FBXW7缺失对DNA病毒诱导信号通路的影响
探究FBXW7在cGAS-MITA通路中的作用
用HSV-1感染对照和FBXW7-KO THP-1细胞,免疫印迹检测MITA、TBK1、IRF3、IKK、IκBα、p65、STAT1/2的磷酸化;qPCR检测IFNB1、TNFA、IFIT1、CXCL10等基因转录。
FBXW7 is a multifaceted regulator of the innate immune response to DNA viruses
包含THP-1和HEK293细胞体外实验、基因敲除、小鼠BMDM及条件敲除小鼠体内验证,并有机制验证。
人THP-1单核细胞系 HEK293细胞系 小鼠BMDM 髓系细胞特异性Fbxw7条件敲除小鼠
FBXW7-KO THP-1细胞中HSV-1诱导的MITA/TBK1/IRF3和IKK/NF-κB磷酸化增加,而STAT1/2水平及磷酸化降低 FBXW7介导SLC35B2/3的K48连接多泛素化和降解,且SLC35B2 Ser264和四个C端赖氨酸残基、SLC35B3 Ser56和K375是关键位点 DNA病毒感染通过PI3K-AKT使GSK3α/β磷酸化失活,从而抑制FBXW7对SLC35B2的降解 Lyz2+-Fbxw7f/f小鼠HSV-1感染后Ifn-β分泌早期升高、晚期降低,Cxcl1分泌增加 FBXW7通过降解MYC维持STAT1/2和ISG基础表达
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究FBXW7在cGAS-MITA通路中的作用
用HSV-1感染对照和FBXW7-KO THP-1细胞,免疫印迹检测MITA、TBK1、IRF3、IKK、IκBα、p65、STAT1/2的磷酸化;qPCR检测IFNB1、TNFA、IFIT1、CXCL10等基因转录。
验证GSK3α/β是否与FBXW7类似地调控MITA通路
用HSV-1感染GSK3A-KO、GSK3B-KO和GSK3A/B-DKO THP-1细胞,免疫印迹和qPCR检测信号分子磷酸化及基因转录。
寻找FBXW7调控cGAS-MITA通路的下游底物
对对照、FBXW7-KO和FBXW7α回补的THP-1细胞进行RNA-seq和质谱分析,鉴定FBXW7缺失后蛋白水平升高且mRNA不变的ER-高尔基膜蛋白,发现SLC35B2/3。
验证FBXW7是否直接结合并介导SLC35B2/3的泛素化降解
共免疫沉淀、结构域定位、CHX追踪、蛋白酶体/溶酶体/自噬抑制剂处理、泛素化实验检测FBXW7对SLC35B2/3的K48连接多泛素化和降解。
确定GSK3α/β磷酸化SLC35B2/3的具体残基及其对FBXW7介导降解的影响
序列分析发现SPxxS/T motif,突变SLC35B2 Ser264和SLC35B3 Ser56,检测FBXW7α介导的降解;鉴定SLC35B2 C端四个赖氨酸和SLC35B3 K375为泛素化位点。
探究FBXW7是否通过降解MYC维持STAT1/2和ISG表达
检测FBXW7-KO细胞中MYC蛋白水平;MYC-KO细胞中HSV-1/SeV/IFN-β诱导的ISG转录和STAT1/2磷酸化;FBXW7与MYC共定位和共免疫沉淀;FBXW7-MYC双敲除细胞中ISG表达。
阐明DNA病毒感染如何调控FBXW7对SLC35B2的降解
用PI3K抑制剂LY294002和AKT抑制剂MK-2206处理THP-1细胞,检测HSV-1诱导的GSK3αSer21/GSK3βSer9磷酸化、FBXW7与SLC35B2的相互作用及SLC35B2蛋白水平;细胞组分分离检测不同亚细胞定位。
评估FBXW7在体内的生理相关性
构建髓系细胞特异性Fbxw7敲除小鼠(Lyz2+-Fbxw7f/f),制备BMDM检测HSV-1诱导的信号和基因转录;尾静脉注射HSV-1后检测血清Ifn-β和Cxcl1,记录生存率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | FBXW7α抗体 | BETHYL | A301-721A |
| FBXW7抗体 | proteintech | 28424 | |
| GSK3α/β抗体 | CST | 5676 | |
| 磷酸化GSK3α/β S21/9抗体 | CST | 9331 | |
| c-MYC抗体 | CST | 18583 | |
| MITA抗体 | CST | 13647 | |
| 磷酸化MITA S366抗体 | CST | 50907 | |
| TBK1抗体 | Abcam | ab40676 | |
| 磷酸化TBK1 S172抗体 | Abcam | ab109272 | |
| IRF3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc33641 | |
| 磷酸化IRF3 S396抗体 | CST | 4947 | |
| IKKβ抗体 | CST | 2370 | |
| 磷酸化IKKα/β S176/177抗体 | CST | 2078 | |
| IKKγ抗体 | CST | 2685 | |
| 磷酸化IKKγ S376抗体 | CST | 2689 | |
| IκBα抗体 | CST | 9242 | |
| 磷酸化IκBα S32/36抗体 | CST | 9246 | |
| p65抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-372 | |
| 磷酸化p65 S536抗体 | CST | 3033 | |
| JAK1抗体 | CST | 3332 | |
| 磷酸化JAK1 S1034/1035抗体 | CST | 74129 | |
| STAT1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-346 | |
| 磷酸化STAT1 Y701抗体 | CST | 9167 | |
| STAT2抗体 | CST | 72604 | |
| 磷酸化STAT2 Y690抗体 | CST | 88410 | |
| RIG-I抗体 | CST | 3743 | |
| β-actin抗体 | Sigma-Aldrich | A2228 | |
| β-Tubulin抗体 | ABclonal | AC021 | |
| GAPDH抗体 | proteintech | 60004 | |
| Lamin B1抗体 | proteintech | 12987 | |
| GM130抗体 | proteintech | 66662 | |
| GFP抗体 | proteintech | 66002 | |
| HA抗体 | OriGene | TA180128 | |
| Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F3165 | |
| Flag-HRP抗体 | Sigma-Aldrich | A8592 | |
| Myc-tag抗体 | CST | 2276 | |
| Myc-tag抗体 | CST | 2278 | |
| Myc-HRP抗体 | CST | 2040 | |
| 泛素抗体 | Abcam | ab7254 | |
| K48连接特异性泛素抗体 | Abcam | ab140601 | |
| ELISA | Ifn-β ELISA试剂盒 | PBL | 42400 |
| Cxcl1 ELISA试剂盒 | boster | EK0723 | |
| sGAG测量 | Blyscan硫酸化糖胺聚糖检测试剂盒 | Biocolor Ltd | B1000 |
| 药物处理 | LY294002 | MCE | HY-10108 |
| MK-2206 | MCE | HY-10358 | |
| 细胞培养 | 聚凝胺 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| FBXW7缺失对DNA病毒诱导信号通路的影响 | 细胞系(对照和FBXW7-KO THP-1)、HSV-1感染复数(MOI)和感染时间点、检测抗体 阅读提示:Results第一段和Fig. 1A图注;Methods中病毒和细胞来源 |
| GSK3α/β在DNA病毒诱导信号中的作用 | GSK3A-KO、GSK3B-KO和GSK3A/B-DKO THP-1细胞构建、HSV-1感染时间点 阅读提示:Fig. 1F, 1G图注;Methods中CRISPR-Cas9敲除 |
| FBXW7与SLC35B2/3的相互作用及泛素化降解 | CHX浓度(20 μg/ml)和处理时间、抑制剂浓度(NH4Cl 5 mM, MG132 1 μM, 3-MA 100 ng/ml)、免疫沉淀抗体 阅读提示:Fig. 3E, 3F图注;Methods中免疫共沉淀和泛素化实验 |
| 病毒通过PI3K-AKT-GSK3α/β轴调控FBXW7活性 | LY294002和MK-2206浓度(10 μM)、预处理时间、HSV-1感染时间点 阅读提示:Fig. 6A-6D图注;Results对应段落 |
| FBXW7在体内对DNA病毒先天免疫应答的调控 | 小鼠基因型(Fbxw7f/f和Lyz2+-Fbxw7f/f)、HSV-1剂量(1×10^7 pfu/只)、注射途径(尾静脉)、取样时间(4或8 h)、生存观察15天 阅读提示:Fig. 7F-7I图注;Methods中Mice和ELISA部分 |