单核吞噬细胞图谱构建
确定MIR后心脏和血液中单核吞噬细胞的动态变化和亚型组成
利用scRNA-seq对MIR后第1、3、7天的小鼠心脏和血液样本进行测序,鉴定巨噬细胞亚群。
Single-cell RNA sequencing reveals S100a9hi macrophages promote the transition from acute inflammation to fibrotic remodeling after myocardial ischemia‒reperfusion.
包含scRNA-seq、质谱流式、S100a9基因敲除小鼠、巨噬细胞耗竭及回输、药物抑制等多层次独立证据,并涵盖体外细胞实验与体内动物模型验证。
小鼠心肌缺血再灌注模型(C57BL/6) S100a9基因敲除小鼠(S100a9-/-)MIR模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)体外培养
小鼠品系:C57BL/6,6-8周龄 MIR模型:左冠状动脉结扎30分钟再灌注 S100a9抑制剂tasquinimod给药剂量:5 mg/kg/d,腹腔注射 巨噬细胞耗竭:氯膦酸盐脂质体10 ml/kg静脉注射 BMDM回输:1×10^6细胞/只,MIR后第4天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定MIR后心脏和血液中单核吞噬细胞的动态变化和亚型组成
利用scRNA-seq对MIR后第1、3、7天的小鼠心脏和血液样本进行测序,鉴定巨噬细胞亚群。
验证S100a9hi巨噬细胞在急性炎症和纤维化中的作用
通过S100a9基因敲除小鼠建立MIR模型,检测心肌梗死面积、心肌损伤标志物、炎症信号通路蛋白表达、细胞凋亡、纤维化程度和心脏功能。
研究S100a9对巨噬细胞表型转化、成纤维细胞活化和MMT的影响
分离BMDMs,用LPS和IL-4诱导M1/M2极化,或用Tgf-β刺激诱导MMT;分离PCFs并与BMDMs共培养,检测成纤维细胞活化。
验证S100a9hi巨噬细胞在体内对心肌纤维化的直接作用
通过氯膦酸盐脂质体耗竭小鼠巨噬细胞,在MIR后第4天回输WT或S100a9-/-来源的BMDMs,检测纤维化程度和MMT水平。
评估S100a9抑制剂tasquinimod对MIR后炎症和纤维化的治疗作用
给予小鼠tasquinimod处理,检测心肌梗死面积、心肌损伤标志物、炎症信号通路、细胞凋亡、纤维化程度和心脏功能。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Peprotech | -- | |
| 脂多糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 白细胞介素-4 | Peprotech | -- | |
| 转化生长因子-β | SinoBiological | -- | |
| 细胞分离 | Ficoll淋巴细胞分离液 | -- | -- |
| 组织解离 | 小鼠心脏组织解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| 红细胞裂解 | 红细胞裂解液 | Solarbio | R1010 |
| 流式分析 | 抗CD45抗体 | Biolegend | 157603 |
| 抗CD11b抗体 | Biolegend | 101212 | |
| 抗Ly6c抗体 | Biolegend | 128017 | |
| 单细胞测序 | Chromium Next GEM单细胞3'试剂盒v3.1 | 10x Genomics | 1000268 |
| Chromium Next GEM G芯片单细胞试剂盒 | 10x Genomics | 1000120 | |
| Chromium单细胞控制器 | 10x Genomics | -- | |
| Dynabeads磁珠 | 10x Genomics | -- | |
| Illumina NovaSeq6000测序系统 | Illumina | -- | |
| 质谱流式 | Cell-ID™顺铂-194Pt | Fluidigm | 201194 |
| EQ™四元素校准微球 | Fluidigm | 201078 | |
| Helios质谱流式细胞仪 | Fluidigm | -- | |
| 心肌梗死面积检测 | 伊文思蓝 | Sigma-Aldrich | -- |
| 2,3,5-三苯基氯化四氮唑 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 心肌损伤标志物检测 | 乳酸脱氢酶检测试剂盒 | Jiancheng | -- |
| 肌酸激酶同工酶检测试剂盒 | Jiancheng | -- | |
| 心肌肌钙蛋白I ELISA试剂盒 | Elabscience | -- | |
| 细胞因子检测 | Bio-Plex小鼠趋化因子31-Plex检测试剂盒 | Bio-Rad | 12009159 |
| Luminex X200系统 | Luminex Corporation | -- | |
| 药物处理 | 他喹莫德 | MCE | ABR-215050 |
| 免疫组化 | 抗Ly6g抗体 | Abcam | ab238132 |
| 免疫荧光 | 抗CD68抗体 | CST | 97778 |
| 抗Ccl2抗体 | Proteintech | 26161-1-AP | |
| 抗S100a9抗体 | Proteintech | 26992-1-AP | |
| 抗Myd88抗体 | CST | 4383S | |
| 抗Arg-1抗体 | CST | 93668S | |
| 抗α-SMA抗体 | CST | 48938 | |
| 抗p-smad3抗体 | Abcam | ab52903 | |
| 抗iNos抗体 | CST | 13120 | |
| 抗Col1α1抗体 | CST | 72026 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Yamei | ZJ101 | |
| 抗磷酸化NFκB抗体 | CST | 3033s | |
| 抗Myd88抗体 | CST | 4283s | |
| 抗NLRP3抗体 | Abcam | ab263899 | |
| 抗Caspase-1抗体 | Proteintech | 22915-1-AP | |
| 抗TNF-α抗体 | Proteintech | 60291-1-Ig | |
| 抗IL-1β抗体 | Proteintech | 16806-1-AP | |
| 抗总smad3抗体 | Proteintech | 66516-1-Ig | |
| 抗Tgf-β抗体 | Proteintech | 21898-1-AP | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| Biorad成像系统 | Biorad | -- | |
| 超声心动图 | VINNO超声系统 | VINNO | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MIR模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄、体重;麻醉方式;左冠状动脉结扎时间(30分钟)及再灌注时间 阅读提示:Experimental Section: Establishment of Mouse MIR Model |
| 单细胞测序 | 细胞分选标志物(CD45, CD11b, Ly6c);样本来源(心脏、血液);时间点(Sham、D1、D3、D7);质量控制参数(基因数、线粒体基因比例) 阅读提示:Experimental Section: Flow Cytometry and scRNA-Seq; scRNA-Seq Data Processing |
| S100a9基因敲除小鼠 | S100a9-/-小鼠来源;背景品系 阅读提示:Experimental Section: Animal Experiment |
| 巨噬细胞耗竭与回输 | 氯膦酸盐脂质体剂量(10 ml/kg)和给药时间(MIR前24h);回输BMDM数量(1×10^6细胞/只)和时间(MIR后第4天) 阅读提示:Experimental Section: Macrophage Depletion (MD) in Mice; Adoptive Transfer Studies |
| 药物处理 | tasquinimod剂量(5 mg/kg/d)、给药途径(腹腔注射)、溶剂组成(10% DMSO, 40% PEG300, 5% Tween-80 in PBS)、给药时间(MIR前24h至处死前24h) 阅读提示:Experimental Section: Drug Treatment |