单细胞RNA测序揭示S100a9hi巨噬细胞促进心肌缺血再灌注后从急性炎症向纤维化重塑的转变

Single-cell RNA sequencing reveals S100a9hi macrophages promote the transition from acute inflammation to fibrotic remodeling after myocardial ischemia‒reperfusion.

作者信息Shichun Shen, Meng Zhang, Xiaohe Wang, Qiaoling Liu, Huimin Su, Bingyi Sun, Zhiqing Guo, Beiduo Tian, Hong Gan, Chen Gong, Likun Ma
PMID38323308
发布时间2024-01
DOI10.7150/thno.91180

实验完整度

包含scRNA-seq、质谱流式、S100a9基因敲除小鼠、巨噬细胞耗竭及回输、药物抑制等多层次独立证据,并涵盖体外细胞实验与体内动物模型验证。

主要模型

小鼠心肌缺血再灌注模型(C57BL/6) S100a9基因敲除小鼠(S100a9-/-)MIR模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)体外培养

重点核对

小鼠品系:C57BL/6,6-8周龄 MIR模型:左冠状动脉结扎30分钟再灌注 S100a9抑制剂tasquinimod给药剂量:5 mg/kg/d,腹腔注射 巨噬细胞耗竭:氯膦酸盐脂质体10 ml/kg静脉注射 BMDM回输:1×10^6细胞/只,MIR后第4天

摘要

原理:心肌缺血再灌注(MIR)后从急性炎症到纤维化的转变显著影响预后。巨噬细胞在MIR后的炎症损伤和修复中发挥关键作用。然而,巨噬细胞在这一转变过程中的异质性和转化机制尚不清楚。方法:本研究使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和质谱流式细胞术检测MIR后小鼠单核细胞来源的巨噬细胞,以研究巨噬细胞亚型及其在MIR过程中的作用。使用S100a9-/-小鼠建立MIR模型,阐明减轻MIR后炎症和纤维化的机制。在巨噬细胞耗竭(MD)后回输骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)以进一步研究S100a9hi巨噬细胞在MIR中的作用。结果:我们鉴定出一种独特的S100a9hi巨噬细胞亚型,起源于单核细胞,参与急性炎症和纤维化。这些S100a9hi巨噬细胞在再灌注后2小时即浸润心脏,并激活Myd88/NFκB/NLRP3信号通路,放大炎症反应。随着组织环境从促炎向修复性转变,S100a9激活转化生长因子-β(Tgf-β)/p-smad3信号通路。这种激活不仅诱导心肌成纤维细胞向肌成纤维细胞转化,还通过巨噬细胞-肌成纤维细胞转化(MMT)促进纤维化。用特异性抑制剂靶向S100a9可有效减轻急性炎症损伤并阻止纤维化进展,包括MMT。结论:S100a9hi巨噬细胞是管理MIR后炎症向纤维化转变的有前景的治疗靶点。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
心肌缺血再灌注后巨噬细胞如何从急性炎症向纤维化转变,其机制及潜在治疗靶点是什么?
核心机制
S100a9hi巨噬细胞通过激活Myd88/NFκB/NLRP3信号通路放大炎症反应,并通过Tgf-β/p-smad3信号通路促进心肌成纤维细胞向肌成纤维细胞转化及巨噬细胞向肌成纤维细胞转化(MMT),从而驱动纤维化。
主要证据
scRNA-seq鉴定出S100a9hi巨噬细胞亚型;S100a9基因敲除减轻炎症和纤维化;BMDM回输实验证实其促纤维化作用;S100a9抑制剂tasquinimod减轻炎症损伤和纤维化。
研究意义
S100a9hi巨噬细胞是管理MIR后炎症向纤维化转变的有前景的治疗靶点,为临床治疗心肌缺血再灌注损伤提供新思路。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

单核吞噬细胞图谱构建

确定MIR后心脏和血液中单核吞噬细胞的动态变化和亚型组成

利用scRNA-seq对MIR后第1、3、7天的小鼠心脏和血液样本进行测序,鉴定巨噬细胞亚群。

2

S100a9hi巨噬细胞功能验证

验证S100a9hi巨噬细胞在急性炎症和纤维化中的作用

通过S100a9基因敲除小鼠建立MIR模型,检测心肌梗死面积、心肌损伤标志物、炎症信号通路蛋白表达、细胞凋亡、纤维化程度和心脏功能。

3

体外机制研究

研究S100a9对巨噬细胞表型转化、成纤维细胞活化和MMT的影响

分离BMDMs,用LPS和IL-4诱导M1/M2极化,或用Tgf-β刺激诱导MMT;分离PCFs并与BMDMs共培养,检测成纤维细胞活化。

4

巨噬细胞回输实验

验证S100a9hi巨噬细胞在体内对心肌纤维化的直接作用

通过氯膦酸盐脂质体耗竭小鼠巨噬细胞,在MIR后第4天回输WT或S100a9-/-来源的BMDMs,检测纤维化程度和MMT水平。

5

药物干预验证

评估S100a9抑制剂tasquinimod对MIR后炎症和纤维化的治疗作用

给予小鼠tasquinimod处理,检测心肌梗死面积、心肌损伤标志物、炎症信号通路、细胞凋亡、纤维化程度和心脏功能。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
RPMI 1640培养基----
DMEM培养基----
巨噬细胞集落刺激因子Peprotech--
脂多糖Sigma-Aldrich--
白细胞介素-4Peprotech--
转化生长因子-βSinoBiological--
Ficoll淋巴细胞分离液----
小鼠心脏组织解离试剂盒Miltenyi Biotec--
红细胞裂解液SolarbioR1010
抗CD45抗体Biolegend157603
抗CD11b抗体Biolegend101212
抗Ly6c抗体Biolegend128017
Chromium Next GEM单细胞3'试剂盒v3.110x Genomics1000268
Chromium Next GEM G芯片单细胞试剂盒10x Genomics1000120
Chromium单细胞控制器10x Genomics--
Dynabeads磁珠10x Genomics--
Illumina NovaSeq6000测序系统Illumina--
Cell-ID™顺铂-194PtFluidigm201194
EQ™四元素校准微球Fluidigm201078
Helios质谱流式细胞仪Fluidigm--
伊文思蓝Sigma-Aldrich--
2,3,5-三苯基氯化四氮唑Sigma-Aldrich--
乳酸脱氢酶检测试剂盒Jiancheng--
肌酸激酶同工酶检测试剂盒Jiancheng--
心肌肌钙蛋白I ELISA试剂盒Elabscience--
Bio-Plex小鼠趋化因子31-Plex检测试剂盒Bio-Rad12009159
Luminex X200系统Luminex Corporation--
他喹莫德MCEABR-215050
抗Ly6g抗体Abcamab238132
抗CD68抗体CST97778
抗Ccl2抗体Proteintech26161-1-AP
抗S100a9抗体Proteintech26992-1-AP
抗Myd88抗体CST4383S
抗Arg-1抗体CST93668S
抗α-SMA抗体CST48938
抗p-smad3抗体Abcamab52903
抗iNos抗体CST13120
抗Col1α1抗体CST72026
RIPA裂解液----
BCA蛋白定量试剂盒YameiZJ101
抗磷酸化NFκB抗体CST3033s
抗Myd88抗体CST4283s
抗NLRP3抗体Abcamab263899
抗Caspase-1抗体Proteintech22915-1-AP
抗TNF-α抗体Proteintech60291-1-Ig
抗IL-1β抗体Proteintech16806-1-AP
抗总smad3抗体Proteintech66516-1-Ig
抗Tgf-β抗体Proteintech21898-1-AP
抗β-actin抗体Proteintech66009-1-Ig
抗GAPDH抗体Proteintech10494-1-AP
Biorad成像系统Biorad--
VINNO超声系统VINNO--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
MIR模型建立
小鼠品系、性别、年龄、体重;麻醉方式;左冠状动脉结扎时间(30分钟)及再灌注时间
阅读提示:Experimental Section: Establishment of Mouse MIR Model
单细胞测序
细胞分选标志物(CD45, CD11b, Ly6c);样本来源(心脏、血液);时间点(Sham、D1、D3、D7);质量控制参数(基因数、线粒体基因比例)
阅读提示:Experimental Section: Flow Cytometry and scRNA-Seq; scRNA-Seq Data Processing
S100a9基因敲除小鼠
S100a9-/-小鼠来源;背景品系
阅读提示:Experimental Section: Animal Experiment
巨噬细胞耗竭与回输
氯膦酸盐脂质体剂量(10 ml/kg)和给药时间(MIR前24h);回输BMDM数量(1×10^6细胞/只)和时间(MIR后第4天)
阅读提示:Experimental Section: Macrophage Depletion (MD) in Mice; Adoptive Transfer Studies
药物处理
tasquinimod剂量(5 mg/kg/d)、给药途径(腹腔注射)、溶剂组成(10% DMSO, 40% PEG300, 5% Tween-80 in PBS)、给药时间(MIR前24h至处死前24h)
阅读提示:Experimental Section: Drug Treatment