实验问答

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科研学霸天团，48小时有问必答

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问单细胞测序多样本两组比较分析

loveliufudan

针对单细胞测序多样本的两组比较，您可以尝试使用以下工具和流程：差异基因分析工具：常用的差异基因分析工具包括DESeq2，edgeR，limma-voom等，您可以根据您的数据特点选择适合的工具。这些工具可以识别出在两个不同组别中表达显著差异的基因，从而帮助您了解它们的生物学意义和相关的通路信息。数据预处理：在进行差异基因分析之前，您需要对数据进行预处理，例如，质量控制，过滤低质量细胞和基因，归一化

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问hepg2细胞做迁移实验transwell穿不过去

loveliufudan

在您的实验中，由于细胞大小超过了孔径大小，这可能是导致细胞无法穿过半透膜的原因之一。为了确定是否是孔径大小的问题，您可以尝试使用具有更大孔径的Transwell小室进行实验。您还可以尝试使用其他细胞类型，看看它们是否可以穿过半透膜，以确认实验方法是否正确。另外，您需要确保在实验过程中使用适当的实验条件，例如适当的培养基、细胞密度和处理时间。如果有必要，您可以尝试优化实验条件，以提高细胞迁移的效率。

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问痤疮丙酸杆菌

土井挞克树

痤疮丙酸杆菌在液体培养基中的照片如图

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问aSMA抗体为什么染进核了？求助求助！

loveliufudan

如果您的aSMA染色显示出了细胞核的颜色，可能会有以下几种可能性：实验操作失误。例如，未完全去除细胞外的aSMA抗体，或者使用了与aSMA抗体交叉反应的抗体。染色效果异常。可能是染色试剂批次变异，或者是染色温度、时间等实验条件不恰当。样本细胞异质性。不同的细胞类型在染色效果上可能会存在差异，可能会导致aSMA染色在细胞核中出现颜色。

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问R语言用psm构建完nomogram后画校准曲线时报错

loveliufudan

根据您提供的代码，您可能是因为没有正确调用survest.psm()函数，导致在进行预测生存曲线时出现了错误。可以尝试以下更改代码：#nomogram构建rm(list=Is())library (Hmisc)library (grid)library(lattice)library (Formula)library (ggplot2)library(rms)library (survival)l

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问Annexin V-FITC/PI染色出现假阳性？

sswei

在凋亡实验中，经常会出现假阳性或与预期结果不符的情况，可能的原因有补偿调节不当、细胞浓度过高、消化过度、药物干扰、药物处理时间过长、样本自身问题等多个方面，过度消化和机械损伤都会引起细胞膜的损伤，造成假阳性。

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问有没有做磁珠分离大鼠肺组织肺间质巨噬细胞的老师呢

loveliufudan

下面是一些可能适用于您的实验室的试剂盒和磁珠供您参考：大鼠肺间质巨噬细胞磁珠分离试剂盒，例如 Miltenyi Biotec 公司的大鼠肺间质巨噬细胞分离试剂盒。这个试剂盒采用磁珠分离技术，能够高效地纯化大鼠肺组织中的巨噬细胞。Dynabeads 公司的 CD11b+ 磁珠。这种磁珠可以选择大鼠 CD11b+ 阳性细胞，包括肺间质巨噬细胞等，从单细胞悬液中高效纯化。大鼠巨噬细胞表面标记的特定抗体和

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问求助，生信分析怎么做呀？

loveliufudan

进行两个蛋白的生信分析需要根据具体情况选择不同的方法，以下是一些可能的方向和方法：蛋白质互作网络分析：可以通过蛋白质相互作用数据库（如STRING）或文献资料中已有的蛋白质互作信息，构建蛋白质相互作用网络，并分析两个蛋白在该网络中的位置和关系。基因表达谱分析：可以通过公共基因表达数据库（如GEO、TCGA等）或实验室自己的基因表达数据，筛选和比较两个蛋白相关的基因，进行差异分析和富集分析，了解其相

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问LPS诱导炎症模型用于后期实验是先做转染还是先诱导炎症

loveliufudan

在进行LPS诱导炎症模型后期实验时，一般的操作步骤是先诱导炎症，然后进行转染。这是因为LPS诱导炎症是一种化学物质处理的方式，能够诱导机体产生炎症反应，从而模拟实际的疾病情况，这是实验的基础。而转染则是在诱导炎症后对细胞进行基因转染，用于检测某些基因在炎症反应中的作用。具体而言，实验步骤可以如下进行：培养待处理的细胞系。给细胞系加入LPS，使其产生炎症反应。在产生炎症反应的同时，进行转染实验，将感

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问大佬们求帮忙看一些扫描电镜图片

土井挞克树

电镜对比下可以算是焦亡诱导成功。

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问caspase1提蛋白时候，有什么特别的细节吗？，其他指标都很清楚，但是它爆出来就很淡

loveliufudan

在进行Caspase-1的蛋白提取时，有几个细节需要注意，这些细节可以帮助提高Caspase-1的检测灵敏度：细胞裂解条件的优化：不同的细胞类型和不同的实验条件可能需要不同的细胞裂解条件。一般来说，使用含有蛋白酶抑制剂的细胞裂解缓冲液可以提高Caspase-1的稳定性和活性。此外，应该注意避免过度处理细胞，以避免Caspase-1的降解和失活。样品保存和处理：样品的保存和处理可能会影响Caspas

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问cbioportal生信分析

loveliufudan

是的，cBioPortal可以分析某基因在不同子宫内膜癌分子分型中的表达差异。以下是步骤：进入 cBioPortal 的网站并选择 TCGA-UCEC 数据集。在左侧的“Quick Select”栏中，选择您感兴趣的基因名称，例如PAX8。点击“Case Sets”选项卡，选择您感兴趣的子宫内膜癌分子分型。点击“Charts”选项卡，选择您想要的表达分析类型，例如“mRNA Expression

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问怎样让给药后的细胞恢复状态

loveliufudan

在您的实验中，给细胞低浓度的顺铂处理24小时后撤药，但细胞不能恢复之前的状态，这可能是由于顺铂引起的细胞毒性过大，细胞无法恢复。要让细胞恢复状态，您可以尝试以下方法：适当降低顺铂的浓度：如果细胞对顺铂的毒性过大，可以尝试适当降低顺铂的浓度，或者缩短处理时间，以减少对细胞的影响。加入细胞生长因子：细胞生长因子可以促进细胞生长和分裂，有助于加速细胞恢复。您可以根据实验需求选择适当的细胞生长因子加入到培

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问单细胞测序seurat分析为什么合并样本分析后图还是五个导入样本

loveliufudan

在单细胞测序的分析中，合并多个样本可以增加数据量，提高分析的可信度和准确性。一般来说，单细胞测序实验的数据量较小，单个细胞的表达水平变化也较大，因此需要对多个样本进行合并，才能获得稳定的结果。对于您提到的情况，可能是因为在Seurat分析中，您在合并样本之前已经导入了五个样本，然后合并前两个样本，但是在后续的质控步骤中，您可能没有正确更新分析的对象，导致分析结果显示了所有五个导入的样本。您可以检查

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问骨关节炎与卵泡刺激素多肽序列

loveliufudan

最近的研究表明，FSHβ C末端多肽片段（FSHβ-CTP）具有潜在的药理活性，可以通过与FSHR结合来刺激卵巢激素的产生，从而调节生殖系统的功能。此外，一些FSH多肽片段也被用于治疗乳腺癌等癌症。因此，未来研究中可以考虑探索FSH多肽片段在治疗人类FSHR表达阳性的骨关节炎软骨细胞方面的潜在作用。需要进一步的实验和临床研究来评估这些分子在骨关节炎治疗中的应用前景。

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问请教trizol法提取外泌体RNA该如何弄。

loveliufudan

以下是Trizol法提取外泌体RNA的步骤：收集外泌体：用离心或超声波等方法收集培养基或生理液中的外泌体。建议在收集前，预先处理样品，如去除细胞残留物、碎片等。加入Trizol：向外泌体悬液中加入 Trizol 试剂，建议加入试剂体积是悬液体积的 10% 到 20%。轻轻摇晃管子使 Trizol 均匀分散。加入氯仿：加入氯仿等有机溶剂，摇晃离心管混合均匀。离心管在室温下放置5-10分钟，让混合物充

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问求助！！！！！

loveliufudan

在运行PmTOR Western blot实验时，常用的marker有常规的蛋白质分子量标准品（如Rainbow™ 磷酸化标准品或PageRuler™ Prestained Protein Ladder等），以及PmTOR的两个磷酸化位点Ser2448和Ser2481。这些marker可以用来确定PmTOR蛋白在Western blot上的位置，并且可以用来验证实验条件是否正确。同时，还可以使用总

1 回答174 围观

问R语言的cox预测模型的校准曲线

loveliufudan

似乎是在 calibrate 函数的调用中出现了问题。具体来说，错误信息中提示说您必须在原始拟合函数中指定 x=T 和 y=T，但是在您的代码中并没有明确指定这些参数。因此，您需要检查以下几点：在 cph 函数的调用中，您是否明确指定了 x=T 和 y=T。这两个参数分别指定是否返回风险比例和生存概率，是 calibrate 函数需要的参数之一。检查 calibrate 函数的调用中是否有语法错误

2 回答909 围观

问肿瘤专业投稿经验

loveliufudan

您可以尝试以下方法来找到帮助修改文章的老师或网站：寻找专业的写作辅导机构或论文编辑服务，这些机构通常会提供专业的写作和编辑服务，帮助您修改文章并提高文章的质量。在线寻找专业的写作指导网站或社区，如Academia.edu、ResearchGate等。这些网站通常会有专业的学者和编辑提供帮助和建议。联系相关专业领域的学者或医学专家，请求他们给予您的文章评价和修改建议。寻找志同道合的作者或论文写作小组

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问提取植物内生菌DNA

土井挞克树

可以直接用提取后再分离纯化，也可先分离纯化然后再提取

4 回答729 围观

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