我想问下有人做过RNA核质分离实验吗？

两个基因做内参都没有固定的标准。05年前，做miR用的是gapdh,后来只是发现用U6或是5S效果更好而已。你直接给出原始的gapdh的Ct，表明Gapdh合适作为内参基因就行了。

我们也遇到过类似情况。我们觉得可能是由于实验中操作或者其他原因导致核泄漏了，细胞核内的物质到了胞质中。

说白了，就是你想找个核内的内参，U6一般是可以，要不是你试试histone H3。