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        ZDOCK蛋白蛋白对接结果分析,Pymol

        相关实验:血红蛋白电泳

        user-title

        町柠

        ZDOCK蛋白蛋白对接结果分析,用Pymol打开,不知道为什么是这样,有没有大佬,可以帮忙解答一下问题出在哪里图片描述

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        4 个回答

        user-title

        飞鸟胖胖

        有帮助

        可能因为你的两个蛋白的chain用了相同命名,如果一个是chain A,另一个就改成chain B

        user-title

        奥利给与给力嗷

        有帮助

        解决了么,朋友,我遇到一模一样的问题,用zdock导入两个本地pdb文件,选结合分数最高的,打开就是一模一样

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        可能有以下几种原因:

        问题出在Pymol软件本身。如果Pymol软件没有正确安装或者版本过低,可能会导致图像不太正常。解决方法是更新或重新安装Pymol软件。

        文件格式不兼容。Pymol支持多种文件格式,但并不是所有格式都可以完全支持,可能会出现图像不太正常的情况。解决方法是将文件转换为Pymol支持的格式,例如PDB格式。

        结果文件本身存在问题。ZDOCK生成的结果文件可能存在一些错误或者不完整的信息,例如缺失原子坐标、残基信息不完整等。这可能会导致Pymol无法正确显示结果。解决方法是检查结果文件是否存在问题,并尝试重新生成结果文件或者使用其他对接软件进行分析。

        显示参数设置问题。Pymol的图像显示可以通过设置不同的参数进行调整,例如颜色、透明度、视角等。如果显示参数设置不当,可能会导致图像不太正常。解决方法是检查显示参数设置是否合适,并进行适当的调整。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        你没有选择双蛋白对接啊,这是个杂乱的图,检查蛋白没分解的情况下,重新做对接图

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