免疫检查点PTPN2预测人类癌症的预后和免疫治疗反应

背景：PTPN2是非受体蛋白酪氨酸磷酸酶家族成员，在肿瘤发生和癌症免疫治疗中具有关键作用。然而，大多数关于PTPN2在癌症中作用的研究仅限于特定癌症类型。因此，本研究旨在探讨PTPN2在人类癌症中的预后意义及其在肿瘤微环境中的功能。方法：为了阐明此问题，我们利用TCGA、GTEx、CGGA、GEO、cBioPortal、STRING、TISCH、TIMER2.0、ESTIMATE和TIDE数据库，研究了PTPN2在人类癌症中的表达水平、预后价值、基因组改变、分子功能、免疫功能以及免疫治疗预测能力。此外，使用CCK-8实验检测PTPN2对细胞增殖的影响。通过细胞免疫荧光分析探究PTPN2的细胞定位。通过Western blot检测PTPN2下游的分子靶标。最后，使用TCGA-LGG队列构建列线图模型，并用校准曲线和时间依赖性ROC进行评价。结果：PTPN2在大多数癌症中高表达，并与ACC、GBM、LGG、KICH和PAAD的不良预后相关，而在OV、SKCM和THYM中相反。PTPN2敲低促进黑色素瘤细胞增殖，同时显著抑制结肠癌和胶质母细胞瘤细胞增殖。此外，由PTPN2基因编码的TC-PTP主要定位于细胞核和细胞质，并可负调控JAK/STAT和MEK/ERK通路。引人注目的是，PTPN2敲低显著增加了PD-L1的丰度。PTPN2在单核/巨噬细胞中高表达，并与多种免疫浸润细胞呈正相关，尤其是CD8+ T细胞。值得注意的是，DLBC、LAML、OV和TGCT中PTPN2高表达组患者对免疫治疗反应更好，而ESCA、KIRC、KIRP、LIHC和THCA中相反。最后，在LGG上构建的列线图模型表现出高预测准确性。结论：免疫检查点PTPN2是预测癌症预后和免疫治疗疗效的有力生物标志物。机制上，PTPN2负调控JAK/STAT和MEK/ERK通路以及PD-L1的丰度。