临床样本检测
检测银屑病患者皮肤和健康对照中miR-205-5p及其靶基因的表达水平。
收集8例银屑病患者斑块和9例健康受试者皮肤活检样本,通过qRT-PCR检测miR-205-5p、Ang-2、VEGFA和BAMBI的表达,并进行相关性分析。
miR-205-5p inhibits psoriasis-associated proliferation and angiogenesis: Wnt/β-catenin and mitogen-activated protein kinase signaling pathway are involved
包含患者皮肤样本、细胞实验(HaCaT、HUVEC)和体内动物模型(IMQ诱导小鼠),并进行了靶基因验证(荧光素酶报告)和功能研究(CCK-8、迁移、管形成等)。
HaCaT细胞(人永生化角质形成细胞) HUVEC(人脐静脉内皮细胞) IMQ诱导的银屑病小鼠模型 银屑病患者皮肤组织
miR-205-5p的表达水平在银屑病皮肤组织中下调 miR-205-5p靶向Ang-2、VEGFA和BAMBI的3'-UTR miR-205-5p抑制HaCaT细胞和HUVEC的增殖、迁移和管形成能力 体内miR-205-5p agomiR减轻IMQ诱导的小鼠银屑病症状 miR-205-5p使Wnt/β-catenin和MAPK信号通路失活
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测银屑病患者皮肤和健康对照中miR-205-5p及其靶基因的表达水平。
收集8例银屑病患者斑块和9例健康受试者皮肤活检样本,通过qRT-PCR检测miR-205-5p、Ang-2、VEGFA和BAMBI的表达,并进行相关性分析。
验证miR-205-5p是否直接靶向Ang-2、VEGFA和BAMBI。
使用starBase预测靶基因,构建含有3'-UTR野生型或突变型的pmirGLO载体,与miR-205-5p mimic共转染293T细胞,进行双荧光素酶报告基因检测。
研究miR-205-5p对HaCaT细胞和HUVEC增殖、迁移和管形成的影响。
用IL-6、IL-22、IL-17A刺激HaCaT细胞;将miR-205-5p mimic或scramble mimic转染至HaCaT和HUVEC,进行CCK-8、流式细胞周期、免疫荧光Ki-67、伤口愈合、管形成等实验。
评估miR-205-5p在体内对IMQ诱导小鼠银屑病模型的影响。
将BALB/c小鼠随机分为4组,涂抹IMQ乳膏6天,同时注射miR-205-5p agomiR或NC agomiR,第7天处死,评估皮肤炎症严重程度、组织病理和分子表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 12100-46 |
| 胎牛血清 | Hyclone | SH30084.03 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000试剂 | Invitrogen | 11668-019 |
| Western blotting | PVDF膜 | Millipore | -- |
| MMP-2抗体 | Bioss | bs-4599R | |
| MMP-9抗体 | Bioss | bs-4593R | |
| Ang-2抗体 | Bioss | bs-0677R | |
| Tie2抗体 | Bioss | bs-23638R | |
| BAMBI抗体 | Proteintech | 16100-1-AP | |
| β-catenin抗体 | Proteintech | 17565-1-AP | |
| VEGFA抗体 | Abcam | ab51745 | |
| VEGFR2抗体 | Bioss | bs-0565R | |
| p-p38抗体 | Cell Signaling Technology | #4511 | |
| p38抗体 | Cell Signaling Technology | #9212 | |
| p-ERK抗体 | Abcam | ab214036 | |
| ERK抗体 | Cell Signaling Technology | #9102 | |
| 山羊抗兔IgG辣根过氧化物酶 | Solarbio | SE134 | |
| 山羊抗小鼠IgG辣根过氧化物酶 | Solarbio | SE131 | |
| 增强型氟化学发光系统 | Solarbio | PE0010 | |
| qRT-PCR | SYBR Green PCR预混液 | Solarbio | SY1020 |
| ExicyclerTM实时荧光定量PCR系统 | Bionner | -- | |
| 迁移观察 | 倒置显微镜 | Motic | AE31 |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | KeyGen Bio TECH | KGA317 |
| 多功能酶标仪 | BIOTEK | ELX-800 | |
| 管形成实验 | Matrigel基底膜基质 | Becton Dickinson | 356234 |
| 免疫荧光 | Triton-X 100 | Beyotime | ST795 |
| Ki-67抗体 | Proteintech Group | 27309-1-AP | |
| Cy3标记的山羊抗兔IgG | Beyotime | A0516 | |
| 细胞周期检测 | 细胞周期分析试剂盒 | Beyotime | C1052 |
| 流式细胞仪 | Becton Dickinson | C6 | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | pmirGLO载体 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | KeyGen Bio TECH | KGAF040 | |
| 动物实验 | 咪喹莫特乳膏 | Sichuan Mingxin Pharmaceutical | H20030128 |
| miR-205-5p agomiR | Genepharma | -- | |
| 免疫组织化学 | Ki-67抗体 | Abcam | ab16667 |
| 统计分析 | GraphPad Prism 7.0软件 | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本检测 | 样本类型:银屑病患者斑块(PP)和健康受试者(HS)皮肤,样本量:PP n=8,HS n=9;存储条件:-80°C;检测方法:qRT-PCR。 阅读提示:Methods 部分“Patients and healthy sample” |
| 细胞培养和转染 | 细胞系:HUVEC和HaCaT;培养基:DMEM+10% FBS;转染试剂:Lipofectamine 2000;转染物:miR-205-5p mimic或scramble mimic;培养条件:37°C、5% CO2。 阅读提示:Methods 部分“Cell culture and transfection” |
| 细胞功能实验 | HaCaT细胞处理:50 ng/mL IL-6、IL-22或IL-17A处理24小时;CCK-8实验:3×10^4细胞/孔,96孔板;细胞周期检测:流式细胞术;迁移实验:1 μg/mL mitomycin C预处理1小时,划痕后24小时观察;管形成实验:Matrigel包被,18小时。 阅读提示:Methods 部分“Wound healing assay”、“CCK-8 assay”、“Tube formation assay”、“Detection of cell cycle”以及结果部分图3和图4的图注。 |
| 动物实验 | 小鼠品系:雄性BALB/c(6只/组);IMQ剂量:62.5 mg/天,局部涂抹6天;agomiR剂量:10 nmol/天,皮下注射;处死时间:第7天;饲养条件:22±1°C、45-55%湿度、12小时光暗循环。 阅读提示:Methods 部分“Animal model”和“Clinical severity score” |