验证TJ0113诱导HEK293T细胞线粒体自噬
评估TJ0113是否能在细胞水平诱导线粒体自噬。
使用CCCP处理HEK293T细胞诱导线粒体损伤,用不同浓度和时间的TJ0113处理,通过Western blot检测自噬和线粒体蛋白标志物,JC-1染色检测线粒体膜电位。
Novel mitophagy inducer TJ0113 alleviates pulmonary inflammation during acute lung injury.
包括HEK293T细胞、BMDMs和LPS诱导ALI小鼠模型等多个证据层级,包含功能验证和机制验证,且采用多种检测方法。
HEK293T细胞 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) LPS诱导的ALI小鼠模型(C57BL/6小鼠)
HEK293T细胞中TJ0113处理浓度(2.5、5、10 μM)和时间(6、12、24 h) CCCP诱导线粒体损伤的浓度(30 μM)和处理时间(6 h) LPS诱导ALI小鼠模型的剂量(5 mg/kg用于病理评估,20 mg/kg用于生存分析) TJ0113给药方式(腹腔注射)和剂量(20 mg/kg) BMDMs中TJ0113(10 μM)和Mdivi-1(10 μM)的浓度及处理时间(6 h)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估TJ0113是否能在细胞水平诱导线粒体自噬。
使用CCCP处理HEK293T细胞诱导线粒体损伤,用不同浓度和时间的TJ0113处理,通过Western blot检测自噬和线粒体蛋白标志物,JC-1染色检测线粒体膜电位。
明确TJ0113诱导的线粒体自噬是否通过PINK1-Parkin通路。
通过qPCR检测PINK1、Parkin、BNIP3、FUNDC1的mRNA表达,并用Western blot验证PINK1磷酸化水平。
评估TJ0113在体内对LPS诱导的ALI的保护效果。
建立小鼠ALI模型,通过腹腔注射TJ0113,进行生存分析、病理评估(BALF细胞计数、湿干比、蛋白浓度、组织学评分等)。
验证TJ0113是否抑制LPS刺激的BMDMs中的炎症反应。
用LPS和TJ0113(加或不加Mdivi-1)处理BMDMs,检测NF-κB通路和炎症小体通路相关蛋白及炎症因子的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco | C11875500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 10082147 | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 重组小鼠巨噬细胞集落刺激因子 | Novoprotein | CB34 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8细胞增殖/毒性检测试剂盒 | MedChemExpress | HY-K0301 |
| 细胞处理 | 脂多糖 | -- | -- |
| Midvi-1 | MedChemExpress | HY-15886 | |
| 线粒体膜电位检测 | 增强型线粒体膜电位检测试剂盒 | Beyotime | C2003S |
| 细胞培养 | 红细胞裂解液 | Sigma-Aldrich | R7757 |
| BALF收集 | 磷酸盐缓冲液 | Solarbio | P1010 |
| 细胞计数 | Count star细胞计数仪 | -- | -- |
| BALF染色 | 瑞氏-吉姆萨染色液 | Baso | BA-4017 |
| 蛋白浓度测定 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| 蛋白印迹 | 1X SDS-PAGE上样缓冲液 | Beyotime | P0015A |
| PVDF膜 | Immobilon | ISEQ00010 | |
| LC3B兔多克隆抗体 | Abcam | ab168831 | |
| β-actin小鼠单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 | |
| P-IKK α/β兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 2697 | |
| P-IκBα兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 2859 | |
| p-p65兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| p65兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| IκBα兔多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 9242 | |
| p62兔多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 5114 | |
| IKKα/β兔单克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 2697 | |
| COXIV兔多克隆抗体 | Cell Signaling Technology | 4850 | |
| TOM20小鼠单克隆抗体 | Santa Cruz | sc-17764 | |
| p-PINK1兔多克隆抗体 | Signalway Antibody | 29297 | |
| NLRP3小鼠单克隆抗体 | AdipoGen | AG-20B-0014 | |
| 总蛋白和裂解IL-1β抗体 | Abmart | P50520-1R1S | |
| caspase-1兔多克隆抗体 | Proteintech | 22915-1-AP | |
| 山羊抗兔IgG H&L (HRP) | Invitrogen | A32732 | |
| 山羊抗小鼠IgG H&L (HRP) | Invitrogen | A32723TR | |
| 增强化学发光系统 | Share-bio | SB-WB011 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Takara Biotechnology | 9109 |
| NanoDrop 2000分光光度计 | Thermo Scientific | -- | |
| RT-PCR | 逆转录试剂 | Takara Biotechnology | DRR037A |
| TB Green® Premix Ex Taq® | Takara | -- | |
| StepOnePlus PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| ELISA | 小鼠CXCL1 ELISA试剂盒 | R&D systems | MKC00B |
| 小鼠CXCL2 ELISA试剂盒 | R&D systems | MM200 | |
| 小鼠IL-6 ELISA试剂盒 | R&D systems | M6000B | |
| 小鼠IL-18 ELISA试剂盒 | Neobioscience | EMC011.96 | |
| 小鼠IL-1β ELISA试剂盒 | DAKEWE | 1210122 | |
| 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | DAKEWE | 1217202 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养和TJ0113处理 | HEK293T细胞的培养基成分、TJ0113的溶解方法、处理浓度和时间,以及线粒体损伤诱导剂CCCP的浓度和时间。 阅读提示:见Methods 2.1节 |
| 线粒体自噬检测 | JC-1染色步骤、流式细胞仪激发波长、Western blot抗体和检测指标。 阅读提示:见Methods 2.2节和2.11节 |
| BMDMs分离和培养 | 骨髓细胞分离方法、M-CSF浓度和分化时间、培养基成分。 阅读提示:见Methods 2.3节 |
| ALI小鼠模型 | 小鼠品系、性别、年龄、LPS给药方式(气管内)、剂量、TJ0113给药方式(腹腔)、剂量和时间。 阅读提示:见Methods 2.4和2.5节 |
| 炎症因子检测 | qPCR引物序列、ELISA试剂盒和检测流程。 阅读提示:见Methods 2.12和2.13节 |