RNA干扰后，荧光强度可以直接表征转染效率吗

可以大概看下转染效率，但是推荐更具有信服力的检测方法：

1. PCR检测mRNA水平的沉默效果，一般推荐在48h到72h检测，48h比较理想，需要具体的摸索时间。PCR检测沉默效果时，在设计引物的时候最好是将引物设计在沉默位点的两侧，而不是在同侧。这个是由于RNAi引起的沉默是先进行mRNA的切割之后造成mRNA的降解。另外，即使设计在两侧，也不要离沉默位点太远的地方，不然可能会造成对沉默效果的低估。

2. WB检测蛋白蛋白水平的检测，一般在转染后48h到92h间提蛋白检测蛋白水平的沉默效果，检测时间跟你的蛋白的半衰期有关系，具体的时间需要设计时间梯度，一般理想的是在72h最明显。

可以但不推荐。以荧光信号的强弱判断 siRNA 转染效果并不准确，最好采用荧光定量 PCR 来判断转染效果。因为 siRNA 转染成功最客观的标志就是基因表达量的减少，另外，细胞本身会吸附荧光染料，会出现非特异性吸附。