设计qPCR中circRNA对应线性转录本的引物？

可以上circBase数据库设计qpcr中的线性引物

先去数据库找序列，图1；再用blast设计引物，图2.

引物设计

1、circRNA信息查找

2、circRNA引物设计

circRNA的引物设计有以下两种方法：

a、 背靠背引物

通常获取到的序列为从剪切位点（backsplice）处打开后的线性序列，因此，在设计引物前应先进行序列位置的变换，截取3端100-200bp长度的序列置于5端头部，形成了一个新的序列，新序列的连接处即为剪切位点处。circRNA引物设计的方法按照常规PCR引物设计的原理，跨环化位点设计，上下游引物分别在环化位点的左右两边，即最终的扩增产物必须包含环化位点，背靠背的引物设计原理图

b、跨环化位点引物

设计跨环化位点的引物同样按照常规PCR引物设计的原理，但是，这种方法要求上游引物或者下游引物要设计在环化位点处。