METTL1表达与脂肪肝的相关性分析
探究METTL1在MASLD中的表达变化及其与疾病的关系。
利用qPCR和Western blot检测小鼠各组织、HFD和ob/ob小鼠肝脏、临床非MASLD和MASLD患者肝脏以及FFA处理的HepG2、MPHs和PHHs中METTL1的表达。
METTL1-mediated m7G methylation of FoxO1 regulates lipid metabolism in metabolic dysfunction-associated fatty liver disease
包含细胞实验(HepG2、原代肝细胞)、动物模型(HFD诱导、ob/ob、基因敲除/过表达小鼠)、临床样本、转录组测序和m7G测序等多层次验证,并进行了功能回复和抑制剂验证。
HepG2细胞 小鼠原代肝细胞(MPHs) HFD诱导的MASLD小鼠模型 肝细胞特异性Mettl1敲除小鼠(Mettl1 hko)
METTL1在MASLD小鼠和患者肝脏中的表达水平(qPCR、Western blot、IHC) Mettl1 hko小鼠在HFD喂养16周后的肝脂质含量、血脂、ALT/AST、GTT/ITT FFA处理(OA:PA=2:1)诱导的HepG2细胞脂质积累模型 METTL1介导的FoxO1 mRNA m7G修饰位点(Exon1,人G458/鼠G449) METTL1抑制剂HtMBm的浓度(HepG2 10 μM,MPHs 5 μM)及体内给药方式(腹腔注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究METTL1在MASLD中的表达变化及其与疾病的关系。
利用qPCR和Western blot检测小鼠各组织、HFD和ob/ob小鼠肝脏、临床非MASLD和MASLD患者肝脏以及FFA处理的HepG2、MPHs和PHHs中METTL1的表达。
评估Mettl1缺失对HFD诱导的MASLD小鼠代谢紊乱的影响。
使用Alb-Cre小鼠与Mettl1 fl/fl小鼠杂交获得肝细胞特异性Mettl1敲除小鼠(Mettl1 hko),给予NCD或HFD喂养16周,检测体重、肝重、血清ALT/AST、GTT/ITT、肝脏H&E和Oil Red O染色、血清和肝脏TG含量,并分析脂质合成和氧化相关基因表达及FAO活性。
验证Mettl1过表达是否加重MASLD相关的代谢异常。
通过尾静脉注射AAV-Mettl1在肝脏过表达Mettl1,给予NCD或HFD喂养16周,检测体重、肝重、血清ALT/AST、GTT/ITT、肝脏H&E和Oil Red O染色、血清和肝脏TG含量,并分析脂质代谢相关基因表达及FAO活性。
在体外模型中验证METTL1对肝细胞脂质合成和氧化的影响。
在HepG2细胞中敲低或过表达METTL1(以及突变体),用FFA处理24小时,通过Nile Red染色、TG含量测定、qPCR和Western blot检测脂质代谢相关基因和蛋白表达,并检测FAO活性。
鉴定METTL1介导的m7G修饰靶基因及其在MASLD中的功能。
对BSA/shGFP、FFA/shGFP和FFA/shMETTL1组HepG2细胞进行MeRIP-seq,分析m7G峰的分布、差异甲基化基因及富集通路,并利用MeRIP-qPCR验证候选基因。
证明METTL1通过m7G修饰调控FoxO1表达及其功能。
通过MeRIP-qPCR验证FoxO1的m7G修饰水平;构建FoxO1突变质粒,在293T和HepG2细胞中检测mRNA和蛋白表达;在HepG2和MPHs中过表达WT或突变FoxO1,检测脂质积累和代谢相关基因表达。
验证Mettl1的保护作用是否通过FoxO1介导。
在Mettl1 fl/fl和Mettl1 hko小鼠中通过尾静脉注射AAV-FoxO1,给予16周HFD,检测代谢指标、肝脂质积累及脂质代谢相关基因表达。
筛选METTL1抑制剂并验证其对HFD诱导的MASLD的治疗作用。
基于METTL1蛋白结构(PDB: 8D59)进行虚拟筛选,得到候选化合物;在HepG2和MPHs中验证抑制脂质积累效果;对HFD小鼠腹腔注射HtMBm,检测代谢改善情况。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | H-DMEM培养基 | Hyclone | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 原代人肝细胞 | RILD | X008052-P | |
| 细胞处理 | 油酸 | Sigma | O1008 |
| 棕榈酸 | Sigma | P5585 | |
| 原代肝细胞分离 | 肝脏解离试剂盒 | Miltenyi | 130-105-807 |
| 肝脏灌流试剂盒 | Miltenyi | 130-128-030 | |
| 抗体 | METTL1抗体 | Cell Signaling Technology | 88019 |
| CPT1-α抗体 | Cell Signaling Technology | 12252 | |
| Fasn抗体 | Cell Signaling Technology | 3180 | |
| SREBP1抗体 | Cell Signaling Technology | 95879 | |
| 磷酸化IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 2859 | |
| IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 4812 | |
| p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 磷酸化p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| IKKβ抗体 | Affinity | AF6009 | |
| 磷酸化IKKβ抗体 | Affinity | AF3010 | |
| β-微管蛋白抗体 | Proteintech | 10094-1-AP | |
| β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-lg | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| Acadm抗体 | Proteintech | 55210-1-AP | |
| METTL1抗体 | Proteintech | 84272-1-RR | |
| CD11b抗体 | Proteintech | 21851-1-AP | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Absin | abs20040 | |
| 山羊抗小鼠IgG二抗 | Absin | abs20039 | |
| 细胞染色 | 尼罗红 | Sigma-Aldrich | 72485 |
| 分子生物学 | 5× All-In-One逆转录试剂盒 | abm | G486 |
| EvaGreen qPCR预混液 | abm | G891 | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Dingguo | BCA02 |
| 生化检测 | ALT检测试剂盒 | Jiangsu Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| AST检测试剂盒 | Jiangsu Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 甘油三酯检测试剂盒 | Jiangsu Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| 脂肪酸氧化检测 | 脂肪酸氧化检测试剂盒 | AssayGenie | BR00001 |
| 免疫组化 | HRP标记二抗 | Abbkine | A21020 |
| 免疫荧光 | CoraLite 488标记的山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00013-2 |
| m7G测序 | RNA m7G甲基化免疫沉淀试剂盒 | GenSeq | GS-ET-004 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 非MASLD和MASLD患者的肝脏活检标本来源、样本量、伦理审批 阅读提示:Methods 2.1 Clinical specimens |
| 细胞实验 | HepG2和293T细胞培养条件(H-DMEM+10%FBS+1%P/S),FFA浓度和暴露时间(OA:PA=2:1,24小时) 阅读提示:Methods 2.2 Cell culture and treatment |
| 动物实验 | 小鼠品系、周龄、性别、饮食(HFD或NCD)及喂养时间(16周),Mettl1 hko构建方法 阅读提示:Methods 2.4 Animals and treatment |
| 基因操作 | shRNA序列、慢病毒/腺病毒/AAV的构建细节和感染/注射方法,FoxO1突变位点及构建 阅读提示:Methods 2.7 Plasmid constructions, shRNA knockdown and viral infection; 2.15 Mouse AAV8 construction and injection |
| m7G测序 | MeRIP-seq实验步骤、抗体、测序平台、分析流程 阅读提示:Methods 2.14 m7G sequencing analysis and MeRIP-qPCR |
| 代谢表型检测 | GTT/ITT条件(禁食时间、剂量、测量时间点),ALT/AST/TG检测试剂盒及操作 阅读提示:Methods 2.9 Murine serological analysis |
| 抑制剂处理 | HtMBm的给药剂量、频率、途径(i.p.),处理时间 阅读提示:Results 3.8 and Fig. 8b |
| 数据分析 | 统计方法(t-test, ANOVA, two-way ANOVA),样本量(n≥3),显著性阈值 阅读提示:Methods 2.17 Statistical analysis |