临床样本E蛋白与凝血指标关联分析
评估COVID-19患者血清E蛋白水平与血栓及凝血障碍的关系。
用直接ELISA检测145例COVID-19患者入院时及51例健康供者血清E蛋白,分析其与APTT、PT、D-二聚体、FDP、血小板计数及血栓事件的相关性。
CD36 mediates SARS-CoV-2-envelope-protein-induced platelet activation and thrombosis.
含患者血清队列、人/鼠血小板体外功能、蛋白互作、RNA-seq及两种小鼠血栓模型,并有CD36缺失和药物阻断的功能验证。
145例COVID-19患者及51例健康供者血清样本 健康供者及COVID-19患者来源的人血小板 C57BL/6野生型与CD36−/−小鼠 小鼠肺栓塞模型和IVC狭窄血栓模型
E蛋白血清水平:31/145例COVID-19患者阳性,重症组显著高于非重症组 小鼠静脉注射E蛋白剂量:0.5、1、2、4 μg/只,仅4 μg增强肺栓塞 CD36−/−小鼠与WT小鼠在E蛋白(4 μg/只)处理后的肺栓塞和IVC血栓重量比较 SB203580(10 μM体外;10 mg/kg腹腔注射体内)对p38的抑制效果 FA6-152抗CD36抗体10 μg/mL对血小板活化的阻断
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估COVID-19患者血清E蛋白水平与血栓及凝血障碍的关系。
用直接ELISA检测145例COVID-19患者入院时及51例健康供者血清E蛋白,分析其与APTT、PT、D-二聚体、FDP、血小板计数及血栓事件的相关性。
验证循环E蛋白是否在体内增强血栓形成。
野生型小鼠静脉注射不同剂量E蛋白或PBS,4小时后建立胶原加肾上腺素诱导的肺栓塞模型,或建立IVC狭窄模型,检测肺血栓数量和血栓重量。
探究E蛋白是否直接激活人血小板及其细胞内信号通路。
健康供者洗涤血小板与E蛋白或S蛋白预孵育,检测ADP诱导的聚集、P-选择素暴露、纤维蛋白原结合、铺展和血块回缩;用RNA-seq和Western blot分析p38、NF-κB、ERK、JNK磷酸化;用SB203580抑制p38。
筛选并验证血小板表面与E蛋白结合的受体。
用人血小板裂解液与固定化His标签E蛋白进行pull-down,质谱鉴定结合蛋白;用SPR、重组蛋白pull-down、共免疫沉淀和固相ELISA验证E蛋白与CD36的直接结合。
验证CD36在E蛋白诱导血小板活化中的功能作用。
用人血小板与抗CD36抗体FA6-152预孵育,再用E蛋白处理,检测血小板聚集、P-选择素暴露、纤维蛋白原结合、铺展、血块回缩及p38/NF-κB磷酸化。
在体内验证CD36和p38在E蛋白促血栓中的作用。
在CD36−/−和WT小鼠中静脉给予E蛋白后建立肺栓塞或IVC狭窄模型,比较血栓;WT小鼠腹腔注射SB203580或DMSO后给予E蛋白并建立IVC模型;分离CD36−/−小鼠血小板检测体外活化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血清E蛋白检测 | 重组SARS-CoV-2 E蛋白 | ABclonal Technology | RP01263 |
| 兔抗SARS-CoV-2包膜蛋白抗体 | Novus biologicals | NBP3-07959 | |
| 山羊抗兔辣根过氧化物酶(HRP)标记抗体 | Cell Signaling Technology | 7074S | |
| 血浆CD62P检测 | 可溶性CD62P酶联免疫吸附试剂盒 | R&D Systems | DY137 |
| 血小板功能实验 | SARS-CoV-2 S蛋白 | ABclonal Technology | RP01283LQ |
| SB203580 | Selleck Chemicals | -- | |
| FA6-152抗CD36抗体 | Abcam | ab17044 | |
| 流式细胞术 | PE标记抗CD62P抗体 | Becton Dickinson Biosciences | 555524 |
| AF647标记纤维蛋白原 | Life Technologies | F35200 | |
| APC标记抗CD41抗体 | Becton Dickinson Biosciences | 559777 | |
| FITC标记抗CD45抗体 | Becton Dickinson Biosciences | 555482 | |
| RNA提取 | miRNeasy Mini试剂盒 | QIAGEN | -- |
| 免疫印迹 | 抗磷酸化p38抗体 | CST | 4511 |
| 抗p38抗体 | CST | 8690 | |
| 抗磷酸化NF-κB p65抗体 | CST | 3033 | |
| 抗NF-κB p65抗体 | CST | 8242 | |
| 抗磷酸化ERK抗体 | CST | 4370 | |
| 抗ERK抗体 | CST | 4695 | |
| 抗磷酸化JNK抗体 | CST | 4668 | |
| 抗JNK抗体 | CST | 9258 | |
| 抗ICAM-1抗体 | CST | 4915 | |
| 抗VCAM-1抗体 | CST | 13662 | |
| 抗人CD36抗体 | R&D Systems | MAB1955 | |
| 抗小鼠CD36抗体 | Santa Cruz | sc-7309 | |
| 抗His标签抗体 | ABclonal Technology | AE003 | |
| 抗人IgG Fc(HRP)抗体 | Abcam | ab97225 | |
| 生物素标记抗SARS-CoV-2包膜蛋白抗体 | Abcam | ab284658 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Beyotime Biotechnology | AF5003 | |
| HRP标记抗兔IgG | CST | 7074S | |
| HRP标记抗小鼠IgG | Beyotime Biotechnology | A0216 | |
| HRP标记抗大鼠IgG | CST | 7077 | |
| His pull-down | Pierce His蛋白相互作用pull-down试剂盒 | Thermo Scientific | 21277 |
| 重组人CD36蛋白 | Novoprotein | CP94 | |
| 表面等离子体共振 | PBS-P缓冲液 | Cytiva | 273923 |
| 共免疫沉淀 | 同型对照IgG | Cell Signaling Technology | 5415 |
| 免疫荧光染色 | 大鼠抗CD41抗体 | Becton Dickinson Biosciences | 553847 |
| Alexa Fluor 488抗体标记试剂盒 | Invitrogen | A20181 | |
| 兔抗SARS-CoV-2 E蛋白抗体 | Novus biologicals | NBP3-07060 | |
| CY3标记二抗 | Sigma-Aldrich | AP132C | |
| CY5标记二抗 | Sigma-Aldrich | AP500S | |
| DAPI | Invitrogen | -- | |
| Alexa Fluor 488标记二抗 | Beyotime Biotechnology | A0423 | |
| Alexa Fluor 594标记二抗 | YEASEN | 33212ES60 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本与E蛋白检测 | 患者分组标准(重症/非重症)、样本量、健康对照匹配方式、ELISA标准曲线与cut-off值 阅读提示:Methods“Patient enrollment”和“Measurement of SARS-CoV-2 E protein in serum”;Fig. 1a |
| 小鼠肺栓塞模型 | E蛋白剂量(0.5、1、2、4 μg/只)、给药途径与时间(静脉注射,4小时后诱导)、胶原/肾上腺素剂量、每组小鼠数及计数方法 阅读提示:Methods“Pulmonary embolism model”;Fig. 2a、d |
| 小鼠IVC狭窄模型 | E蛋白剂量(4 μg/只)、结扎后取材时间(18小时)、SB203580剂量(10 mg/kg)及给药时间(E蛋白前2小时)、每组小鼠数 阅读提示:Methods“Inferior vena cava (IVC) stenosis model”;Fig. 2e–g、Fig. 6f、g |
| 人血小板体外活化实验 | E蛋白浓度(0.5、1、2 μg/mL)、预孵育时间(5分钟,37°C)、ADP浓度(10 μM)、凝血酶浓度(0.05或1 U/mL)、抑制剂浓度与预处理时间(SB203580 10 μM 10分钟;FA6-152 10 μg/mL 10分钟)、重复数(n=4或5) 阅读提示:Methods“Platelet aggregation assay”“Platelet spreading assay”“Clot retraction”“Fibrinogen binding and P-selectin exposure assay”;Fig. 3、Fig. 4f–m、Fig. 5e–l |
| CD36与E蛋白互作验证 | SPR CD36浓度范围(400–12.5 nM)、固相ELISA E蛋白浓度(10–1000 ng/mL)、pull-down重组CD36用量(10 μg)、共免疫沉淀抗体浓度(10 μg/mL) 阅读提示:Methods“Surface plasmon resonance (SPR)”“His-tag pull-down assay and mass spectrometry”“Co-immunoprecipitation”“Interaction of E protein with CD36 in a solid phase assay”;Fig. 5a–d |