设计非编码RNA的引物应该注意什么呢？

没有什么特别需要注意的，和编码RNA方法一样。

选好分类，是circleRNA还是miRNA,引物设计的步骤都是一样，用NCBI和Premier；但要注意几点：

1. 需跨越至少一个外显子连接

2. 不要忘记选对“物种”

首先你的问题都比较笼统，搞清楚是长链非编码RNA还是微小RNA。如果是lncRNA的话，有序列的话就和mRNA引物设计没啥区别，如果是miRNA的话，直接在NCBI里面查找。设计过程肯定是要考虑GC%比例，退火温度