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        如何进行抗原表位筛选?

        user-title

        dxy_ajl9bi24

        有四个基因,要设计一个融合蛋白,每种基因筛选T/B细胞抗原表位,再用linker连接,请问抗原表位筛选有没有推荐的软件或者方法?

        wx-share
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        2 个回答

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        对于筛选T/B细胞抗原表位的问题,以下是一些常用的软件和方法:

        IEDB(The Immune Epitope Database):IEDB是一个公共数据库,收集了人类和其他物种中已知的T/B细胞表位信息。可以使用该数据库中的工具进行序列分析和抗原表位预测。可以使用IEDB中的线性和非线性预测工具,例如BepiPred、NetMHC、NetCTL等。

        DiscoTope:DiscoTope是一个基于机器学习的工具,用于预测抗原表位的线性和非线性表位。它结合了蛋白质结构和序列特征,可以进行高通量的抗原表位预测。

        PEPOP:PEPOP是一个在线的预测工具,可以用于预测蛋白质序列中的线性和非线性表位。它使用序列和结构信息进行预测,可以对多个物种进行预测。

        ElliPro:ElliPro是一个在线的工具,可以用于预测抗原表位的线性和非线性表位。它基于蛋白质结构信息进行预测,并提供了交互式的3D结构可视化。

        ABCpred:ABCpred是一个在线的工具,用于预测蛋白质中的B细胞表位。它基于自适应Bayesian分类器进行预测,并可以对多个物种进行预测。

        您可以根据自己的需求选择适合的软件或方法进行抗原表位预测和筛选。请注意,这些工具预测的结果可能会有误差,需要进行实验验证。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        可以采用抗原分子筛选工具来进行筛选

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