OMD与骨质疏松的关联分析
评估OMD在骨质疏松中的表达变化及其与骨丢失的相关性
分析公共数据集(GSE30159, GSE35958, GSE1367)中骨质疏松相关基因表达;检测绝经后骨质疏松患者骨组织和血清中OMD水平;使用OVX小鼠模型验证血清和骨组织OMD的变化。
Osteoblast-derived osteomodulin restrains osteoclastogenesis via ITGB8/RRM2-mediated reduction of mitochondrial respiration and mitochondrial ATP production.
包含患者样本关联分析、多种转基因小鼠模型(全身、成骨细胞、破骨细胞特异性敲除)、体外破骨细胞分化、机制验证(信号通路、代谢检测)及体内治疗实验。
小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMMs) 小鼠成骨细胞(颅骨分离) HEK-293T细胞 RAW 264.7细胞
OMD敲除小鼠模型:诱导性全身(OmdΔCAG)及成骨细胞特异性(OmdΔOC和OmdΔDMP1)敲除小鼠 体外破骨细胞分化:BMMs用M-CSF(30 ng/ml)和RANKL(100 ng/ml)诱导 重组OMD蛋白浓度:100 ng/ml处理 RRM2抑制剂osalmid浓度:0-20 μM 动物模型:OVX和LPS诱导的骨质疏松模型,OMD剂量200 μg/kg静脉注射,osalmid剂量100 mg/kg腹腔注射
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估OMD在骨质疏松中的表达变化及其与骨丢失的相关性
分析公共数据集(GSE30159, GSE35958, GSE1367)中骨质疏松相关基因表达;检测绝经后骨质疏松患者骨组织和血清中OMD水平;使用OVX小鼠模型验证血清和骨组织OMD的变化。
确定OMD缺失是否导致骨丢失和破骨细胞活性增加
通过他莫昔芬诱导全身性Omd敲除(OmdΔCAG)、成骨细胞特异性敲除(OmdΔOC和OmdΔDMP1)和破骨细胞前体特异性敲除(OmdΔLysM),使用micro-CT、H&E和TRAP染色评估骨量和破骨细胞数量。
检验OMD是否直接抑制破骨细胞生成
分离小鼠BMMs,用M-CSF和RANKL诱导破骨细胞分化,同时加入重组OMD或与成骨细胞共培养,通过TRAP染色、qRT-PCR和Western blot检测破骨细胞标志物。
探究OMD是否影响破骨细胞前体的线粒体呼吸和ATP产生
使用RNA-seq分析OMD处理后的转录组,检测mtDNA拷贝数、电子传递链蛋白表达、耗氧率(OCR)和细胞外酸化率(ECAR),并测量ATP产生速率。
验证RRM2是否为OMD抑制线粒体功能的关键下游分子
RNA-seq鉴定Rrm2为差异表达基因;使用RRM2抑制剂osalmid处理BMMs,评估破骨细胞生成和线粒体功能;过表达Rrm2后检测是否能逆转OMD的效应。
阐明OMD调控Rrm2转录的分子机制
通过免疫沉淀质谱鉴定ITGB8为OMD的相互作用受体;验证OMD与ITGB8的直接结合;敲低Itgb8检测对OMD效应的影响;检测OMD对RhoA活性、YAP磷酸化及TEAD启动子占据的影响。
评估重组OMD或RRM2抑制剂对骨质疏松动物模型的治疗作用
建立OVX和LPS诱导的骨质疏松小鼠模型,分别给予重组OMD蛋白或osalmid处理,通过micro-CT、H&E和TRAP染色评估骨量和破骨细胞活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | α-MEM培养基 | Amizona Scientific LLC | -- |
| 胎牛血清 | Amizona Scientific LLC | -- | |
| 破骨细胞分化 | 重组小鼠M-CSF | AMIZONA | AM10003-050 |
| 重组小鼠RANKL | AMIZONA | AM10004-050 | |
| TRAP染色试剂盒 | AMIZONA | AMK1005-150 | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Boyce | C0037 |
| 药物处理 | 奥沙米德 | MCE | HY-B2116 |
| SB-431542 | MCE | HY-10431 | |
| TRULI | MCE | HY-138489 | |
| 重组人OMD蛋白 | R&D Systems | 2884-AD | |
| ELISA检测 | 人骨调素/OMD ELISA试剂盒 | Boster Biological Technology | EK2017 |
| 小鼠骨调素/OMD ELISA试剂盒 | Boster Biological Technology | EK2018 | |
| 小鼠β-CTX ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0372 | |
| 信号通路检测 | RhoA G-LISA激活检测试剂盒 | Cytoskeleton | BK124 |
| ELISA检测 | 小鼠/大鼠TGF-β ELISA试剂盒 | Beyotime | PT878 |
| 葡萄糖摄取检测 | 2-NBDG | Thermo Fisher | N13195 |
| 细胞培养 | 磷酸盐缓冲液 | Cienry | CR-10010 |
| 细胞分离 | 胶原酶II | Sigma | C2-BIOC |
| 细胞培养 | 青霉素-链霉素(100×) | MCE | HY-K1006 |
| 胰蛋白酶 | Gibco | 25300062 | |
| 1,25-二羟基维生素D3 | MCE | HY-10002 | |
| 基因转染 | RNAiMAX转染试剂 | Thermo Fisher | 13778150 |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | L3000008 | |
| 细胞培养 | HEK-293T细胞 | Procell | CL-0005 |
| RAW 264.7细胞 | Procell | CL-0190 | |
| 染色 | 罗丹明标记的鬼笔环肽 | Beyotime | C2201S |
| qPCR | SYBR Green PCR试剂盒 | TaKaRa | -- |
| ABI StepOnePlus实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| ChIP | Pierce磁珠ChIP试剂盒 | Thermo Fisher | 26157 |
| 抗体 | 抗TEAD1抗体 | ABclonal | A13366 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solar Bio | -- |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | CWBIO | -- | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Millipore | -- | |
| Amersham Imager 600成像仪 | GE | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-IG | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-IG | |
| 抗CTSK抗体 | Santa Cruz | sc-48353 | |
| 抗NFATC1抗体 | Santa Cruz | sc-7294 | |
| 抗MMP9抗体 | Proteintech | 10375-2-AP | |
| 抗RRM2抗体 | Santa Cruz | sc-81850 | |
| 抗ITGB8抗体 | Proteintech | 29775-1-AP | |
| 抗OMD抗体 | Abcam | ab154249 | |
| 抗RUNX2抗体 | Proteintech | 20700-1-AP | |
| 抗I型胶原抗体 | Proteintech | 14695-1-AP | |
| 抗ATP5A1抗体 | Proteintech | 14676-1-AP | |
| 抗UQCRC2抗体 | Proteintech | 67547-1-Ig | |
| 抗SDHB抗体 | Proteintech | 10620-1-AP | |
| 抗MTCO4抗体 | Proteintech | 11242-1-AP | |
| 抗NDUFB8抗体 | Proteintech | 14794-1-AP | |
| 抗FLAG抗体 | Proteintech | 20543-1-AP | |
| 抗HA抗体 | Proteintech | 51064-2-AP | |
| 抗YAP抗体 | HUABIO | ET1608-30 | |
| 抗磷酸化YAP (S127)抗体 | HUABIO | ET1611-69 | |
| 抗Smad2抗体 | HUABIO | ET1604-22 | |
| 抗磷酸化Smad2抗体 | HUABIO | ET1612-32 | |
| 抗Smad3抗体 | HUABIO | ET1607-41 | |
| 抗磷酸化Smad3抗体 | HUABIO | ET1609-41 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | #9272 | |
| 抗磷酸化AKT抗体 | Cell Signaling Technology | #4060 | |
| 抗ERK抗体 | Cell Signaling Technology | #9102 | |
| 抗磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | #4695 | |
| 抗p38抗体 | Cell Signaling Technology | #9212 | |
| 抗磷酸化p38抗体 | Cell Signaling Technology | #4511 | |
| 抗JNK抗体 | Proteintech | 51153-1-AP | |
| 抗磷酸化JNK抗体 | Proteintech | 80024-1-RR | |
| 线粒体功能检测 | Seahorse XFe96细胞外流量分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| Agilent Seahorse XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103015-100 | |
| XF-DMEM培养基 | Agilent Technologies | 103575-100 | |
| 线粒体膜电位检测 | TMRE染料 | Beyotime | C2001S |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | 15596018 |
| Bioanalyzer 2100生物分析仪 | Agilent | -- | |
| RNA 6000 Nano LabChip试剂盒 | Agilent | 5067-1511 | |
| Dynabeads Oligo (dT)磁珠 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | LC-Bio Technology | -- | |
| LC-MS/MS | Q Exactive Plus质谱仪 | Thermo Scientific | -- |
| Easy nLC1200液相色谱 | Thermo Scientific | -- | |
| 代谢组学 | 超高效液相色谱系统(Agilent 1290 Infinity LC) | Agilent | -- |
| TripleTOF 5600质谱仪 | AB Sciex | -- | |
| 小鼠实验 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 |
| 细胞培养 | 玉米油 | Sigma-Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型构建 | 小鼠品系:C57BL/6;他莫昔芬诱导方案:1 mg/剂量,每天两次,连续5天;他莫昔芬溶剂:含2%乙醇的玉米油 阅读提示:Materials and Methods: Mice |
| 破骨细胞分化 | BMMs分离自C57BL/6小鼠;诱导条件:M-CSF(30 ng/ml)和RANKL(100 ng/ml) 阅读提示:Materials and Methods: BMM isolation and osteoclast differentiation |
| OMD处理 | 重组OMD浓度:100 ng/ml(体外);小鼠体内剂量:200 μg/kg静脉注射 阅读提示:Materials and Methods: Reagents; Results: OVX- and LPS-induced osteoporosis model |
| RRM2抑制 | osalmid浓度:0-20 μM(体外);体内剂量:100 mg/kg腹腔注射 阅读提示:Materials and Methods: Reagents; Results: OVX- and LPS-induced osteoporosis model |
| 线粒体功能检测 | Seahorse分析:OCR测量使用寡霉素(1 μM)、FCCP(2 μM)、鱼藤酮(1 μM)和抗霉素A(1 μM);ECAR测量使用葡萄糖(10 mM)、寡霉素(2 mM)和2-脱氧葡萄糖(50 mM) 阅读提示:Materials and Methods: Seahorse extracellular flux analysis |
| 动物模型 | OVX模型:12周龄雌性C57BL/6小鼠;LPS模型:腹腔注射5 mg/kg LPS,第0和4天,第8天取材 阅读提示:Materials and Methods: OVX- and LPS-induced osteoporosis model |