• 我要登录|
  • 免费注册
    |
  • 我的丁香通
    • 企业机构:
    • 成为企业机构
    • 个人用户:
    • 个人中心
  • 移动端
    移动端
丁香通 logo丁香实验_LOGO
搜实验

    大家都在搜

      大家都在搜

        0 人通过求购买到了急需的产品
        免费发布求购
        发布求购

        生信ssGSEA免疫浸润分析

        相关实验:免疫组织化染色

        user-title

        大王叫我来巡山安

        请问大家,1.ssGSEA结果有负值,将结果进行标准化后进行可视化分析,对于结果全是0或者1的细胞该如何处理,直接删除?

        2.目的基因与免疫细胞的相关性分析时,是采用标准化前的ssGSEA结果还是标准化后的?如果是标准化后的结果,数值全是0或1的细胞无法计算,直接删除吗?

        wx-share
        分享

        3 个回答

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        是指0或1再进行定量分析的时候可以删除,定性的时候不需要删除

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        1.对于SSGSEA结果中出现的全是0或1的细胞,可以考虑将其从可视化结果中删除。另外,也可以对SSGSEA得分进行调整或变换,以便更好地显示出不同细胞之间的差异。

        2.在目的基因与免疫细胞的相关性分析中,应该使用标准化后的SSGSEA结果。对于数值全是0或1的细胞,可以考虑将其删除,或者进行其他的数值调整,以便更好地显示出相关性。不过在删除细胞时,需要注意其对结果的影响,以避免对结果的偏差。

        user-title

        Dr_劉医生

        有帮助

        ssGSEA 分析结果为 0 或 1 的细胞可以被视为没有表达该基因集,因此可以将其从数据集中删除。但是,这种方法可能会导致数据集的偏差,因此建议您在删除之前仔细考虑。另外,您也可以将这些细胞视为低表达该基因集的细胞,然后将其保留在数据集中。

        ad image
        提问
        扫一扫
        丁香实验小程序二维码
        实验小助手
        丁香实验公众号二维码
        扫码领资料
        反馈
        TOP
        打开小程序