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问
为何我的 WB 压出的片子整张膜都发光?
我是金博士
1、转膜条件基本可以,一抗与二抗浓度均较高。建议:(1)先做二抗的稀释度(同时不同的ECL均需检测),用点杂交,用1倍TBS或PBS稀释二抗做不同的梯度,比如1:1000,1:2000,1:4000,稀释好后各取1ul点在NC膜上,RT干燥,加发光液,曝光,确定二抗的合适稀释度。二抗浓度高了HRP会把ECL中的底物消耗掉,在你加上ECL的时候会很亮,但是很快就会减弱了,首先要保证二抗的稀释度合适才
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问
cDNA 产量的很低是什么原因啊?该怎么办?
tao0129
可能的原因:1.RNA模板质量低。2.对mRNA浓度估计过高。3. 反应体系中存在反转录酶抑制剂或反转录酶量不足。4.同位素磷32过期。5.反应体积过大,不应超过50 μl。
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问
某一孔荧光信号特别强是怎么回事?
tao0129
原因:1. 试剂配制时反应液没完全溶化,导致探针量在一管中增多。2.试剂配制时没有充分混匀致各管中各成分的量不同。3.也可能是PCR仪热槽被荧光物质污染,这时就要清除热槽中的污染。
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问
PCR 检测阳性,酶切无带的克隆,测序是否有结果?
tao0129
这种情况下,最好不要送去测序,最好重新做连接。当然这种情况的出现有一种可能是细菌培养时间过长,导致质粒被甲基化修饰所造成的。此时,你只需重新培养细菌,重新提取质粒即可。但这种情况的出现,还有一种可能是PCR假阳性,尤其是在克隆片段较短时会出现。那么这时,你只能重新做连接。建议:干脆重新做连接还比较放心。注意:你的片段比较小,你酶切后的片段浓度能否在电泳后出现带,这一点你一定要弄清,你必须保证浓度酶
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问
在做 PCR 时比较合适的扩增产物片段长度是多少?
赵栋2012
没问题,但要注意保真性,也就是用高保真的酶或者采用分段扩增的办法。如有必要有条件,就测序验证。引物设计与你的目的片断长度似乎关系不大,其序列的特异性则是很重要的。有很多常规提高产物特异性的办法,就不一一列举了如果受到模办的局限,不妨采用巢式PCR之类的办法。
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问
荧光定量 PCR 扩增产物能否直接进行琼脂糖凝胶电泳?
赵栋2012
确切的说荧光定量PCR产物跑凝胶看到条带说明你的产物很理想,但看不到条带不能说就没有产物,因为荧光定量PCR反应过程并不是严格意义上的循环扩增过程,因为大部分都没有退火温度。
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问
如何估计 RT-PCR 扩增产物的大小?
tao0129
你设计的正、反向引物的起止序列编号之差就是扩增产物的长度,如果一段使用oligo(T)就加上它的长度就可以了。
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问
为什么荧光定量 PCR 的扩增产物长度不能太长?
tao0129
你说的这种Real-time PCR应该是通过Taqman探针检测的。Taqman探针为基础的Real-time PCR以引物和探针序列决定反应的特异性,而通过荧光强度判断探针降解程度,从而推断模板量。
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问
请问一抗和二抗孵育条件如何比较?
tao0129
1.一抗孵育温度有几种:4度、室温、37度,其中4度效果最佳;孵育时间:这与温度、抗体浓度有关,一般37度1~2 h,而4度过夜和从冰箱拿出后37℃复温45 min。2. 二抗一般室温或37度30 min~1 h,具体时间需要摸索。
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问
PCR 产物电泳为什么都在 marker 最高的条带之上?
tao0129
这表示你的扩增不成功。解决方法:1. 是调整PCR体系的条件啦,看看你的试剂、试验参数有没有问题。2. 如果确信自己的PCR技术没问题的话,换一种引物试试看。如果另一种引物能够扩出来,那就是你的引物有问题啦!
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问
PCR 产物是否可以直接连到相应的载体上?
tao0129
1克隆产物应该用载体两端含有的引物进行鉴定。2. PCR产物是否可以直接连接到相应载体,要看你PCR用的什么酶。3.用Taq酶的产物末端自动加A,为黏性末端,可以直接连接;如果是用高保真酶,产物是平末端,必须进行磷酸化或者末端加A才能连接。
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问
扩增产物居然有很长的拖尾现象?
tao0129
使用Taqman探针做荧光定量PCR的产物一般都会做的很小,100 bp 多点吧,最大也不超过200 bp 的,你用的退火温度是50度,非特异扩增是不可避免的,即使引物的特异性很好,引物二聚体也肯定存在,而且大小和产物接近,所以在电泳的时候出现脱尾现象很正常。为什么扩增曲线会很好呢?因为使用了Taqman探针,只有特异性扩增产物会产生荧光,把引物二聚体和非特异扩增都屏蔽了,所以扩增曲线会很好!另外
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问
PCR 扩增产物如何保存?最多可以保存多久呢?
tao0129
放在-20度应该可以保存一段时间。即使放4度也可以放一段时间。酶切产物也可以放一段时间,如果只是跑胶的话,如果第一次跑的不理想,可以再跑一次。但如果做分子生物学实验,另说。
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问
一抗 4℃ 孵育后为什么要进行 37℃ 复温?
赵栋2012
1. 一方面,防止切片从4℃直接放入PBS易脱片。2. 另一方面,使抗原抗体结合更稳定。一般不需要,但对表达较弱的抗原可能有用,4℃和37℃时分子运动方式不同,前者分子碰撞机率和运动速度小于后者,后者结合更快,但敏感性也提高了并易造成非特异染色。
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问
免疫组化中的血清封闭原理?
tao0129
封闭血清的原理主要有两点。第一是待检样本会非特异性的和蛋白结合,从而导致背景过高,因此可以用BSA或血清封闭掉这部分非特异性的结合,从这点看,BSA和血清没有明显区别。第二是待检样本中可能会有Fc受体,可以和抗体恒定区结合,与抗体特异性无关,封闭血清中有抗体,因此用血清可以封闭掉一抗及二抗和样本Fc受体之间结合。BSA则无法封闭Fc受体。
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问
PCR 扩增产物浓度不够
赵栋2012
对于克隆所需,你可以多扩增几管,然后合并回收/浓缩。提高产物量建议:1. 如果你没有引物二聚体,建议你提高引物浓度试试。2.尽量降低退火温度。3. 鉴定用的话可以增加循环数,克隆的话就没必要了(<35),循环数增加突变几率也会增加的。4. 如果你觉得模板浓度太高,可以降低浓度的,太高不好,引物正确配对的机会降低。5. 鉴定用可以考虑重新设计引物的,扩增产物长度不必太长200bp左右就行了。6
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问
制作下层凝胶后,用异丁醇封闭,可否用其他代替,比如正丁醇或水?
我是金博士
正丁醇、乙醇都是可以的,我们以前就用过。水就不行了。
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问
通过 PCR 扩增出来的目的基因有粘性末端或平末端吗?
tao0129
常规Taq酶PCR产物3‘端带A,为粘性末端。高保真酶如PFU之类的PCR产物为平端。详见你使用的Taq酶说明。
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问
封闭血清的选择原则是什么?
tao0129
1.膜上或切片上有剩余的位点可以非特异性吸附抗体,造成后续结果的假阳性。2.封闭血清一般是和二抗同一来源的,血清中动物自身的抗体,预先能和组织中有交叉反应的位点发生结合,否则在后面的步骤中如果和二抗发生结合,会造成背景。3. 也可以用小牛血清、BSA、羊血清等,但不能与一抗来源一致。
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问
PCR 扩增产物于引物区会发生移码突变吗?
tao0129
一般来说测序在最开始的20个碱基是不太会有好的峰型的,但是如果你几次测序都是这个结果,那么就应该是引物合成的问题了。一般生工默认的合成引物会有三种纯化方式,PAGE胶纯化,过柱子和HPLC,三种的价格是PAGE另外,你的酶切位点与突变的位点不在一个位置,所以由于酶切造成的可能性不是很大,但也不能排除这个原因。
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