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请问生信分析是选GO&Kegg还是GSEA?
loveliufudan
选择何种生物信息学分析方法需要根据实验设计和分析目的来决定。对于基因表达谱芯片数据的分析,可以采用GO&KEGG和GSEA等方法,以探究差异表达基因的生物学功能和通路。以下是一些参考建议:如果你感兴趣的是差异表达基因的生物学功能和通路,那么GO&KEGG分析可以是一个好的选择。你可以使用一些生物信息学工具,如DAVID、Enrichr等,对差异表达基因进行功能注释和通路富集分析。这
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问
Uuo模型的假手术组是在假手术后1天处死还是第14天?
土井挞克树
Uuo模型的假手术组是在假手术后14天和28天处死
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问
请问眼眶取血后出现鼻孔出血,老鼠误吸是什致死,是手法不对?位置扎太深了吗?
loveliufudan
鼻孔出血可能是因为手法不当或者位置扎得太深引起的。在进行眼眶取血时,应该选择合适的针头和注射器,并仔细选择取血位置。取血时需要使用适当的力度,以避免损伤周围的组织,同时确保可以顺利获取所需的血液样品。如果手法不当,针头过深穿透鼻腔后可能会刺激到鼻黏膜,导致鼻孔出血。此外,取血时应该避免扭动针头,以免造成血管和组织的损伤。误吸也可能是导致小鼠死亡的原因之一。在进行任何类型的小鼠操作时,都应该使用正确
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问
小鼠下丘脑RNA提取可以做吗?
loveliufudan
可以的。下丘脑是大脑的一部分,其中包含许多重要的神经元和神经递质,因此从小鼠下丘脑中提取RNA可以用于分析基因表达和信号通路的研究。RNA提取的方法可以根据实验室的具体需求而定,例如使用商业RNA提取试剂盒或自制试剂盒,根据实验室的设备和技术水平选择合适的方法。需要注意的是,在取样、提取和储存RNA过程中,应避免RNA降解和污染,以保证实验的准确性和可靠性。
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问
做重组蛋白,构建质粒(无his-tag)
sswei
通过设计引物,添加his-tag,克隆到质粒中去。
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问
DnsCl衍生时,连接伯胺的C原子上需要有H吗
loveliufudan
在进行DNS-Cl(2,4-二硝基氯苯)的化学反应时,连接到伯胺的C原子上通常需要有氢。因为DNS-Cl与氨基(-NH2)反应时,会发生亲核取代反应,生成DNS-NH-C的结构。在这个反应中,DNS-Cl的NO2基将取代C原子上的氢,形成DNS-NH-C结构。至于连接在C=N键上的C的伯胺是否可以被衍生,这取决于衍生试剂的反应性和它们对于C=N键的亲核或电子亲和性。一般来说,C=N键上的碳原子较为
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问
如何进行抗原表位筛选?
loveliufudan
对于筛选T/B细胞抗原表位的问题,以下是一些常用的软件和方法:IEDB(The Immune Epitope Database):IEDB是一个公共数据库,收集了人类和其他物种中已知的T/B细胞表位信息。可以使用该数据库中的工具进行序列分析和抗原表位预测。可以使用IEDB中的线性和非线性预测工具,例如BepiPred、NetMHC、NetCTL等。DiscoTope:DiscoTope是一个基于机
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问
载体双酶切胶回收后能在-20摄氏度保存多久呢
loveliufudan
双酶切胶回收后的DNA样品可以在-20摄氏度长期保存,通常可保存6个月至1年。存储时需要注意以下几点:使用无菌的冷冻保存管保存样品,并确保样品在保存管中完全干燥。在保存之前,检查样品的纯度和浓度,以确保其符合您的实验要求。避免反复冻融样品,因为这会降低DNA的质量和纯度。在保存过程中定期检查样品的质量和纯度,以确保样品适用于后续实验。需要注意的是,对于一些敏感的DNA样品,如RNA或者低浓度的DN
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问
Gateway反应的引物是怎么设计的?需要加上attB这个没看懂
loveliufudan
在Gateway克隆技术中,attB位点是重要的克隆元件,它位于载体和DNA片段之间,是介导DNA片段定向插入载体的关键元素。因此,在进行Gateway反应时,需要使用含有attB位点的引物,以引导目标DNA的定向克隆。通常情况下,引物设计可以遵循以下步骤:根据目标DNA片段的序列,选择包含attB位点序列的引物。这些引物通常被称为Gateway入口引物或attB引物。设计引物时需要考虑attB位
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问
WB条带中间好像有一个大印子是什么原因啊
loveliufudan
这可能是由于以下原因之一:过度曝光:当暴露时间过长时,较暗的条带会变得更暗,并且可以出现一个大的印子。这通常可以通过优化暴露时间来避免。过量的蛋白质加载:如果在Western blot中加载了过多的蛋白质,可能会导致印子变大或模糊不清。尝试减少样品中的蛋白质浓度或者优化Western blot实验的条件。不均匀的转印:如果转印膜的转印效率不均匀,则可能会出现大的印子。确保均匀地转印蛋白质样品可以避
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问
pAT03-Apr是什么特性?重组酶表达质粒
loveliufudan
pAT03-Apr是一种重组质粒,可用于大肠杆菌中表达重组酶。该质粒包含多个重要元件,包括:起始子和终止子:用于启动和终止转录过程。多克隆位点:用于方便地插入目标基因的DNA序列。T7启动子:用于诱导T7 RNA聚合酶的表达。带有6个组氨酸标签(6xHis-tag)的启动子和终止子:用于方便地将重组蛋白纯化。胰凝乳蛋白酶切位点:用于释放表达的重组蛋白。因此,pAT03-Apr质粒可以方便地克隆目标
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问
请问长链饱和脂肪酸给小鼠灌胃用什么溶剂溶解
loveliufudan
长链饱和脂肪酸可以选择在灌胃过程中与溶剂混合,以提高其溶解度和生物利用率。一般可以使用一些有机溶剂来溶解长链饱和脂肪酸,如氯仿、甲醇、乙醇、二甲亚砜等。在选择溶剂时,需要注意该溶剂对小鼠的毒性和耐受性。以氯仿为例,可以使用以下步骤将长链饱和脂肪酸与溶剂混合:将适量的氯仿加入容器中,并在磁力搅拌器上搅拌。逐渐加入所需的长链饱和脂肪酸,并不断搅拌,直到完全溶解。将混合溶液放置一段时间,直至完全均匀。使
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问
H&E染色的图片该怎么看?
sswei
细胞损伤分为可逆性改变与不可逆性改变两类。1、可逆性改变包括:细胞水肿、脂肪变、玻璃样变、黏液样变、病理性色素沉着;2、不可逆性改变即坏死,其基本病变为:核固缩、核碎裂、核溶解。据此,该图不能完全判断为细胞损伤,理解错误。
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大鼠盆神经
loveliufudan
在解剖上,大鼠盆腔神经位于大腿内侧和尾部附近的盆腔区域。具体来说,可以在大腿内侧股沟的上方或者在尾部底部找到盆腔神经。
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求助关于Jurkat细胞的问题。
sswei
Jurkat细胞 如果用慢病毒做成car-t,不具有永生能力。如果用慢病毒转染,转染前可使用CD3/CD28抗体进行激活。慢病毒转染后,可以对肿瘤细胞进行杀伤,CD4比CD8的杀伤作用差些。
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提取甘油菌质粒的时候,用错了培养基有何影响
loveliufudan
使用LB培养基提取甘油菌质粒相对于使用2xYT培养基,可能会对质粒数量和质量产生一定的影响,但具体影响的大小会受到多种因素的影响,如培养时间、培养温度、细胞密度等等。一般来说,2xYT培养基比LB培养基营养更丰富,支持细胞生长和代谢的能力更强,因此使用2xYT培养基培养甘油菌会产生更多的细胞和质粒,且质粒更加稳定,得到的质量也相对更高。而使用LB培养基可能会导致细胞生长缓慢,产量较低,质粒含量和质
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GPCR抗体药物的blocking实验
sswei
流式细胞术检测比放射性元素检查的灵敏度差,准确性低。
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A549 划痕实验
墨幽染染
划痕实验很重要的一个因素就是铺板量,不同细胞的大小不一样,铺板量不一样。就像786-O细胞比较大,96孔板一般铺2-3万细胞/每孔,第二天细胞融合度达到90%以上;而RKO细胞比较小,96孔板一般需要铺7-8万/每孔,第二天细胞融合度差不多达到90%左右。所以具体要根据细胞大小适当调整,细胞划痕铺板密度一般为70-90%之间。密度过低,增殖因素可能会影响迁移能力,反之,对于细胞状态会有影响,以至于
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卡方检验结果提示是常量,无法计算统计量,这种应该如何描述卡方值和P值?
sswei
对于这种情况,一是改变变量,如非双改其它或加大样本量,二是更改统计方法,改Fisher精确概率法。
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问
QTL在染色体上的定位图
sswei
按照图例,外区间在1.3一18.6,内区间在7.9一12.3。
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