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        PCR跑胶目的片段大小不对

        相关实验:实时荧光定量 PCR(realtime PCR)

        user-title

        鼬獾

        引物设计的目的片段<1000kb,然后跑胶结果跑出来的条带为2000kb,以上问题请大佬解答

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        3 个回答

        user-title

        z流沙z

        有帮助

        一般就是非特异性的条带,设计完引物后应在ncbi上面blast一下,确保引物的特异性

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        可能是存在多聚问题,所以会出现大质量条带。

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        这种情况可能有以下几种可能性:

        引物设计出现了问题。可能引物序列有误,与目的序列不匹配,导致扩增出了不完整的目的片段以及其他未知的片段。建议重新设计引物并优化PCR条件。

        模板DNA质量不好。可能模板DNA存在降解、污染或稀释不均等问题,导致PCR反应出现非特异性扩增。建议检查模板DNA的质量,如使用质量更好的DNA提取方法、增加模板DNA的浓度或减少模板DNA的用量。

        PCR反应条件不合适。PCR反应条件中包括温度、时间、引物浓度等多个参数,其中任何一个参数的改变都可能导致扩增出现问题。可能需要对PCR反应条件进行优化,如调整温度、时间、引物浓度等参数。

        扩增产物受到外部污染。扩增反应过程中可能会受到外部环境污染,如氧气、细菌、其他DNA片段等,导致扩增出现问题。建议在PCR反应前进行充分的消毒,使用高质量的试剂和设备,并在实验室中保持清洁和卫生。

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