生物信息学分析及动物模型验证OA病理进展特征
探究OA进展中滑膜炎症与软骨细胞焦亡的时序关系
分析scRNA-seq数据集GSE220243、GSE176308、GSE152805和bulk RNA-seq数据集GSE114007,进行UMAP聚类、伪时间分析、GO/KEGG富集、PPI网络分析;构建大鼠CIOA模型,在Day 7和Day 28进行组织学染色验证
Pathological progression features-guided biphasic drug delivery supramolecular hydrogel for synergistic cartilage protection in osteoarthritis
包含生物信息学分析、体外细胞实验、共培养体系及大鼠OA模型体内验证,并进行了功能与机制验证
RAW264.7巨噬细胞 原代软骨细胞 Transwell共培养体系 胶原酶诱导的大鼠OA模型
大鼠OA模型:30只雄性SD大鼠,随机分为5组,每组6只, collagenase VII注射造模,第1周和第4周关节腔注射50 μL PBS、DS@cLip(DS: 2.5 μg/kg)、SP Gel(SP: 0.05 mg/kg)或SP Gel/DS@cLip(SP: 0.05 mg/kg; DS: 2.5 μg/kg) 体外巨噬细胞极化:RAW264.7细胞经100 ng/mL LPS预孵育6 h,水凝胶提取物处理12 h,流式检测iNOS和CD206 体外软骨细胞焦亡:原代软骨细胞经LPS/NIG诱导焦亡,透析液干预,检测GSDMD-N和LDH 水凝胶表征:流变学测试频率0.1–100 rpm、应变1%;自愈合交替应变1%和500%;摩擦测试振幅4 mm、频率1 Hz、时间600 s 药物释放:透析袋(MWCO 3500 Da)在PBS或1 mmol/L H2O2中37 °C振荡,HPLC检测DS,茚三酮法检测SP
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究OA进展中滑膜炎症与软骨细胞焦亡的时序关系
分析scRNA-seq数据集GSE220243、GSE176308、GSE152805和bulk RNA-seq数据集GSE114007,进行UMAP聚类、伪时间分析、GO/KEGG富集、PPI网络分析;构建大鼠CIOA模型,在Day 7和Day 28进行组织学染色验证
构建具有可注射性、自愈合、润滑和ROS响应释放性能的水凝胶系统
制备DS@cLip阳离子脂质体,与HA-PBA和SP混合形成B–N配位交联水凝胶;检测zeta电位、粒径、TEM形态、流变学、SEM、可注射性、自愈合、摩擦系数、ROS响应降解和药物释放
验证SP Gel/DS@cLip快速释放SP对巨噬细胞极化的调控作用
RAW264.7巨噬细胞经LPS刺激后,用水凝胶提取物(Day 1、4、7)处理,流式检测M1/M2标志物,Western blot检测CD86、ARG1、p-P65,ELISA检测炎症因子
验证SP Gel/DS@cLip持续释放DS对软骨细胞焦亡的抑制作用
原代软骨细胞经LPS/NIG诱导焦亡,用DS@cLip或SP Gel/DS@cLip透析液(Day 1、4、7、14、21、28)干预,检测GSDMD-N活性、LDH释放、焦亡相关蛋白表达
验证双相释放SP和DS对巨噬细胞和软骨细胞的协同调控作用
LPS刺激的巨噬细胞与LPS/NIG诱导的软骨细胞在Transwell体系中共培养,用水凝胶提取物(Day 1、4、21)处理,检测M1比例、GSDMD-N活性、焦亡蛋白、COL II/MMP3/MMP13表达及ECM分泌
验证SP Gel/DS@cLip在体内的双相释放行为和软骨保护效果
大鼠CIOA模型造模后第1周和第4周关节腔注射PBS、DS@cLip、SP Gel或SP Gel/DS@cLip,第7周处死,进行组织学染色、OARSI评分、GAG含量测定、免疫组化和免疫荧光分析
验证SP和DS在体内的双相释放动力学
将Cy5(模拟SP)和IR780(模拟DS)标记的水凝胶注射到大鼠关节腔,用IVIS Spectrum进行4周活体成像
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 脂质体制备 | 胆固醇 | Aladdin | C476640 |
| 卵磷脂 | Aladdin | L426059 | |
| 十八胺 | Aladdin | O108436 | |
| 药物处理 | 双硫仑 | Sigma–Aldrich | 97-77-8 |
| 硫酸链霉素 | Sigma–Aldrich | 3810-74-0 | |
| 大鼠OA模型 | 胶原酶VII | Sigma–Aldrich | 9001-12-1 |
| 细胞刺激 | 脂多糖 | Sigma–Aldrich | 93572-42-0 |
| 尼日利亚菌素 | Sigma–Aldrich | 28380-24-7 | |
| 水凝胶制备 | 透明质酸 | Bidepharm | H131007 |
| 亚精胺 | Bidepharm | S107071 | |
| 1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺 | Mreda | M042869 | |
| 羟基苯并三唑 | Mreda | M109756 | |
| 细胞培养 | 磷酸盐缓冲液 | Gibco | 10010023 |
| Dulbecco改良Eagle培养基 | Gibco | 11965092 | |
| 胎牛血清 | Gibco | A5256701 | |
| ROS检测 | 2′,7′-二氯荧光素二乙酸酯 | Solarbio | D6470 |
| 软骨细胞分离 | 胶原酶II | Solarbio | C8150 |
| 细胞毒性检测 | 活/死细胞染色试剂盒 | Beyotime | C1070S-2 |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | C0041 |
| 流式分析 | PE-iNOS抗体 | BioLegend | 696805 |
| APC-CD206抗体 | BioLegend | 321109 | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0038-1 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | P0012S |
| Western blot | 抗CD86抗体 | Proteintech | 13395-1-AP |
| 抗ARG1抗体 | Santa Cruz | sc-271430 | |
| 抗磷酸化P65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 抗P65抗体 | Abmart | T55034 | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | CL594-60004 | |
| ELISA | IL-6检测试剂盒 | mmbio | 1011M1 |
| TNF-α检测试剂盒 | Beyotime | PT512 | |
| TGF-β检测试剂盒 | mmbio | 46344M2 | |
| IL-10检测试剂盒 | NJBYBIO | BYGR500005 | |
| GSDMD-N ELISA试剂盒 | MMBIO | 45633M2 | |
| 免疫荧光 | 抗NLRP3抗体 | affinity | DF7438 |
| 抗Cleaved caspase 1抗体 | affinity | AF4005 | |
| 抗Cleaved GSDMD抗体 | affinity | AF4012 | |
| 抗COL II抗体 | Proteintech | 28459-1-AP | |
| 抗MMP13抗体 | Proteintech | 18165-1-AP | |
| Western blot | 抗TUBULIN抗体 | affinity | AF7011 |
| 蛋白分子量标准(10–180 kDa) | Biosharp | BL712A | |
| 免疫组化 | 抗TNF-α抗体 | Cell Signaling Technology | 3707 |
| TUNEL实验 | TUNEL检测试剂盒 | Beyotime | C1176S |
| 药物释放 | 透析袋(截留分子量3500 Da) | Sigma–Aldrich | -- |
| SP检测 | 茚三酮试剂 | Aladdin | N100253 |
| 摩擦测试 | 聚乙烯球(直径8 mm) | Nanjing Qunlong Glass | QP008 |
| 流变学测试 | 旋转流变仪 | Anton Paar | MCR 302 |
| 形貌观察 | 扫描电子显微镜 | Hitachi | SU8220 |
| 摩擦测试 | 通用材料试验机 | Bruker-CETR | UMT-2 |
| DS检测 | 高效液相色谱仪 | Wookinglab | K2025 |
| 吸光度检测 | 酶标仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 活体成像 | IVIS Spectrum活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
| 荧光检测 | 荧光显微镜 | -- | LSM 880 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 大鼠OA模型构建与给药 | 大鼠品系、性别、周龄、样本量(30只雄性SD大鼠,6–7周龄,随机分5组每组6只);造模方式(胶原酶VII注射第1天和第3天);给药时间(第1周和第4周);给药剂量(DS@cLip: DS 2.5 μg/kg;SP Gel: SP 0.05 mg/kg;SP Gel/DS@cLip: SP 0.05 mg/kg + DS 2.5 μg/kg);给药体积(50 μL关节腔注射);观察终点(第7周处死) 阅读提示:Methods 2.7节和Figure 6A |
| 体外巨噬细胞极化实验 | 细胞系(RAW264.7);刺激条件(100 ng/mL LPS预孵育6 h);水凝胶提取物处理时间(12 h);提取物浓度(DS@cLip: DS 10 μg/mL;SP Gel: SP 0.2 mg/mL;SP Gel/DS@cLip: SP 0.2 mg/mL + DS 10 μg/mL);检测指标(iNOS/CD206流式、CD86/ARG1/p-P65 Western blot、IL-6/TNF-α/NO/TGF-β/IL-10 ELISA) 阅读提示:Methods 2.4节和Figure 3 |
| 体外软骨细胞焦亡实验 | 细胞类型(原代软骨细胞);焦亡诱导条件(LPS/NIG);透析液收集时间点(DS@cLip: Day 1、4、7;SP Gel/DS@cLip: Day 1、4、7、14、21、28);干预时间(24 h);检测指标(GSDMD-N ELISA、LDH释放、NLRP3/cleaved caspase 1/cleaved GSDMD/IL-18蛋白表达) 阅读提示:Methods 2.5节和Figure 4 |
| 共培养体系实验 | 共培养方式(Transwell体系);细胞刺激条件(巨噬细胞LPS刺激12 h,软骨细胞LPS/NIG刺激12 h);共培养时间(12 h);水凝胶提取物处理时间(24 h);提取物时间点(Day 1、4、21);检测指标(M1比例、GSDMD-N活性、焦亡蛋白、COL II/MMP3/MMP13、番红O染色、CCK-8、PI染色) 阅读提示:Methods 2.6节和Figure 5 |
| 水凝胶制备与表征 | HA-PBA和SP浓度(50 mg HA-PBA + 60 mg SP溶于1 mL PBS);混合比例(5:1 v:v);凝胶化条件(3 min at 25 °C);流变学测试参数(频率0.1–100 rpm,应变1%);自愈合测试(交替应变1%和500%,各60 s);摩擦测试参数(振幅4 mm,频率1 Hz,时间600 s) 阅读提示:Methods 2.3节和Figure 2 |
| 体内双相释放成像 | 动物数量(3只雄性SD大鼠,6–7周龄);标记物(Cy5模拟SP,IR780模拟DS);成像时间点(Day 1、3、7、14、21、28) 阅读提示:Methods 2.8节和Figure 6B–C |