂肪变性肝脏中是否上调及定位。
检测NAFLD患者肝活检样本、HFD喂养小鼠肝脏及棕榈酸处理的原代肝细胞中TRAF3 mRNA和蛋白表达,并用免疫荧光共定位HNF4。
验证肝细胞TRAF3缺失对HFD诱导的肥胖、胰岛素抵抗和肝脏脂肪变性的影响。
构建TRAF3-LKO小鼠,HFD喂养24周,检测体重、内脏脂肪、FBG、FINS、HOMA-IR、GTT、ITT、胰岛素信号蛋白、糖原含量及糖异生基因表达。
验证肝细胞TRAF3过表达是否加剧HFD诱导的肥胖和胰岛素抵抗。
构建TRAF3-LTG小鼠(LTG4品系),HFD喂养24周,检测体重、内脏脂肪、FBG、FINS、HOMA-IR、GTT、ITT、胰岛素信号及糖异生。
验证TRAF3对肝脏脂质蓄积、肝功能及炎症反应的影响。
检测肝脏重量、H&E和油红O染色、肝脏TG/TC/NEFA含量、血清ALT/AST/ALP、炎症因子及NF-κB信号;并在L-02细胞中敲低或过表达TRAF3后棕榈酸处理检测脂质蓄积。
验证TRAF3在遗传性肥胖模型中对胰岛素抵抗和肝脏脂肪变性的作用。
8周龄雌性ob/ob小鼠颈静脉注射AdshTRAF3(5×10^9 pfu)敲低肝脏TRAF3,检测胰岛素抵抗、糖耐量、肝脏脂肪变性和炎症。
验证TRAF3是否通过TAK1–JNK/NF-κB通路调控肝脏脂肪变性。
检测HFD或棕榈酸处理下MKK7–JNK–C-JUN和TAK1磷酸化;在原代肝细胞中过表达或敲低TAK1(Adca-TAK1/Addn-TAK1)后检测胰岛素信号、糖异生和脂质蓄积。
验证TAK1激活在TRAF3调控的肝脏脂肪变性中的必要性。
给NTG和TRAF3-LTG小鼠腹腔注射TAK1抑制剂5Z-7-ox,检测体重、胰岛素抵抗、肝脏脂质蓄积及信号通路。
验证TRAF3与TAK1是否直接结合并确定结合结构域。
免疫共沉淀验证TRAF3与TAK1结合;使用截短突变体定位TRAF3(267–376 aa)和TAK1(481–579 aa)结合域;注射AdTRAF3-M(缺失结合域突变体)验证相互作用必要性。
验证TRAF3是否作为E3泛素连接酶促进TAK1泛素化。
体内外泛素化实验检测TAK1泛素化;使用TRAF3 E3连接酶失活突变体(C68A, H70A)验证泛素化对脂质代谢调控的必要性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | TRAF3抗体 | Cell Signaling Technology | 4729 |
| 磷酸化IRS1 Ser307抗体 | Cell Signaling Technology | 2831 | |
| IRS1抗体 | Cell Signaling Technology | 2832 | |
| 磷酸化AKT Ser473抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 磷酸化GSK3β抗体 | Cell Signaling Technology | 9322 | |
| GSK3β抗体 | Cell Signaling Technology | 9315 | |
| FOXO1抗体 | Cell Signaling Technology | 2880 | |
| PEPCK抗体 | Cell Signaling Technology | 6924 | |
| IKKβ抗体 | Cell Signaling Technology | 2370 | |
| 磷酸化IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 9246 | |
| IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 4814 | |
| 磷酸化P65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| P65抗体 | Cell Signaling Technology | 4764 | |
| MKK7抗体 | Cell Signaling Technology | 4172 | |
| 磷酸化JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 4668 | |
| JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9252 | |
| 磷酸化C-JUN Ser73抗体 | Cell Signaling Technology | 9164 | |
| 磷酸化C-JUN Ser63抗体 | Cell Signaling Technology | 2361 | |
| 磷酸化TAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 9339 | |
| TAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 4505 | |
| GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 2118 | |
| 磷酸化IRS1 Tyr608抗体 | Merck Millipore | 09-432 | |
| 磷酸化IKKβ抗体 | Abcam | ab5915 | |
| 磷酸化FOXO1抗体 | ORIGENE | TA323072 | |
| G6Pase抗体 | AVIVA SYSTEMS BIOLOGY | ARP44223-P050 | |
| 磷酸化MKK7抗体 | AVIVA SYSTEMS BIOLOGY | OAAF05547 | |
| Myc抗体 | Roche | 11814150001 | |
| Flag抗体 | Sigma | F3165 | |
| BCA蛋白测定试剂盒 | Pierce | 23225 | |
| 过氧化物酶标记二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | -- | |
| 细胞培养 | 胎牛血清 | Gibco | -- |
| 免疫荧光 | HNF4抗体 | Abcam | ab41898 |
| TRAF3抗体 | Abcam | ab76147 | |
| 山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | -- | |
| 抗兔IgG | Invitrogen | -- | |
| 原代肝细胞分离 | 肝脏灌注培养基 | Life Technologies | 17701-038 |
| 肝脏消化培养基 | Life Technologies | 17703-034 | |
| Percoll分离液 | GE Healthcare Life Sciences | 17-0891-01 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Sigma | -- |
| 青霉素-链霉素 | Sigma | -- | |
| 细胞处理 | 棕榈酸 | Sigma-Aldrich | -- |
| 代谢检测 | 血糖仪 | Life Scan | -- |
| 胰岛素ELISA试剂盒 | Millipore | -- | |
| 葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 胰岛素 | Novo Nordisk | -- | |
| 细胞因子ELISA试剂盒 | R&D; MBL; RayBio; Invitrogen; Peprotech | -- | |
| 肝脏脂质测定 | 甘油三酯测定试剂盒 | Wako | 290-63701 |
| 总胆固醇测定试剂盒 | Wako | 294-65801 | |
| 非酯化脂肪酸测定试剂盒 | Wako | 294-63601 | |
| 组织学分析 | OCT包埋剂 | Sakura Finetek | -- |
| 糖原测定 | 糖原测定试剂盒 | BioVision | -- |
| 肝功能检测 | ADVIA 2400化学分析仪 | Siemens | -- |
| 肝葡萄糖生成实验 | 葡萄糖检测试剂盒 | Fisher Scientific Inc. | -- |
| 细胞内甘油三酯测定 | 甘油三酯比色测定试剂盒 | Cayman | -- |
| RT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596-026 |
| Transcriptor第一链cDNA合成试剂盒 | Roche | 04896866001 | |
| SYBR Green | Roche | 04887352001 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Sigma | -- |
| SDS-PAGE凝胶 | Invitrogen | NP0301BOX | |
| PVDF膜 | Millipore Corporation | IPVH00010 | |
| ChemiDoc MP成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| 免疫共沉淀 | FuGENE转染试剂 | Roche | -- |
| Protein A/G琼脂糖珠 | Roche | 11719394001, 11719386001 | |
| 体内泛素化实验 | 蛋白酶抑制剂片剂 | Roche | -- |
| 体外泛素化实验 | TNT快速偶联转录/翻译系统试剂盒 | Promega | -- |
| 泛素化试剂盒 | Enzo Life Sciences | -- | |
| 动物实验 | 5Z-7-oxozeaenol(TAK1抑制剂) | Sigma | O9890-1MG |
| 高脂饲料 | Research Diets | D12492 | |
| 正常饲料 | Research Diets | D12450B |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| HFD诱导肝脏脂肪变性模型 | 小鼠性别(雄性)、年龄(8–10周)、体重(24–27 g)、HFD配方(D12492,脂肪61.6%)、喂养时长24周 阅读提示:Methods中Animals and treatment小节 |
| TRAF3-LKO和TRAF3-LTG小鼠分组 | TRAF3-flox或NTG对照设置、每组样本量(n=6–25,因实验而异)、遗传背景(C57BL/6J) 阅读提示:Methods中Animals and treatment小节及对应Figure legends |
| 原代肝细胞棕榈酸处理 | 小鼠年龄(6–8周)、棕榈酸浓度0.25 mM、处理时间24小时、细胞活力>95% 阅读提示:Methods中Primary hepatocyte isolation and culture小节及Figure 1f、5c、6b/d图注 |
| TAK1抑制剂5Z-7-ox体内给药 | 给药剂量5 mg/kg、腹腔注射、每周一次、持续24周、溶剂对照(DMSO) 阅读提示:Methods中Animals and treatment小节及Figure 7a图注 |
| 腺病毒介导基因干预 | AdshTRAF3剂量5×10^9 pfu颈静脉注射、ob/ob小鼠周龄8周、Adca-TAK1/Addn-TAK1或AdTRAF3-M感染原代肝细胞的条件 阅读提示:Methods中Animals and treatment小节及Figure 6e–h、8e–n图注 |
| GTT和ITT | 葡萄糖剂量1 g/kg、胰岛素剂量0.75 U/kg、采血时间点0、15、30、60、120分钟 阅读提示:Methods中Metabolic assays and serum cytokine analyses小节 |