患者样本分析
评估LIGHT在AF患者中的表达水平及其与临床特征的关系
收集AF患者和SR对照的外周血,分离PBMCs进行PCR芯片分析,用ELISA检测血清LIGHT蛋白水平,并进行ROC曲线和相关性分析。
TNFSF14/LIGHT promotes cardiac fibrosis and atrial fibrillation vulnerability via PI3Kγ/SGK1 pathway-dependent M2 macrophage polarisation.
包含患者样本分析(PCR芯片、ELISA)、体内小鼠模型(rLIGHT注射、电生理、组织学)、体外细胞实验(BMDM、CF共培养)及机制验证(抑制剂、RNA测序),多个独立证据层级。
AF患者外周血单个核细胞 C57BL/6小鼠rLIGHT注射模型 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 小鼠原代心脏成纤维细胞(CFs)
AF患者PBMCs中LIGHT和TNFRSF14 mRNA表达升高,血清LIGHT蛋白水平升高 rLIGHT尾静脉注射剂量(10 μg/周,4周)及AF诱导性检测方法 BMDM M2极化标志物(CD163、CD206、ARG1)表达及TGF-β1分泌 PI3Kγ抑制剂IPI549和SGK1抑制剂GSK650394的处理浓度和预处理时间
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估LIGHT在AF患者中的表达水平及其与临床特征的关系
收集AF患者和SR对照的外周血,分离PBMCs进行PCR芯片分析,用ELISA检测血清LIGHT蛋白水平,并进行ROC曲线和相关性分析。
验证LIGHT对心脏功能和AF诱导性的影响
6-8周龄C57BL/6小鼠尾静脉注射重组LIGHT(10 μg/周)或生理盐水4周,通过超声心动图、心内电生理检测和AF诱导评估心脏功能和AF易感性。
评估LIGHT诱导的心脏纤维化和巨噬细胞极化
通过H&E、Masson三色染色评估纤维化;通过免疫组化和Western blot检测巨噬细胞标志物(F4/80、CD163、CD206、iNOS)和纤维化相关蛋白(collagen I/III、α-SMA、TGF-β1)。
揭示LIGHT调控心脏重塑的潜在信号通路
对小鼠心脏组织进行RNA测序,鉴定差异表达基因并进行GO和KEGG富集分析,发现PI3K-Akt信号通路富集,并验证PI3Kγ和SGK1表达变化。
验证LIGHT是否通过PI3Kγ/SGK1通路诱导M2极化
用rLIGHT刺激BMDMs,并用IPI549和GSK650394预处理,检测M2极化标志物(CD163、CD206、ARG1)和TGF-β1、IL-10分泌。
确定LIGHT是否通过巨噬细胞分泌因子影响成纤维细胞表型
用BMDM条件培养基(MCM)处理心脏成纤维细胞,检测胶原合成和肌成纤维细胞转化标志物。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 蛋白质检测 | 重组LIGHT蛋白 | MedChemExpress | HY-P73837 |
| 细胞处理 | Eganelisib(IPI549) | MedChemExpress | HY-100716 |
| GSK650394 | MedChemExpress | HY-15192 | |
| Western blot | 抗磷酸化Akt (Ser473)抗体 | Cell Signalling Technology | 4060 |
| 抗Akt抗体 | Cell Signalling Technology | 4691 | |
| 抗PIK3CG抗体 | ABclonal | A0266 | |
| 抗SGK1抗体 | ABclonal | A3936 | |
| 抗磷酸化Smad2/Smad3抗体 | ABclonal | AP1343 | |
| 抗Smad2抗体 | HUABIO | ET1604-2 | |
| 抗Smad3抗体 | HUABIO | ET1607-4 | |
| 抗PI3K p85α抗体 | HUABIO | ET1608-70 | |
| 免疫组化/流式 | 抗F4/80抗体 | Proteintech | 28463-1-AP |
| 免疫组化 | 抗CD3抗体 | Proteintech | 17617-1-AP |
| 免疫组化/免疫荧光/流式 | 抗CD163抗体 | Proteintech | 16646-1-AP |
| Western blot/免疫组化 | 抗ARG1抗体 | Proteintech | 66129-1-Ig |
| 免疫组化/流式 | 抗CD206抗体 | Proteintech | 60143-1-Ig |
| Western blot/免疫组化 | 抗iNOS抗体 | Proteintech | 18985-1-AP |
| 抗MCP1抗体 | Proteintech | 66272-1-Ig | |
| Western blot | 抗TGFβ1抗体 | Proteintech | 21898-1-AP |
| 抗collagen I抗体 | Proteintech | 14695-1-AP | |
| 抗collagen III抗体 | Proteintech | 68320-1-Ig | |
| Western blot/免疫荧光 | 抗α-SMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP |
| Western blot | 抗β-actin抗体 | Proteintech | 20536-1-AP |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| 流式细胞术 | Zombie Green™ 可固定活力试剂盒 | BioLegend | 423111 |
| Brilliant Violet 421™抗人CD14抗体 | BioLegend | 325628 | |
| Brilliant Violet 605™抗人CD3抗体 | BioLegend | 317322 | |
| PE抗人LTβR抗体 | BioLegend | 322008 | |
| PE/CY7抗人HVEM抗体 | BioLegend | 318810 | |
| APC抗人LIGHT抗体 | BioLegend | 392708 | |
| APC抗小鼠F4/80抗体 | BioLegend | 123116 | |
| Brilliant Violet 421™抗小鼠CD206抗体 | BioLegend | 141717 | |
| 动物实验 | Vevo 2100超声系统 | Visual Sonics | -- |
| 电生理检测 | 1.1F八极导管 | iWorx Systems | -- |
| 电生理记录 | iWorx IX-RA-834记录仪 | iWorx Systems | -- |
| 组织学成像 | 数字切片扫描仪 | Leica | Aperio Versa 8 |
| RNA-seq | mRNA-seq文库制备试剂盒 | Vazyme | NR612-02 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | GIBCO | -- |
| 胎牛血清 | Invitrogen GIBCO | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Invitrogen GIBCO | -- | |
| 巨噬细胞集落刺激因子 | Novoprotein | C756 | |
| 细胞分离 | II型胶原酶 | Worthington | LS004177 |
| CCK8实验 | CCK-8试剂 | Dojindo | CK04 |
| ELISA | 人LIGHT ELISA试剂盒 | R&D Systems | DLIT00 |
| 小鼠TGF-β1 ELISA试剂盒 | ABclonal | RK0057 | |
| 小鼠IL-10 ELISA试剂盒 | ABclonal | RK00016 | |
| 小鼠IL-4 ELISA试剂盒 | ABclonal | RK00036 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M3063 | |
| 小鼠NT-proBNP ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0834c | |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 88-7013-77 | |
| RNA提取 | RNA快速纯化试剂盒 | Yishan | ES-RN001 |
| 组织RNA纯化试剂盒Plus | Yishan | ES-RN001 | |
| HiFiScript cDNA合成试剂盒 | Cwbio | CW2569M | |
| RT-qPCR | UltraSYBR混合物 | Cwbio | CW2601H |
| ABI 7500实时荧光定量PCR检测系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| NanoDrop分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| ECL底物 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 剥离缓冲液 | Beyotime | P0025 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本收集 | AF患者和SR对照的数量、排除标准、外周血采集和处理方法 阅读提示:Methods: Clinical sample collection and processing and PBMC separation |
| 动物模型 | 小鼠品系、周龄、体重、rLIGHT剂量、给药途径和持续时间 阅读提示:Methods: Animal experiments |
| 细胞培养与处理 | BMDM和CF的分离方法、培养条件、rLIGHT浓度、抑制剂浓度和处理时间 阅读提示:Methods: Cell isolation and culture, Preparation of macrophage-conditioned medium for CF treatment |
| AF诱导方案 | burst刺激参数(CL范围、持续时间)、AF定义标准 阅读提示:Methods: Intracardiac electrophysiological examination and induction of AF |
| 分子检测 | RNA提取、qRT-PCR引物、Western blot抗体、ELISA试剂盒等详细信息 阅读提示:Methods: qRT-PCR and PCR array, Western blot analysis, ELISA |