体外TLR刺激检测p75NTR表达
验证TLR7/9激活是否上调B细胞p75NTR表达。
分离小鼠脾脏B220+ B细胞,用CpG-B或R848刺激24小时,通过流式、Western blot和免疫荧光检测p75NTR表达。
P75NTR activation limits CD21lo B cell subsets expansion in response to autoimmune-inducing challenges.
包含体外细胞实验、体内小鼠模型、转录组测序及功能缺失验证,证据层级多元。
C57BL/6小鼠脾脏B220+ B细胞 CD19cre-p75fl/fl小鼠(B细胞特异性p75NTR敲除) pristane诱导的自身免疫样小鼠模型
脾脏B220+ B细胞分离纯度>95% CpG-B刺激浓度0.25 μmol,R848刺激浓度200 ng/mL,作用24小时 pristane注射剂量0.5 mL,腹腔注射,6周龄雌性小鼠 RNA-seq差异表达基因筛选标准:P-adjust<0.05且倍数变化≥2 统计方法:多组比较用ANOVA,两组比较用非配对t检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TLR7/9激活是否上调B细胞p75NTR表达。
分离小鼠脾脏B220+ B细胞,用CpG-B或R848刺激24小时,通过流式、Western blot和免疫荧光检测p75NTR表达。
检测p75NTR缺失是否影响TLR7/9诱导的CD21lo B细胞扩增及促炎表型。
比较CD19cre-p75fl/fl小鼠与对照B细胞在CpG-B或R848刺激后CD21lo比例、CD21 MFI、CD44/CD86表达及IL-6/TNF-α水平。
探究p75NTR缺失对TLR7/9刺激下B细胞转录谱的影响。
对CpG-B或R848刺激的p75NTR缺陷和对照B细胞进行RNA-seq,分析差异表达基因、KEGG及GO富集,并qPCR验证关键基因。
在自身免疫样环境中验证p75NTR对CD21lo B细胞的调控作用。
对6周龄雌性小鼠腹腔注射pristane,18-22周后分析脾脏B细胞p75NTR表达和CD21lo比例。
探究p75NTR调控CD21lo B细胞的下游信号机制。
Western blot检测p-p65、p-Erk和Traf6表达,并用GeneMANIA分析Ngfr与Tbx21的潜在相互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 流式细胞术 | PerCP/Cyanine5.5抗小鼠CD45抗体 | Biolegend | 157208 |
| APC抗小鼠/人CD45R/B220抗体 | Biolegend | 103212 | |
| PE抗小鼠CD21/CD35抗体 | Biolegend | 123409 | |
| FITC抗小鼠CD21/CD35抗体 | Biolegend | 123407 | |
| APC/Cyanine7抗小鼠CD23抗体 | Biolegend | 101630 | |
| PE抗人/小鼠CD271抗体 | Thermo Fisher | 12-9400-41 | |
| FITC抗小鼠CD86抗体 | Biolegend | 159220 | |
| BV421抗小鼠CD3抗体 | BD | 740014 | |
| PE/Cyanine7抗小鼠/人CD44抗体 | Biolegend | 103030 | |
| Western blot | p75NTR兔单克隆抗体 | CST | 8238 |
| TRAF6兔单克隆抗体 | CST | 8028 | |
| Sortilin多克隆抗体 | Proteintech | 12369-1-AP | |
| NF-κB p65兔单克隆抗体 | CST | 8242 | |
| 磷酸化NF-κB p65兔单克隆抗体 | CST | 3033 | |
| p44/42 MAPK (Erk1/2)兔单克隆抗体 | CST | 4695 | |
| 磷酸化p44/42 MAPK (Erk1/2)兔单克隆抗体 | CST | 4370 | |
| HRP偶联β-肌动蛋白单克隆抗体 | Proteintech | HRP-60008 | |
| GAPDH多克隆抗体 | Proteintech | 10494-1-AP | |
| HRP偶联山羊抗小鼠IgG(H+L) | Proteintech | SA00001-1 | |
| HRP偶联山羊抗兔IgG(H+L) | Proteintech | SA00001-2 | |
| 免疫组化 | 生物素偶联山羊抗兔IgG(H+L) | Proteintech | SA00004-2 |
| 细胞分选 | 小鼠CD45R(B220)磁珠 | MiltenyiBiotec | 130-049-501 |
| 体内模型 | 姥鲛烷 | Sigma-Aldrich | P2870 |
| 细胞刺激 | CpG-B (ODN 1826) | InvivoGen | tlrl-1826 |
| R848 | InvivoGen | tlrl-r848 | |
| 流式细胞术 | 固定缓冲液 | Invitrogen | 00-8222-49 |
| 补偿微球 | Invitrogen | 01-3333-42 | |
| 细胞处理 | 红细胞裂解缓冲液 | Biosharp | BL503B |
| 免疫组化 | 吐温20 | Biosharp | BS100 |
| Triton X-100 | Biosharp | BS084 | |
| 细胞培养 | 1X PBS(无Ca2+) | Biosharp | BL302A |
| 细胞分离 | Ficoll | GE Health | 17-1440-02 |
| 细胞培养 | DMEM基础培养基(1X) | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 10091-148 | |
| 链霉素/青霉素 | Gibco | 15140-12 | |
| L-谷氨酰胺 | Gibco | A2916801 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Ambion | 15596076 |
| qPCR | SYBR qPCR SuperMix | Novoprotein | E096 |
| Western blot | SDS-PAGE | Epizyme | PG112 |
| RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | P0013C | |
| 5X SDS-PAGE上样缓冲液 | Beyotime | P0015 | |
| PageRuler预染蛋白标记 | Thermo Fisher | 26616 | |
| 免疫荧光 | DAPI | Southern Biotech | 0100-20 |
| DNA电泳 | 1X TAE缓冲液 | Tsingke | TSG001 |
| 100 bp DNA标记 | Tsingke | TSJ100-100 | |
| 琼脂糖 | Tsingke | TSJ001 | |
| Western blot | Immobilon ECL Ultra Western HRP底物 | Millipore | WBULS0100 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Bioss | C05-02001 |
| 多因子检测 | LEGENDplex™羧基微球A4 | Biolegend | 740167 |
| 免疫组化 | DAB显色试剂盒 | ZSBIO | ZLI-9019 |
| ABC HRP试剂盒 | Vector Labs | PK-6100 | |
| cDNA合成 | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo | K1622 |
| 流式细胞术 | Zombie NIR™可固定活力试剂盒 | Biolegend | 423105 |
| 动物模型 | C57BL6/J小鼠 | Hunan Silaikejingda Experimental Animal | -- |
| P75fl/fl小鼠 | Beijing Viewsolid Biotech | -- | |
| CD19-Cre小鼠 | Beijing Viewsolid Biotech | -- | |
| 流式细胞术 | BD Trucount管 | BD | 340334 |
| Western blot | PVDF转印膜 | MerckMillipore | ISEQ00010 |
| 细胞分离 | 70 μm尼龙细胞筛网 | Biosharp | BS-70-CS |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外B细胞培养与刺激 | B220+ B细胞分离纯度>95%,刺激浓度:CpG-B 0.25 μmol,R848 200 ng/mL,作用时间24小时 阅读提示:STAR★Methods: Cell isolation and in vitro culture |
| 体内pristane模型 | 6周龄雌性小鼠,pristane 0.5 mL腹腔注射,PBS对照,18-22周后取材 阅读提示:STAR★Methods: Pristane immunization |
| 流式细胞术 | 抗体克隆号及稀释度、染色时间(30分钟4℃)、死活染料使用 阅读提示:STAR★Methods: Flow cytometry |
| 转录组分析 | RNA-seq差异基因筛选标准:P-adjust<0.05且倍数变化≥2 阅读提示:STAR★Methods: RNA-seq analysis |
| 统计方法 | 多组比较用ANOVA,两组比较用非配对t检验,p<0.05为显著 阅读提示:STAR★Methods: Quantification and statistical analysis |