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        蛋白质翻译后修饰发生的亚细胞定位是否可通过修饰位点预测。

        相关实验:蛋白质的分离纯化

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        dxy_e5j36ca8

        如题,今天看到一篇文献,提到AMPK可以磷酸化PDL1的ser195。作者提到由于ser195位于PDL1的胞外结构域,因此磷酸化应该发生在内质网或者高尔基体腔。请问各位老师能否指导一下我为什么翻译后修饰的位点能判断修饰发生位置呢?那如果修饰位点在胞内区的话能提示发生修饰的细胞器吗?

        谢谢各位老师!

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        4 个回答

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        huarenqiang5

        有帮助

        Sionalp 可以对革兰氏阳性菌,董兰氏阴性菊和直核生物的蛋白质序列进行信号肽分析。预测采用了隐马尔可夫和人工神经网络技术的融合。其训练数据是从 SwisProt 第 29 版中挑选来的,分为真核生物,革兰氏阳性菌,革兰氏阴性菌三组。

        除了 SignalP 可以对蛋白质序列进行信号肽分析外,还有诸如 Phobius、Philius、Spoctopus、Signal-3L、MEMSAT-SVM、LipoPSecretomeP、TatP等均可以预测和分析蛋白质信号肽。

        NetOGlyc和NetNGlyc

        分别分析 O-连接糖链和 N-连接糖链的连接位点,判断待分析蛋白是否可能发生糖基化。


        蛋白质氨基酸位点特异修饰分析

        NetAcet 用于预测和分析蛋白质乙酰化位点。

        NetPhos 用于预测和分析蛋白质磷酸化位点。

        NMT 用于预测和分析蛋白质肉豆蔻酰化位点。

        PACMAN 用于预测和分析蛋白质甲基化位点。

        PrePS 用于预测和分析蛋白质异戊二烯化位点。

        SUMOplot 用于预测和分析蛋白质 SUMO 化位点。

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        土井挞克树

        有帮助

        在胞内并不能反应是修饰在细胞器,可能是细胞内膜

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        loveliufudan

        有帮助

        根据您提供的信息,磷酸化位点ser195位于PDL1的胞外结构域。在这种情况下,磷酸化事件通常发生在内质网或高尔基体腔中,因为磷酸化酶通常无法进入细胞外区域。因此,您可以根据磷酸化位点的位置来推断磷酸化发生的位置。

        对于在胞内区的修饰位点,通常无法准确确定修饰发生的细胞器。因为很多细胞器中都存在修饰酶,如蛋白激酶和磷酸酶,这些酶可以在细胞内不同的位置发挥作用。此外,修饰酶也可能存在转运和定位等复杂的调节机制,这些机制也会影响修饰的位置。因此,要确定修饰发生的细胞器,通常需要通过其他实验方法或技术来进一步验证。

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        此用户已注销

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        蛋白质翻译后修饰发生的亚细胞定位是可通过修饰位点预测

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